More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2288 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  75.44 
 
 
508 aa  769    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2288  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  100 
 
 
516 aa  1036    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1297  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  74.56 
 
 
517 aa  773    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.310609  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  58.02 
 
 
510 aa  585  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  57.72 
 
 
501 aa  580  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  61.41 
 
 
502 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  60.98 
 
 
502 aa  571  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  60.77 
 
 
502 aa  569  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1073  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  60.04 
 
 
527 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.397792  normal  0.614174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1202  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  60.04 
 
 
527 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1007  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  61.22 
 
 
527 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244989  normal  0.172272 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  57.93 
 
 
512 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3214  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  59.87 
 
 
514 aa  549  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  57.61 
 
 
503 aa  550  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4138  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  62.27 
 
 
506 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.68162  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  62.19 
 
 
503 aa  551  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  59.28 
 
 
503 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  61.05 
 
 
503 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2529  NADH dehydrogenase subunit M  57.95 
 
 
513 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0432269  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  58.58 
 
 
513 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2820  NADH dehydrogenase subunit M  59.19 
 
 
494 aa  548  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1328  NADH dehydrogenase subunit M  58.42 
 
 
515 aa  546  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0365587 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1190  NADH dehydrogenase subunit M  57.95 
 
 
513 aa  545  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.602239  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  61.82 
 
 
506 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  56.48 
 
 
503 aa  545  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  56.07 
 
 
507 aa  544  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  54.9 
 
 
514 aa  542  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0790  NADH dehydrogenase subunit M  55.65 
 
 
489 aa  539  9.999999999999999e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0146664  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2047  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  59.67 
 
 
506 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.688388  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.53 
 
 
497 aa  532  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  58.67 
 
 
505 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2416  NADH dehydrogenase subunit M  61.36 
 
 
506 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185861  hitchhiker  0.00201163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  58.24 
 
 
505 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2232  NADH dehydrogenase subunit M  54.49 
 
 
513 aa  524  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4549  NADH dehydrogenase subunit M  57.45 
 
 
502 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.177769 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1875  NADH dehydrogenase subunit M  57.75 
 
 
502 aa  525  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123353  normal  0.162516 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  57.48 
 
 
505 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2208  NADH dehydrogenase subunit M  57.75 
 
 
502 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0759  NADH dehydrogenase subunit M  53.35 
 
 
521 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1367  NADH dehydrogenase subunit M  58.9 
 
 
504 aa  516  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73718  normal  0.0186615 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  47.95 
 
 
496 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  47.95 
 
 
496 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  47.95 
 
 
496 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  47.95 
 
 
496 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  47.95 
 
 
496 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.55 
 
 
519 aa  463  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  47.95 
 
 
496 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  47.95 
 
 
496 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  46.09 
 
 
522 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  48.36 
 
 
496 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  47.95 
 
 
496 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  47.75 
 
 
496 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  47.75 
 
 
496 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  48.36 
 
 
496 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  47.75 
 
 
496 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  48.36 
 
 
496 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.87 
 
 
525 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1997  NADH dehydrogenase subunit M  47.15 
 
 
497 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.425538  normal  0.176809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1355  NADH dehydrogenase subunit M  47.75 
 
 
496 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000992227  normal  0.0345123 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  47.95 
 
 
496 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.39 
 
 
535 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3202  NADH dehydrogenase subunit M  47.75 
 
 
496 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422188  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2819  NADH dehydrogenase subunit M  47.9 
 
 
502 aa  449  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3126  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.69 
 
 
535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1754  NADH dehydrogenase subunit M  48.37 
 
 
493 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.494513  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2050  NADH dehydrogenase subunit M  46.5 
 
 
488 aa  444  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232549  normal  0.0955875 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0961  NADH dehydrogenase subunit M  46.34 
 
 
494 aa  444  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0280946  normal  0.49186 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.49 
 
 
535 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0829  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45 
 
 
504 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.18 
 
 
504 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0720  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.39 
 
 
504 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.362005  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2049  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.64 
 
 
495 aa  438  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3625  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.69 
 
 
491 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0939  NADH dehydrogenase subunit M  46.3 
 
 
488 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.573933  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2202  NADH dehydrogenase subunit M  45.47 
 
 
488 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  0.474832 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01299  NADH dehydrogenase subunit M  49.26 
 
 
491 aa  432  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648189  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2553  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.4 
 
 
504 aa  433  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.668765  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1415  NADH dehydrogenase (quinone)  47.43 
 
 
491 aa  434  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.508375  normal  0.0193211 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.58 
 
 
494 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2618  NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  48.58 
 
 
494 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0969  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.05 
 
 
491 aa  432  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667144  normal  0.19276 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0252  NADH dehydrogenase subunit M  47.49 
 
 
501 aa  429  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1103  NADH dehydrogenase subunit M  48.07 
 
 
495 aa  432  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135594  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0884  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.69 
 
 
491 aa  430  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1505  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.25 
 
 
491 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.185001  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1879  NADH dehydrogenase subunit M  45.47 
 
 
488 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.493129  normal  0.822984 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1958  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.37 
 
 
501 aa  428  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0280811 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.07 
 
 
495 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0973  NADH dehydrogenase subunit M  46.29 
 
 
488 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0836349  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0281  NADH dehydrogenase subunit M  47.09 
 
 
501 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.540456  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1513  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.12 
 
 
490 aa  422  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366776 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1952  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.47 
 
 
507 aa  421  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0417902  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1154  NADH dehydrogenase subunit M  47.66 
 
 
494 aa  419  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.408177  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1275  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.08 
 
 
491 aa  421  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.512446  normal  0.301879 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2824  NADH-quinone oxidoreductase chain M  46.28 
 
 
501 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2693  NADH-quinone oxidoreductase chain M  46.28 
 
 
501 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3498  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.84 
 
 
491 aa  418  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.09 
 
 
505 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1436  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.84 
 
 
491 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.244005  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1039  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.08 
 
 
488 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>