More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3180 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3180  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  100 
 
 
491 aa  942    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1873  NADH dehydrogenase subunit M  57.78 
 
 
526 aa  544  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1535  NADH dehydrogenase subunit M  58.27 
 
 
519 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.486598  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1589  NADH dehydrogenase subunit M  58.07 
 
 
518 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1565  NADH dehydrogenase subunit M  58.22 
 
 
517 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4493  NADH dehydrogenase subunit M  57.49 
 
 
511 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.803352  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0390  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  59.12 
 
 
535 aa  509  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13178  NADH dehydrogenase subunit M  53.58 
 
 
553 aa  499  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.146902  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7679  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  51.76 
 
 
526 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0596  NADH dehydrogenase (quinone)  52 
 
 
509 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.815561  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6082  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50 
 
 
519 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2683  NADH dehydrogenase subunit M  49.21 
 
 
521 aa  434  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4406  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.79 
 
 
516 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0293  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  51.53 
 
 
502 aa  422  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5065  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.33 
 
 
555 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1286  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain M  46.51 
 
 
509 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.763724  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0532  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.2 
 
 
509 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4451  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.77 
 
 
510 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6670  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.6 
 
 
520 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4053  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.97 
 
 
510 aa  398  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0279  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.47 
 
 
507 aa  383  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.716259  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0550  NADH dehydrogenase subunit M  46.85 
 
 
562 aa  382  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.291589 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4546  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.53 
 
 
545 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.814127  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3217  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.24 
 
 
507 aa  382  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141162  normal  0.0503138 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0551  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.2 
 
 
507 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.253401  normal  0.781277 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2704  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.18 
 
 
514 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03280  NADH dehydrogenase subunit M  43.27 
 
 
534 aa  363  3e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.992511 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0986  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.43 
 
 
588 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.2 
 
 
519 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  38 
 
 
522 aa  348  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.69 
 
 
525 aa  345  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0481  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.25 
 
 
527 aa  344  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07500  NADH dehydrogenase subunit M  45.39 
 
 
567 aa  340  4e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0225564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.87 
 
 
497 aa  332  1e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.1 
 
 
535 aa  326  5e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.3 
 
 
535 aa  324  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  38.7 
 
 
505 aa  315  9e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.76 
 
 
507 aa  315  9e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.42 
 
 
503 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2416  NADH dehydrogenase subunit M  39.52 
 
 
506 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185861  hitchhiker  0.00201163 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  38.29 
 
 
505 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2208  NADH dehydrogenase subunit M  38.95 
 
 
502 aa  311  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1875  NADH dehydrogenase subunit M  38.51 
 
 
502 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123353  normal  0.162516 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3126  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.73 
 
 
535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  38.09 
 
 
505 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4138  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.17 
 
 
506 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.68162  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  37.74 
 
 
513 aa  306  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  36.52 
 
 
503 aa  306  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2529  NADH dehydrogenase subunit M  37.66 
 
 
513 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0432269  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1190  NADH dehydrogenase subunit M  37.66 
 
 
513 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.602239  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  35.17 
 
 
510 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  36.3 
 
 
503 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.74 
 
 
506 aa  302  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.58 
 
 
585 aa  302  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341288  normal  0.991992 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1367  NADH dehydrogenase subunit M  36.11 
 
 
504 aa  300  3e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73718  normal  0.0186615 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.99 
 
 
503 aa  300  6e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  37.01 
 
 
512 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4549  NADH dehydrogenase subunit M  36.27 
 
 
502 aa  297  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.177769 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1328  NADH dehydrogenase subunit M  37.2 
 
 
515 aa  296  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0365587 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.46 
 
 
542 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.71 
 
 
517 aa  295  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1304  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.7 
 
 
521 aa  294  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278041  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.26 
 
 
542 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2820  NADH dehydrogenase subunit M  36.64 
 
 
494 aa  294  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2232  NADH dehydrogenase subunit M  35.98 
 
 
513 aa  294  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.26 
 
 
542 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1202  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.23 
 
 
527 aa  294  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1073  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.23 
 
 
527 aa  293  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.397792  normal  0.614174 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0790  NADH dehydrogenase subunit M  34.96 
 
 
489 aa  292  8e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0146664  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  36.63 
 
 
496 aa  291  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  36.36 
 
 
496 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  36.36 
 
 
496 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  36.36 
 
 
496 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  36.36 
 
 
496 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  36.36 
 
 
496 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  36.36 
 
 
496 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  36.36 
 
 
496 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0933  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.83 
 
 
505 aa  291  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  34.69 
 
 
501 aa  291  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  34.29 
 
 
502 aa  290  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1248  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.84 
 
 
534 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130648  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  37.16 
 
 
503 aa  289  7e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1007  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.23 
 
 
527 aa  289  7e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244989  normal  0.172272 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  34.28 
 
 
502 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  34.08 
 
 
502 aa  288  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  36.68 
 
 
514 aa  288  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0759  NADH dehydrogenase subunit M  35.2 
 
 
521 aa  288  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01299  NADH dehydrogenase subunit M  35.34 
 
 
491 aa  286  4e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648189  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2819  NADH dehydrogenase subunit M  36.49 
 
 
502 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0281  NADH dehydrogenase subunit M  35.86 
 
 
501 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.540456  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  36.21 
 
 
496 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0252  NADH dehydrogenase subunit M  35.46 
 
 
501 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  35.8 
 
 
496 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  36.01 
 
 
496 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  35.8 
 
 
496 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  35.8 
 
 
496 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  35.8 
 
 
496 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  35.6 
 
 
496 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2288  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.74 
 
 
516 aa  279  8e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1297  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.37 
 
 
517 aa  279  9e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.310609  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>