More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0532 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0532  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  100 
 
 
509 aa  996    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7679  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.65 
 
 
526 aa  505  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2683  NADH dehydrogenase subunit M  54.14 
 
 
521 aa  501  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4406  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  53.35 
 
 
516 aa  498  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0596  NADH dehydrogenase (quinone)  51.56 
 
 
509 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.815561  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13178  NADH dehydrogenase subunit M  46.76 
 
 
553 aa  479  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.146902  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0293  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  53.07 
 
 
502 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1873  NADH dehydrogenase subunit M  49.43 
 
 
526 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1589  NADH dehydrogenase subunit M  50.87 
 
 
518 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1565  NADH dehydrogenase subunit M  50.87 
 
 
517 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4451  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.83 
 
 
510 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6082  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.14 
 
 
519 aa  462  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1535  NADH dehydrogenase subunit M  50.58 
 
 
519 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.486598  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4053  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.02 
 
 
510 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1286  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain M  47.2 
 
 
509 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.763724  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0279  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.8 
 
 
507 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.716259  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2704  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  51.56 
 
 
514 aa  442  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4493  NADH dehydrogenase subunit M  50.21 
 
 
511 aa  444  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.803352  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0390  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.53 
 
 
535 aa  441  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5065  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  51.35 
 
 
555 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6670  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.8 
 
 
520 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0551  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.07 
 
 
507 aa  429  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.253401  normal  0.781277 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3217  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.11 
 
 
507 aa  424  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141162  normal  0.0503138 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0550  NADH dehydrogenase subunit M  45.91 
 
 
562 aa  424  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.291589 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0481  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.78 
 
 
527 aa  409  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4546  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.58 
 
 
545 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.814127  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07500  NADH dehydrogenase subunit M  47.02 
 
 
567 aa  392  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0225564 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3180  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.66 
 
 
491 aa  376  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.25 
 
 
525 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03280  NADH dehydrogenase subunit M  41.39 
 
 
534 aa  364  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.992511 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  37 
 
 
522 aa  363  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0986  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.44 
 
 
588 aa  363  4e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.72 
 
 
519 aa  363  4e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3126  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.12 
 
 
535 aa  349  7e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.78 
 
 
535 aa  347  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.18 
 
 
497 aa  343  5.999999999999999e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.33 
 
 
535 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  38.88 
 
 
501 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  36.64 
 
 
502 aa  322  8e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4138  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.21 
 
 
506 aa  319  7e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.68162  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  37.47 
 
 
496 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1304  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.64 
 
 
521 aa  316  6e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278041  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0375  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.04 
 
 
512 aa  315  9e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  35.63 
 
 
502 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  35.63 
 
 
502 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  36.66 
 
 
505 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  37.27 
 
 
496 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  36.38 
 
 
512 aa  314  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  37.15 
 
 
496 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  37.27 
 
 
496 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  37.27 
 
 
496 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  37.27 
 
 
496 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  36.87 
 
 
496 aa  312  9e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.7 
 
 
503 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  36.87 
 
 
496 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3214  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.56 
 
 
514 aa  310  5e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  36.67 
 
 
496 aa  309  8e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  36.67 
 
 
496 aa  309  8e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  36.67 
 
 
496 aa  309  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  36.67 
 
 
496 aa  309  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  36.67 
 
 
496 aa  309  8e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  36.67 
 
 
496 aa  309  8e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  36.67 
 
 
496 aa  309  8e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  36.1 
 
 
503 aa  309  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1875  NADH dehydrogenase subunit M  36.57 
 
 
502 aa  309  9e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123353  normal  0.162516 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1754  NADH dehydrogenase subunit M  36.35 
 
 
493 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.494513  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0720  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.55 
 
 
504 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.362005  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  36.31 
 
 
503 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.47 
 
 
504 aa  307  3e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.83 
 
 
542 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  35.85 
 
 
505 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.83 
 
 
542 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.48 
 
 
507 aa  307  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1367  NADH dehydrogenase subunit M  36.23 
 
 
504 aa  306  5.0000000000000004e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73718  normal  0.0186615 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3202  NADH dehydrogenase subunit M  36.35 
 
 
496 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422188  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2820  NADH dehydrogenase subunit M  35.89 
 
 
494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.4 
 
 
585 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341288  normal  0.991992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  36.9 
 
 
503 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.34 
 
 
506 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2819  NADH dehydrogenase subunit M  37.25 
 
 
502 aa  304  3.0000000000000004e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.63 
 
 
542 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1103  NADH dehydrogenase subunit M  37.53 
 
 
495 aa  303  5.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135594  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  35.44 
 
 
505 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.54 
 
 
517 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2049  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.73 
 
 
495 aa  301  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.68 
 
 
503 aa  300  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1997  NADH dehydrogenase subunit M  35.38 
 
 
497 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.425538  normal  0.176809 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2208  NADH dehydrogenase subunit M  35.96 
 
 
502 aa  300  4e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1355  NADH dehydrogenase subunit M  35.34 
 
 
496 aa  300  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000992227  normal  0.0345123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1037  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.97 
 
 
525 aa  300  5e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.260264  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2232  NADH dehydrogenase subunit M  35.33 
 
 
513 aa  300  5e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4549  NADH dehydrogenase subunit M  35.76 
 
 
502 aa  300  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.177769 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  35.73 
 
 
514 aa  300  6e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0790  NADH dehydrogenase subunit M  34.34 
 
 
489 aa  299  8e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0146664  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0759  NADH dehydrogenase subunit M  37.16 
 
 
521 aa  299  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2288  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.58 
 
 
516 aa  297  3e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3625  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.68 
 
 
491 aa  296  7e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.67 
 
 
508 aa  296  7e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1202  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.09 
 
 
527 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1073  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.09 
 
 
527 aa  295  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.397792  normal  0.614174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>