More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0293 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0596  NADH dehydrogenase (quinone)  76.62 
 
 
509 aa  752    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.815561  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0293  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  100 
 
 
502 aa  996    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4406  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  65.62 
 
 
516 aa  625  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2683  NADH dehydrogenase subunit M  63.48 
 
 
521 aa  626  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7679  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  66.74 
 
 
526 aa  612  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6082  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  60.64 
 
 
519 aa  562  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1873  NADH dehydrogenase subunit M  57.93 
 
 
526 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0279  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  59.2 
 
 
507 aa  556  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.716259  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4451  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  58.27 
 
 
510 aa  556  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1589  NADH dehydrogenase subunit M  57.59 
 
 
518 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1535  NADH dehydrogenase subunit M  57.09 
 
 
519 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.486598  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1565  NADH dehydrogenase subunit M  57.59 
 
 
517 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5065  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  62.06 
 
 
555 aa  554  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6670  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  56.97 
 
 
520 aa  551  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4053  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  58.27 
 
 
510 aa  546  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13178  NADH dehydrogenase subunit M  54.1 
 
 
553 aa  544  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.146902  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4493  NADH dehydrogenase subunit M  58.76 
 
 
511 aa  536  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.803352  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0550  NADH dehydrogenase subunit M  58.54 
 
 
562 aa  533  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.291589 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1286  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain M  56.11 
 
 
509 aa  526  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.763724  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4546  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  56.09 
 
 
545 aa  522  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.814127  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0390  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  57.17 
 
 
535 aa  520  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2704  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  55.64 
 
 
514 aa  506  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0532  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  53.07 
 
 
509 aa  488  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03280  NADH dehydrogenase subunit M  50.66 
 
 
534 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.992511 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0551  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  55.38 
 
 
507 aa  472  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.253401  normal  0.781277 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3217  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  53.75 
 
 
507 aa  472  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141162  normal  0.0503138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0986  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  55.06 
 
 
588 aa  442  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3180  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.38 
 
 
491 aa  439  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0481  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.78 
 
 
527 aa  434  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.64 
 
 
525 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  45.55 
 
 
522 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.12 
 
 
519 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.88 
 
 
497 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07500  NADH dehydrogenase subunit M  47.81 
 
 
567 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0225564 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.35 
 
 
535 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.99 
 
 
535 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3126  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.12 
 
 
535 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  42.83 
 
 
505 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.51 
 
 
503 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  42.42 
 
 
505 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  42.65 
 
 
502 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  41.82 
 
 
502 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.98 
 
 
542 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  42.42 
 
 
505 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1304  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.51 
 
 
521 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278041  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2232  NADH dehydrogenase subunit M  41.94 
 
 
513 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.78 
 
 
542 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1875  NADH dehydrogenase subunit M  42.79 
 
 
502 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123353  normal  0.162516 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.53 
 
 
503 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.57 
 
 
542 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  42.7 
 
 
514 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  41.61 
 
 
502 aa  371  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2820  NADH dehydrogenase subunit M  42.05 
 
 
494 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  40.53 
 
 
501 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4138  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.62 
 
 
506 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.68162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4549  NADH dehydrogenase subunit M  41.2 
 
 
502 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.177769 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.59 
 
 
507 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2208  NADH dehydrogenase subunit M  41.92 
 
 
502 aa  366  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0759  NADH dehydrogenase subunit M  40.48 
 
 
521 aa  368  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  43.24 
 
 
496 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.63 
 
 
517 aa  365  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  43.35 
 
 
496 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  42.94 
 
 
496 aa  364  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1248  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.7 
 
 
534 aa  363  4e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130648  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1103  NADH dehydrogenase subunit M  42.47 
 
 
495 aa  363  4e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135594  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3625  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.98 
 
 
491 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  42.6 
 
 
512 aa  363  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  43.24 
 
 
496 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  42.22 
 
 
503 aa  362  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  42.94 
 
 
496 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  42.94 
 
 
496 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  42.94 
 
 
496 aa  362  8e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  42.94 
 
 
496 aa  362  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2819  NADH dehydrogenase subunit M  40.57 
 
 
502 aa  362  8e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  42.94 
 
 
496 aa  362  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  40 
 
 
510 aa  362  8e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  42.94 
 
 
496 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  42.94 
 
 
496 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  42.94 
 
 
496 aa  362  9e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  42.94 
 
 
496 aa  362  9e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  42.94 
 
 
496 aa  362  9e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  43.15 
 
 
496 aa  362  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.21 
 
 
495 aa  362  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  42.37 
 
 
513 aa  361  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0876  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.79 
 
 
502 aa  361  2e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000201559  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.41 
 
 
506 aa  360  4e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1328  NADH dehydrogenase subunit M  40.76 
 
 
515 aa  360  4e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0365587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3202  NADH dehydrogenase subunit M  43.75 
 
 
496 aa  358  9e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422188  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1997  NADH dehydrogenase subunit M  41.67 
 
 
497 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.425538  normal  0.176809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2416  NADH dehydrogenase subunit M  41.79 
 
 
506 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185861  hitchhiker  0.00201163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2618  NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  41.58 
 
 
494 aa  356  5e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.58 
 
 
494 aa  356  5e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1297  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.39 
 
 
517 aa  356  5e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.310609  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.19 
 
 
508 aa  355  8.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1202  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.88 
 
 
527 aa  355  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01299  NADH dehydrogenase subunit M  38.84 
 
 
491 aa  355  1e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648189  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1355  NADH dehydrogenase subunit M  42.94 
 
 
496 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000992227  normal  0.0345123 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1073  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.88 
 
 
527 aa  355  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.397792  normal  0.614174 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2050  NADH dehydrogenase subunit M  41.6 
 
 
488 aa  353  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232549  normal  0.0955875 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1952  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.58 
 
 
507 aa  353  4e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0417902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>