More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4408 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4408  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 563 aa  1150    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2242  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 		 519 aa  262  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.89285 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  28.35 
 
 		 518 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.35 
 
 		 503 aa  234  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  31.87 
 
 		 542 aa  230  4e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 		 513 aa  223  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  32.27 
 
 		 552 aa  223  9e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  30.83 
 
 		 549 aa  220  6e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  32.38 
 
 		 540 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  32.38 
 
 		 540 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  32.38 
 
 		 540 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  31.39 
 
 		 549 aa  217  4e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  32.95 
 
 		 538 aa  217  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 		 520 aa  216  8e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  32.89 
 
 		 547 aa  216  9e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 500 aa  215  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  32.6 
 
 		 564 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 		 843 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  30.74 
 
 		 596 aa  214  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  29.26 
 
 		 549 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0581  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 526 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  31.55 
 
 		 562 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  30.68 
 
 		 552 aa  213  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 		 662 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 		 544 aa  212  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  32.1 
 
 		 557 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  32.23 
 
 		 573 aa  212  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  31.27 
 
 		 549 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.17 
 
 		 514 aa  211  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  30.74 
 
 		 574 aa  210  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0339  AMP-binding domain protein  30.84 
 
 		 602 aa  210  4e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  29.63 
 
 		 562 aa  211  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 549 aa  211  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  30.71 
 
 		 549 aa  210  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  32.43 
 
 		 561 aa  210  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  31.35 
 
 		 544 aa  209  9e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  31.64 
 
 		 562 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 		 510 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  31.09 
 
 		 557 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 		 553 aa  208  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  30.93 
 
 		 587 aa  208  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  29.91 
 
 		 547 aa  208  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.28 
 
 		 524 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 557 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  31.82 
 
 		 538 aa  209  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0315  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 		 510 aa  207  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  32.52 
 
 		 552 aa  207  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 558 aa  207  5e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.13 
 
 		 525 aa  206  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  31.18 
 
 		 505 aa  206  8e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  30.47 
 
 		 584 aa  205  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  30.4 
 
 		 552 aa  205  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  30.19 
 
 		 552 aa  206  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 		 506 aa  206  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  30.88 
 
 		 566 aa  206  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  29.39 
 
 		 560 aa  205  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 		 501 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  31.59 
 
 		 539 aa  205  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 551 aa  205  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 1043 aa  205  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  30.81 
 
 		 541 aa  204  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  30.56 
 
 		 579 aa  204  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  30.37 
 
 		 503 aa  204  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 		 527 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  30.64 
 
 		 546 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  30.65 
 
 		 574 aa  203  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 		 550 aa  203  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  30.22 
 
 		 575 aa  203  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  29.26 
 
 		 549 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  31.34 
 
 		 560 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  31.68 
 
 		 565 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  32.34 
 
 		 549 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0354  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 		 576 aa  202  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  31.59 
 
 		 596 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  31.31 
 
 		 578 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 		 525 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  29.41 
 
 		 570 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 551 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  29.6 
 
 		 570 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  30.44 
 
 		 546 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 		 571 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  29.6 
 
 		 570 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  29.6 
 
 		 570 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  30.15 
 
 		 570 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  31.23 
 
 		 560 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.12 
 
 		 526 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  30.02 
 
 		 570 aa  201  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.27 
 
 		 579 aa  201  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  30.71 
 
 		 546 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  29.64 
 
 		 570 aa  201  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2503  AMP-binding domain protein  30.84 
 
 		 568 aa  201  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  29.52 
 
 		 576 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  32.03 
 
 		 550 aa  200  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  30.91 
 
 		 550 aa  200  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  29.2 
 
 		 495 aa  200  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.92 
 
 		 528 aa  200  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 		 566 aa  200  6e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 560 aa  200  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  27.32 
 
 		 550 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4355  AMP-binding domain protein  31.98 
 
 		 577 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>