35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0115 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0115  flagellar protein FliS  100 
 
 		 125 aa  243  8e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.906017  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0836  flagellar protein FliS  37.82 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2352  flagellar protein FliS  36.36 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1628  flagellar protein FliS  38.26 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0983  flagellar protein FliS  36.94 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31270  flagellar biosynthetic protein FliS  37.7 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226218  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2996  flagellar protein FliS  32.26 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0764  flagellar protein FliS  30.25 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0119  flagellar protein FliS  31.71 
 
 		 146 aa  50.1  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  30.4 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  36.52 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  31.2 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  30.95 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1496  flagellar protein FliS  25.64 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0407266  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  25.41 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2033  flagellar protein FliS  33.06 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.992226 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  28.21 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0827  flagellar protein FliS  34.15 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  29.31 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3084  flagellar protein FliS  34.21 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.933377  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0620  flagellar protein FliS  29.46 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  29.6 
 
 		 136 aa  43.5  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2217  flagellar protein FliS  30 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  28.91 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  27.34 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  27.34 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  27.34 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  27.34 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  27.34 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3200  flagellar protein FliS  27.52 
 
 		 133 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  29.06 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  26.32 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  30.25 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2415  flagellar protein FliS  26.09 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0232  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  26.32 
 
 		 168 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000726732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>