More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2206 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4136  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  87.01 
 
 
386 aa  700    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.71733  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1989  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  83.64 
 
 
386 aa  655    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1969  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  83.12 
 
 
386 aa  654    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2035  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  83.64 
 
 
386 aa  655    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162743  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2206  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  100 
 
 
386 aa  779    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192739  normal  0.271973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4408  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  74.41 
 
 
387 aa  588  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2905  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  50.13 
 
 
431 aa  366  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1074  Lactate 2-monooxygenase  53 
 
 
393 aa  363  3e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1466  Lactate 2-monooxygenase  54.47 
 
 
396 aa  358  9e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1619  Lactate 2-monooxygenase  52.47 
 
 
389 aa  354  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00855428  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13410  alpha-hydroxyacid dehydrogenase, FMN-dependent L-lactate dehydrogenase  50 
 
 
388 aa  350  3e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2282  Lactate 2-monooxygenase  50.26 
 
 
379 aa  350  3e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.313203  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0905  Lactate 2-monooxygenase  47.81 
 
 
388 aa  331  1e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1052  lactate 2-monooxygenase  46.88 
 
 
431 aa  327  3e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.162523  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0626  lactate 2-monooxygenase  45.95 
 
 
423 aa  308  1.0000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08744  FMN dependent dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02720)  43.11 
 
 
403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2374  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  45.17 
 
 
421 aa  299  5e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0273182  hitchhiker  0.00857562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4523  Lactate 2-monooxygenase  41.9 
 
 
426 aa  291  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1699  Lactate 2-monooxygenase  43.38 
 
 
434 aa  290  3e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08587  FMN dependent dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G00500)  42.13 
 
 
400 aa  269  8e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3352  Lactate 2-monooxygenase  45.5 
 
 
387 aa  266  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2398  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.26 
 
 
359 aa  255  8e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.940863  normal  0.750352 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04421  L-lactate dehydrogenase (AFU_orthologue; AFUA_4G07050)  37.18 
 
 
458 aa  247  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00742745  normal  0.589909 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1430  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.64 
 
 
366 aa  236  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0230431  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0453  Lactate 2-monooxygenase  43.15 
 
 
361 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12350  L-lactate dehydrogenase/FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.71 
 
 
371 aa  227  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.205767  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2999  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.96 
 
 
366 aa  225  8e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2560  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.21 
 
 
396 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00607749 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4413  L-lactate dehydrogenase  36.39 
 
 
386 aa  223  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6258  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.94 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4132  L-lactate dehydrogenase  36.12 
 
 
386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3049  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.11 
 
 
379 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0804  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.89 
 
 
389 aa  212  9e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2506  L-lactate dehydrogenase  35.04 
 
 
381 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1696  L-lactate dehydrogenase  35.04 
 
 
381 aa  212  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0334813 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2409  L-lactate dehydrogenase  35.04 
 
 
381 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1371  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.9 
 
 
381 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1734  L-lactate oxidase  33.24 
 
 
400 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.613324  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1737  L-lactate oxidase  33.24 
 
 
400 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1798  L-lactate oxidase  33.24 
 
 
400 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0948  L-lactate dehydrogenase  35.36 
 
 
390 aa  208  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03020  alpha-hydroxyacid dehydrogenase, FMN-dependent L-lactate dehydrogenase  38.5 
 
 
409 aa  208  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0702  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.61 
 
 
369 aa  206  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3143  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.51 
 
 
380 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325182  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1817  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.52 
 
 
349 aa  206  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.466899 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2360  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.31 
 
 
379 aa  206  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3635  L-lactate dehydrogenase  36.39 
 
 
379 aa  205  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0404  L-lactate dehydrogenase  34.77 
 
 
392 aa  205  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3912  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.89 
 
 
401 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3519  L-lactate dehydrogenase  35.92 
 
 
378 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1448  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.2 
 
 
381 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0089  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.27 
 
 
391 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442133  normal  0.763555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4598  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.97 
 
 
376 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1871  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.25 
 
 
358 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1682  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.69 
 
 
403 aa  204  3e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4737  L-lactate dehydrogenase  35.92 
 
 
381 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0378  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.33 
 
 
371 aa  202  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1075  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  35.05 
 
 
399 aa  202  7e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001223  L-lactate dehydrogenase  33.69 
 
 
379 aa  202  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3346  L-lactate dehydrogenase  34.32 
 
 
379 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4736  L-lactate dehydrogenase  35.66 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4602  L-lactate dehydrogenase  35.66 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0515412  normal  0.0177303 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2274  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  37.43 
 
 
369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03463  L-lactate dehydrogenase  36.1 
 
 
388 aa  200  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4115  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.97 
 
 
379 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.105278  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4493  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.42 
 
 
378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14596 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0920  L-lactate dehydrogenase  34.42 
 
 
381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0862  L-lactate dehydrogenase  34.42 
 
 
381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.27299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63090  L-lactate dehydrogenase  35.92 
 
 
381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0242094  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6162  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.17 
 
 
357 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2875  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  32.98 
 
 
380 aa  199  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189587  normal  0.0992837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2879  L-lactate dehydrogenase  36.07 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2407  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.2 
 
 
406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.463668  normal  0.0231198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3942  L-lactate dehydrogenase  33.96 
 
 
396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33860  L-lactate dehydrogenase  36.07 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.14557 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3817  L-lactate dehydrogenase  33.96 
 
 
396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03463  L-lactate dehydrogenase, FMN-linked  33.96 
 
 
396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0100  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.96 
 
 
396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3859  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.35 
 
 
390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03414  hypothetical protein  33.96 
 
 
396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4109  L-lactate dehydrogenase  33.96 
 
 
396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4978  L-lactate dehydrogenase  33.96 
 
 
396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0695  L-lactate dehydrogenase  34.68 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000139507 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0103  L-lactate dehydrogenase  33.96 
 
 
396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4031  L-lactate dehydrogenase  33.96 
 
 
396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7392  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.61 
 
 
405 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0187555  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1816  putative L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.15 
 
 
378 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5491  L-lactate dehydrogenase  35.12 
 
 
381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6648  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.61 
 
 
391 aa  196  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0123873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4800  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.88 
 
 
379 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0136  S-mandelate dehydrogenase (MdlB)  37.08 
 
 
394 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3916  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.88 
 
 
379 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0130  L-lactate dehydrogenase  34.05 
 
 
395 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5754  L-lactate dehydrogenase  34.69 
 
 
386 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202266  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2463  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.22 
 
 
348 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283428  normal  0.44924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4638  L-lactate dehydrogenase  36.19 
 
 
384 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76191  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5439  L-lactate dehydrogenase  34.32 
 
 
379 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0254  L-lactate dehydrogenase  33.96 
 
 
378 aa  194  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3929  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.33 
 
 
388 aa  194  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0176319  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3895  L-lactate dehydrogenase  34.5 
 
 
396 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.479872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>