More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1589 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1535  NADH dehydrogenase subunit M  97.88 
 
 
519 aa  965    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.486598  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4493  NADH dehydrogenase subunit M  80.51 
 
 
511 aa  783    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.803352  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13178  NADH dehydrogenase subunit M  69.1 
 
 
553 aa  725    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.146902  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1873  NADH dehydrogenase subunit M  80.92 
 
 
526 aa  816    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1565  NADH dehydrogenase subunit M  99.81 
 
 
517 aa  1007    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1589  NADH dehydrogenase subunit M  100 
 
 
518 aa  1012    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0390  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  70.32 
 
 
535 aa  652    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0596  NADH dehydrogenase (quinone)  59.19 
 
 
509 aa  569  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.815561  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7679  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  58.12 
 
 
526 aa  564  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2683  NADH dehydrogenase subunit M  54.72 
 
 
521 aa  532  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4406  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  55.89 
 
 
516 aa  528  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0293  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  57.59 
 
 
502 aa  514  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6082  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  53.83 
 
 
519 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3180  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  57.68 
 
 
491 aa  489  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4451  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  51.94 
 
 
510 aa  476  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5065  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.97 
 
 
555 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0279  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  52.91 
 
 
507 aa  471  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.716259  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6670  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.89 
 
 
520 aa  471  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1286  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain M  49.23 
 
 
509 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.763724  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4053  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  51.36 
 
 
510 aa  464  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0550  NADH dehydrogenase subunit M  50.09 
 
 
562 aa  462  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.291589 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0532  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.48 
 
 
509 aa  456  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4546  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.2 
 
 
545 aa  434  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.814127  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2704  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.67 
 
 
514 aa  418  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03280  NADH dehydrogenase subunit M  46.86 
 
 
534 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.992511 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0551  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.65 
 
 
507 aa  402  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.253401  normal  0.781277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0986  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.64 
 
 
588 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3217  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.63 
 
 
507 aa  386  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141162  normal  0.0503138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.12 
 
 
525 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0481  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.75 
 
 
527 aa  378  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07500  NADH dehydrogenase subunit M  45.81 
 
 
567 aa  375  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0225564 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.61 
 
 
519 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  39.64 
 
 
522 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.56 
 
 
535 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.97 
 
 
535 aa  352  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.56 
 
 
497 aa  349  5e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3126  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.64 
 
 
535 aa  349  6e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.92 
 
 
542 aa  343  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.92 
 
 
542 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.72 
 
 
542 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.12 
 
 
503 aa  336  5.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4549  NADH dehydrogenase subunit M  38.39 
 
 
502 aa  333  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.177769 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1248  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.92 
 
 
534 aa  333  6e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130648  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.15 
 
 
507 aa  333  6e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.63 
 
 
585 aa  333  6e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341288  normal  0.991992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  39.16 
 
 
505 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  40.21 
 
 
496 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  40.21 
 
 
496 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  40.21 
 
 
496 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  40.21 
 
 
496 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  40.21 
 
 
496 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  40.21 
 
 
496 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  40.21 
 
 
496 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2416  NADH dehydrogenase subunit M  40.42 
 
 
506 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185861  hitchhiker  0.00201163 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2232  NADH dehydrogenase subunit M  37.26 
 
 
513 aa  330  4e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1875  NADH dehydrogenase subunit M  40.4 
 
 
502 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123353  normal  0.162516 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  39.36 
 
 
505 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  40.21 
 
 
496 aa  329  8e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2208  NADH dehydrogenase subunit M  40.73 
 
 
502 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  38.55 
 
 
505 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.33 
 
 
517 aa  327  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.75 
 
 
495 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  37.82 
 
 
513 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  39.58 
 
 
496 aa  326  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  39.79 
 
 
496 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.67 
 
 
494 aa  325  9e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2618  NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  40.67 
 
 
494 aa  325  9e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  39.79 
 
 
496 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  39.79 
 
 
496 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  39.79 
 
 
496 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  39.79 
 
 
496 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  39.58 
 
 
496 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2529  NADH dehydrogenase subunit M  37.99 
 
 
513 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0432269  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3625  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.74 
 
 
491 aa  323  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2820  NADH dehydrogenase subunit M  36.84 
 
 
494 aa  323  7e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  37.67 
 
 
512 aa  322  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1190  NADH dehydrogenase subunit M  37.8 
 
 
513 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.602239  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1304  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.69 
 
 
521 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278041  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1328  NADH dehydrogenase subunit M  37.77 
 
 
515 aa  322  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0365587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  37.95 
 
 
503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01299  NADH dehydrogenase subunit M  36.31 
 
 
491 aa  320  5e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648189  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2819  NADH dehydrogenase subunit M  37.15 
 
 
502 aa  319  6e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1958  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.37 
 
 
501 aa  319  7.999999999999999e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0280811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4138  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.68 
 
 
506 aa  319  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.68162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  36.17 
 
 
501 aa  318  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4155  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.47 
 
 
534 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0166298 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1952  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.7 
 
 
507 aa  318  2e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0417902  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3202  NADH dehydrogenase subunit M  40.21 
 
 
496 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422188  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  37.13 
 
 
502 aa  317  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  37.53 
 
 
503 aa  317  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0759  NADH dehydrogenase subunit M  36.96 
 
 
521 aa  316  5e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  37.13 
 
 
502 aa  316  7e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1355  NADH dehydrogenase subunit M  39.59 
 
 
496 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000992227  normal  0.0345123 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.29 
 
 
503 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  36.93 
 
 
502 aa  313  4.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1997  NADH dehydrogenase subunit M  39.18 
 
 
497 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.425538  normal  0.176809 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0252  NADH dehydrogenase subunit M  37.55 
 
 
501 aa  311  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1154  NADH dehydrogenase subunit M  38.34 
 
 
494 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.408177  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1754  NADH dehydrogenase subunit M  38.78 
 
 
493 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.494513  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  37.74 
 
 
514 aa  310  4e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>