40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3054 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2728  hypothetical protein  61.22 
 
 		 752 aa  955    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00269441  normal  0.0201961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3054  hypothetical protein  100 
 
 		 754 aa  1540    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3714  hypothetical protein  35.59 
 
 		 1117 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2479  putative phage host specificity protein  35.02 
 
 		 1296 aa  319  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1072  hypothetical protein  35.75 
 
 		 1306 aa  318  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0995947 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1144  putative phage host specificity protein  35.83 
 
 		 1296 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1089  hypothetical protein  35.25 
 
 		 1297 aa  310  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.466235  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2887  putative phage host specificity protein  32.33 
 
 		 1296 aa  300  6e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0568102  normal  0.211291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0919  gene transfer agent (GTA) like protein  34.85 
 
 		 1286 aa  297  5e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0792  gene transfer agent (GTA) like protein  33.59 
 
 		 1313 aa  295  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.780926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3901  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  33.74 
 
 		 1279 aa  293  7e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75252  normal  0.0322249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7312  gene transfer agent (GTA) like protein  35.57 
 
 		 1300 aa  292  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4296  gene transfer agent (GTA) like protein  35.73 
 
 		 1301 aa  291  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680224  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0270  gene transfer agent (GTA) like protein  34.73 
 
 		 1339 aa  291  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.67619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6574  gene transfer agent (GTA) like protein  35.57 
 
 		 1300 aa  291  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2012  gene transfer agent (GTA) like protein  35.73 
 
 		 1300 aa  289  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5975  gene transfer agent (GTA) like protein  33.91 
 
 		 1301 aa  286  8e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.161454 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3077  gene transfer agent (GTA) like protein  38.48 
 
 		 996 aa  282  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.759421  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0933  gene transfer agent (GTA) orfg15  34.38 
 
 		 1252 aa  281  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.264711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2599  gene transfer agent (GTA) like protein  35.2 
 
 		 1301 aa  279  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2163  hypothetical protein  32.77 
 
 		 1305 aa  274  6e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1181  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  32.35 
 
 		 1285 aa  266  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3458  gene transfer agent (GTA) orfg15  32.92 
 
 		 1297 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384127  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0600  hypothetical protein  32.72 
 
 		 1287 aa  262  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1354  gene transfer agent (GTA) orfg15  31.52 
 
 		 1263 aa  258  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678989  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1993  gene transfer agent (GTA) orfg15  32.72 
 
 		 1283 aa  258  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.263252  normal  0.679187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3171  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  33.18 
 
 		 1300 aa  257  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.997359  normal  0.0327353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1824  gene transfer agent (GTA) orfg15  32.81 
 
 		 1280 aa  257  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51325  normal  0.391339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2122  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  32.28 
 
 		 1290 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0264351  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1426  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  31.37 
 
 		 1284 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1692  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  29.21 
 
 		 1302 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281256  normal  0.701211 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1418  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  30.62 
 
 		 1302 aa  211  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170545  normal  0.0550012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4980  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  30.71 
 
 		 1302 aa  207  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661116 
 
 
-
 
NC_002978  WD0382  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1111 aa  204  5e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1414  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  29.72 
 
 		 1300 aa  201  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186863  normal  0.0805686 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1646  hypothetical protein  31.66 
 
 		 1483 aa  179  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.734787 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0253  hypothetical protein  21.97 
 
 		 1206 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0836  hypothetical protein  20.98 
 
 		 1201 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2727  putative phage associated protein  36.26 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000109744  normal  0.0231233 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3055  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  35.23 
 
 		 202 aa  53.5  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>