More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4189 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
341 aa  709    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  80.12 
 
 
344 aa  570  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  80.12 
 
 
345 aa  568  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507892  normal  0.185668 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.18 
 
 
346 aa  530  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.13 
 
 
329 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000513582  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.459619  normal  0.136094 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 
321 aa  119  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000491095  unclonable  4.61706e-23 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1962  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.89 
 
 
332 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.299125 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4100  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
325 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
325 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.620777 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 
343 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 
354 aa  104  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.873323  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 
331 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 
321 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.9 
 
 
316 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
343 aa  103  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 
313 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0778  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 
316 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00475764  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 
316 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577574  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 
314 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 
308 aa  100  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 
328 aa  99.8  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 
313 aa  99.4  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
309 aa  99.4  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 
326 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 
326 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.19 
 
 
329 aa  97.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.463092  decreased coverage  0.00350753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.64 
 
 
321 aa  97.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0455537  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.65 
 
 
327 aa  96.7  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
318 aa  96.3  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
311 aa  96.3  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0418  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  28.53 
 
 
321 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  23.42 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.72 
 
 
310 aa  95.5  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.26 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.02 
 
 
321 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.05 
 
 
327 aa  94  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.36 
 
 
317 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.72 
 
 
317 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307285  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.29 
 
 
318 aa  93.6  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 
310 aa  93.2  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
333 aa  93.2  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 
334 aa  92.8  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0488  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.24 
 
 
321 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.24 
 
 
321 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0422  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  28.15 
 
 
321 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.24 
 
 
321 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.41 
 
 
314 aa  92  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.167111  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
318 aa  91.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954538 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.36 
 
 
322 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.79 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 
312 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 
309 aa  90.5  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.63 
 
 
330 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000230956 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.38 
 
 
311 aa  90.5  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4813  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.73 
 
 
321 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 
314 aa  90.1  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0561  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.35 
 
 
321 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
304 aa  89.7  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 
330 aa  89.7  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.746716  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0563  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.73 
 
 
321 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.4 
 
 
346 aa  89.7  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258351  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.65 
 
 
309 aa  89.7  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.51 
 
 
326 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.59 
 
 
368 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00157391  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.78 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.556452  hitchhiker  0.000650625 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.36 
 
 
320 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.579578  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.21 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0504  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.29 
 
 
356 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 
336 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
317 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.55 
 
 
324 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 
320 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000773597 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3060  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.27 
 
 
331 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0392933  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.51 
 
 
310 aa  87  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1611  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 
313 aa  87  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.709629  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.52 
 
 
318 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
309 aa  87  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2173  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
332 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0967474  normal  0.0101731 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
328 aa  87  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1566  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 
319 aa  86.7  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13324  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.38 
 
 
368 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.118654 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
319 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal  0.0304013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.93 
 
 
331 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.759181  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
324 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
321 aa  86.3  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 
317 aa  86.3  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.2 
 
 
346 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.544479  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.51 
 
 
334 aa  86.3  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.04 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0230856  normal  0.593918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>