More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1355 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  88.1 
 
 
496 aa  885    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3498  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  71.78 
 
 
491 aa  694    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0833  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  69.2 
 
 
488 aa  676    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  87.5 
 
 
496 aa  877    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  87.5 
 
 
496 aa  877    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2050  NADH dehydrogenase subunit M  77 
 
 
488 aa  770    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232549  normal  0.0955875 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  63.87 
 
 
504 aa  639    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2202  NADH dehydrogenase subunit M  77.62 
 
 
488 aa  757    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  0.474832 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  87.5 
 
 
496 aa  877    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1039  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  70.84 
 
 
488 aa  691    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  87.5 
 
 
496 aa  880    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0961  NADH dehydrogenase subunit M  70.99 
 
 
494 aa  696    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0280946  normal  0.49186 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  87.7 
 
 
496 aa  882    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0973  NADH dehydrogenase subunit M  76.59 
 
 
488 aa  752    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0836349  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1355  NADH dehydrogenase subunit M  100 
 
 
496 aa  987    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000992227  normal  0.0345123 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1154  NADH dehydrogenase subunit M  68.42 
 
 
494 aa  663    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.408177  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  87.5 
 
 
496 aa  877    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  87.5 
 
 
496 aa  877    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  87.9 
 
 
496 aa  884    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  87.5 
 
 
496 aa  877    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1275  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  72.34 
 
 
491 aa  686    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.512446  normal  0.301879 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0884  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  71.11 
 
 
491 aa  690    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1415  NADH dehydrogenase (quinone)  74.18 
 
 
491 aa  722    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.508375  normal  0.0193211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1436  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  70.49 
 
 
491 aa  679    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.244005  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5168  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  72.69 
 
 
491 aa  686    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  87.5 
 
 
496 aa  877    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1103  NADH dehydrogenase subunit M  68.23 
 
 
495 aa  656    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135594  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2801  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  70.08 
 
 
491 aa  666    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0834945  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  87.1 
 
 
496 aa  874    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1754  NADH dehydrogenase subunit M  72.62 
 
 
493 aa  695    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.494513  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1997  NADH dehydrogenase subunit M  89.54 
 
 
497 aa  885    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.425538  normal  0.176809 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1505  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  70.7 
 
 
491 aa  704    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.185001  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2049  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  67.55 
 
 
495 aa  674    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3244  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  70.49 
 
 
491 aa  649    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0995576  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3202  NADH dehydrogenase subunit M  96.98 
 
 
496 aa  946    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422188  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1879  NADH dehydrogenase subunit M  77 
 
 
488 aa  755    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493129  normal  0.822984 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0939  NADH dehydrogenase subunit M  78.03 
 
 
488 aa  764    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.573933  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  87.7 
 
 
496 aa  882    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1513  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  73.72 
 
 
490 aa  698    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366776 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0969  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  70.9 
 
 
491 aa  697    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667144  normal  0.19276 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  87.7 
 
 
496 aa  882    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  87.7 
 
 
496 aa  882    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0720  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  62.48 
 
 
504 aa  634  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.362005  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2618  NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  62.96 
 
 
494 aa  628  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  62.96 
 
 
494 aa  628  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0829  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  61.11 
 
 
504 aa  615  1e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2819  NADH dehydrogenase subunit M  61.51 
 
 
502 aa  608  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1958  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  62.35 
 
 
501 aa  609  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0280811 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2553  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  61.8 
 
 
504 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.668765  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3973  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  58.22 
 
 
511 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948651  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1952  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  59.13 
 
 
507 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0417902  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01299  NADH dehydrogenase subunit M  61.94 
 
 
491 aa  597  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648189  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  60.12 
 
 
518 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.409651  normal  0.0189582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5377  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  57.81 
 
 
509 aa  590  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.656347 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1638  proton-translocating NADH-quinoneoxidoreductase, chain M  59.59 
 
 
518 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.108855 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6005  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  57.4 
 
 
509 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2072  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  57.4 
 
 
509 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951584  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2091  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  57.4 
 
 
509 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242207  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2108  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  57.2 
 
 
509 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434058  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1978  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  57 
 
 
509 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0252  NADH dehydrogenase subunit M  60.12 
 
 
501 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0281  NADH dehydrogenase subunit M  59.92 
 
 
501 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.540456  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2824  NADH-quinone oxidoreductase chain M  57.03 
 
 
501 aa  563  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2693  NADH-quinone oxidoreductase chain M  57.03 
 
 
501 aa  563  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1208  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  55.58 
 
 
509 aa  555  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0257015  normal  0.194007 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  54.67 
 
 
501 aa  537  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  56.54 
 
 
505 aa  533  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0558  NADH-quinone oxidoreductase chain M  54.4 
 
 
506 aa  523  1e-147  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1605  NADH dehydrogenase (ubiquinone), M subunit  54.4 
 
 
506 aa  524  1e-147  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  52.77 
 
 
510 aa  523  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  53.5 
 
 
497 aa  522  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4549  NADH dehydrogenase subunit M  53.48 
 
 
502 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.177769 
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  52.66 
 
 
502 aa  515  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  52.87 
 
 
502 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  54.19 
 
 
512 aa  515  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  51.64 
 
 
503 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1875  NADH dehydrogenase subunit M  52.56 
 
 
502 aa  514  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123353  normal  0.162516 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1328  NADH dehydrogenase subunit M  53.02 
 
 
515 aa  514  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0365587 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  52.46 
 
 
502 aa  513  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2416  NADH dehydrogenase subunit M  55.46 
 
 
506 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185861  hitchhiker  0.00201163 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  52.99 
 
 
505 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  53.4 
 
 
505 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3214  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  52.8 
 
 
514 aa  510  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1190  NADH dehydrogenase subunit M  51.72 
 
 
513 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.602239  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  51.01 
 
 
513 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  53.5 
 
 
503 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  52.83 
 
 
503 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2529  NADH dehydrogenase subunit M  51.72 
 
 
513 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0432269  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  52.37 
 
 
505 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2208  NADH dehydrogenase subunit M  52.97 
 
 
502 aa  502  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.72 
 
 
507 aa  498  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  52.92 
 
 
514 aa  500  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1367  NADH dehydrogenase subunit M  52.25 
 
 
504 aa  501  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73718  normal  0.0186615 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.91 
 
 
503 aa  495  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  52.87 
 
 
503 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4138  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  51.59 
 
 
506 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.68162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.95 
 
 
506 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0790  NADH dehydrogenase subunit M  50.31 
 
 
489 aa  488  1e-137  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0146664  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2232  NADH dehydrogenase subunit M  49.11 
 
 
513 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0759  NADH dehydrogenase subunit M  49.9 
 
 
521 aa  484  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>