147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0634 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0634  flagellar protein FliS  100 
 
 
152 aa  315  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323334 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4093  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  34.19 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  32.06 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  35.54 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  35.04 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  34.96 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  34.96 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  33.87 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  37.4 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  33.87 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  35.04 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  36.04 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  37.84 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  30.82 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  34.17 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  35.78 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  34.17 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  36.36 
 
 
136 aa  67  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0445  flagellar protein FliS  36.21 
 
 
140 aa  67  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1340  flagellar protein FliS  35.71 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0667  flagellar protein FliS  35.34 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  32.71 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2120  flagellar protein FliS  34.82 
 
 
301 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.472713  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1652  flagellar protein FliS  33.9 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3036  flagellar protein FliS  30.99 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1119  flagellar protein FliS  30.67 
 
 
286 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.8663  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  27.91 
 
 
137 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  31.25 
 
 
136 aa  61.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  27.13 
 
 
137 aa  61.2  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1356  flagellar protein FliS  30.28 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.260151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0106  flagellar protein FliS  32.09 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0288996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3014  flagellar protein FliS  29.84 
 
 
133 aa  60.5  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.896299  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  28.15 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  35.45 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0764  flagellar protein FliS  31.36 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0995  flagellar protein FliS  31.62 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0465  flagellar protein FliS  35.59 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000775851  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  32.14 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1784  flagellar protein FliS  35.04 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  30.36 
 
 
135 aa  57.4  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0827  flagellar protein FliS  28.24 
 
 
154 aa  57  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4375  flagellar protein FliS  36.59 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.837168 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0232  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  30.95 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000726732  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2217  flagellar protein FliS  33.93 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0781  flagellar protein FliS  29.69 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  31.67 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1446  flagellar protein FliS  29.37 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.431309  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1530  flagellar protein FliS  30.77 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  30.77 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  30.77 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2831  flagellar protein FliS  31.09 
 
 
126 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161705  normal  0.0204753 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  28.57 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  29.66 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  28.57 
 
 
136 aa  53.9  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  31.48 
 
 
135 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  31.48 
 
 
135 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3585  flagellar protein FliS  28.21 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  31.48 
 
 
135 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  31.48 
 
 
135 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  31.48 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2364  flagellar protein FliS  28.04 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0187  flagellar protein FliS  32.71 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.158957  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  27.27 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  34.26 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0560  flagellar protein FliS  33.63 
 
 
145 aa  51.6  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
134 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0177  flagellar protein FliS  24.77 
 
 
128 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.711098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0229  flagellar protein FliS  24.77 
 
 
128 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2415  flagellar protein FliS  30 
 
 
129 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1492  flagellar protein FliS  32.77 
 
 
131 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0313  flagellar protein FliS  28.57 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2911  flagellar protein FliS  36.56 
 
 
275 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.132531 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  30.25 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3200  flagellar protein FliS  27.42 
 
 
133 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  30.56 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  30.83 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  28.81 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1055  flagellar protein FliS  28.57 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  29.63 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2700  flagellar protein FliS  28.57 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.11516 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0529  flagellar protein FliS  29.81 
 
 
248 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  31.9 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  28.12 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3954  flagellar protein FliS  35.94 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0846761  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3453  flagellar protein FliS  35.94 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04955  flagellin-specific chaperone FliS  26.42 
 
 
128 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2025  flagellar protein FliS  28.57 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2160  flagellar protein FliS  28.57 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1714  flagellar protein FliS  28.57 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.16255 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3356  flagellar protein FliS  30.93 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.385304  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0278  lateral flagellar chaperone protein LafC  30.93 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00844444  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1256  flagellar protein FliS  28.57 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.25928 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1721  flagellar protein FliS  28.57 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.649676  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  29.71 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  24.03 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  26.96 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  22.88 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>