More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4408 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4408  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  100 
 
 
387 aa  779    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4136  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  76.76 
 
 
386 aa  615  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.71733  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1989  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  74.74 
 
 
386 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2035  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  74.74 
 
 
386 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162743  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1969  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  74.74 
 
 
386 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2206  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  74.41 
 
 
386 aa  588  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192739  normal  0.271973 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2282  Lactate 2-monooxygenase  51.18 
 
 
379 aa  355  7.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.313203  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2905  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  48.16 
 
 
431 aa  347  2e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1466  Lactate 2-monooxygenase  52.19 
 
 
396 aa  345  8e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1074  Lactate 2-monooxygenase  51.17 
 
 
393 aa  340  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0905  Lactate 2-monooxygenase  47.89 
 
 
388 aa  327  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13410  alpha-hydroxyacid dehydrogenase, FMN-dependent L-lactate dehydrogenase  47.38 
 
 
388 aa  320  3e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1619  Lactate 2-monooxygenase  47.8 
 
 
389 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00855428  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08744  FMN dependent dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02720)  43.37 
 
 
403 aa  300  3e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2374  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  44.47 
 
 
421 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0273182  hitchhiker  0.00857562 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0626  lactate 2-monooxygenase  44.87 
 
 
423 aa  293  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1052  lactate 2-monooxygenase  44.53 
 
 
431 aa  293  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.162523  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1699  Lactate 2-monooxygenase  44.36 
 
 
434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4523  Lactate 2-monooxygenase  40.91 
 
 
426 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3352  Lactate 2-monooxygenase  47.3 
 
 
387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08587  FMN dependent dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G00500)  40.51 
 
 
400 aa  252  9.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2398  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  42.15 
 
 
359 aa  251  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.940863  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2560  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  42.05 
 
 
396 aa  244  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00607749 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12350  L-lactate dehydrogenase/FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  42.54 
 
 
371 aa  240  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.205767  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04421  L-lactate dehydrogenase (AFU_orthologue; AFUA_4G07050)  36.32 
 
 
458 aa  239  5.999999999999999e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00742745  normal  0.589909 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0089  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  42.23 
 
 
391 aa  229  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442133  normal  0.763555 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1430  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.95 
 
 
366 aa  227  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0230431  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3049  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.19 
 
 
379 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2463  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.78 
 
 
348 aa  220  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283428  normal  0.44924 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0453  Lactate 2-monooxygenase  40.7 
 
 
361 aa  219  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2999  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.62 
 
 
366 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0804  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.92 
 
 
389 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1871  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  39.32 
 
 
358 aa  215  9e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0702  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.74 
 
 
369 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4132  L-lactate dehydrogenase  37.07 
 
 
386 aa  210  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0378  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.61 
 
 
371 aa  210  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4413  L-lactate dehydrogenase  36.34 
 
 
386 aa  209  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3519  L-lactate dehydrogenase  37.9 
 
 
378 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0229  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.43 
 
 
364 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1817  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.32 
 
 
349 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.466899 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0839  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.77 
 
 
361 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.766107  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3143  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.14 
 
 
380 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325182  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6258  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.77 
 
 
390 aa  203  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1734  L-lactate oxidase  32.87 
 
 
400 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.613324  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1798  L-lactate oxidase  32.87 
 
 
400 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1737  L-lactate oxidase  32.87 
 
 
400 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1696  L-lactate dehydrogenase  36.44 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0334813 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2506  L-lactate dehydrogenase  36.44 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2409  L-lactate dehydrogenase  36.44 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2879  L-lactate dehydrogenase  36.07 
 
 
383 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33860  L-lactate dehydrogenase  36.07 
 
 
383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.14557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4107  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  42.74 
 
 
385 aa  199  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0404  L-lactate dehydrogenase  36.39 
 
 
392 aa  199  9e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3713  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.54 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.628377 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0496  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  40.23 
 
 
382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.150259  normal  0.194541 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1371  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.36 
 
 
381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1075  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  34.58 
 
 
399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3635  L-lactate dehydrogenase  37.5 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2274  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  35.69 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4800  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.1 
 
 
379 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0948  L-lactate dehydrogenase  35.2 
 
 
390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3346  L-lactate dehydrogenase  35.6 
 
 
379 aa  197  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5439  L-lactate dehydrogenase  35.95 
 
 
379 aa  196  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3083  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.4 
 
 
395 aa  195  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.796124  normal  0.594065 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2875  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.62 
 
 
380 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189587  normal  0.0992837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2360  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36 
 
 
379 aa  195  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2407  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.76 
 
 
406 aa  195  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.463668  normal  0.0231198 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1682  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.07 
 
 
403 aa  195  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001223  L-lactate dehydrogenase  34.69 
 
 
379 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1305  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.1 
 
 
379 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03463  L-lactate dehydrogenase  37.47 
 
 
388 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4598  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  42.38 
 
 
376 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3916  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.1 
 
 
379 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4493  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.43 
 
 
378 aa  193  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14596 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2351  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.42 
 
 
385 aa  193  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3942  L-lactate dehydrogenase  35.11 
 
 
396 aa  192  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4978  L-lactate dehydrogenase  35.11 
 
 
396 aa  192  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4109  L-lactate dehydrogenase  35.11 
 
 
396 aa  192  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03463  L-lactate dehydrogenase, FMN-linked  35.11 
 
 
396 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0100  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.11 
 
 
396 aa  192  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3817  L-lactate dehydrogenase  35.11 
 
 
396 aa  192  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03414  hypothetical protein  35.11 
 
 
396 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0103  L-lactate dehydrogenase  35.11 
 
 
396 aa  192  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4031  L-lactate dehydrogenase  35.11 
 
 
396 aa  192  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3410  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.88 
 
 
435 aa  192  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.194367  hitchhiker  0.0000661899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4737  L-lactate dehydrogenase  37.06 
 
 
381 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3929  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.59 
 
 
388 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0176319  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4115  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.1 
 
 
379 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.105278  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3912  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.57 
 
 
401 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1816  putative L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.61 
 
 
378 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1112  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.32 
 
 
381 aa  191  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0130  L-lactate dehydrogenase  36.17 
 
 
395 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1448  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.25 
 
 
381 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0920  L-lactate dehydrogenase  33.88 
 
 
381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0862  L-lactate dehydrogenase  33.88 
 
 
381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.27299  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3845  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  38.01 
 
 
397 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3859  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.84 
 
 
390 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4638  L-lactate dehydrogenase  37.6 
 
 
384 aa  189  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76191  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1864  L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) related alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.99 
 
 
417 aa  189  5.999999999999999e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.213677  hitchhiker  0.000000000554071 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4736  L-lactate dehydrogenase  36.51 
 
 
381 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>