25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3055 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3055  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  100 
 
 		 202 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2727  putative phage associated protein  60.2 
 
 		 202 aa  261  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000109744  normal  0.0231233 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2728  hypothetical protein  38.78 
 
 		 752 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00269441  normal  0.0201961 
 
 
-
 
NC_002978  WD1311  hypothetical protein  29.89 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000230113  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0528  hypothetical protein  26.19 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3709  glycoside hydrolase family protein  25.77 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1178  hypothetical protein  28.27 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0500  hypothetical protein  24.85 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3461  hypothetical protein  26.06 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.364072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4083  hypothetical protein  27.27 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216019  normal  0.0137038 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3054  hypothetical protein  35.23 
 
 		 754 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1987  hypothetical protein  26.18 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1821  hypothetical protein  26.32 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.071229  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1644  hypothetical protein  28.3 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1423  hypothetical protein  26.74 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750454  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4977  hypothetical protein  27.18 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136921 
 
 
-
 
NC_004310  BR0598  hypothetical protein  25.59 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799803  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1421  hypothetical protein  26.04 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0977119  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0273  hypothetical protein  25.97 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1350  hypothetical protein  26.13 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00122834  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3129  hypothetical protein  26.57 
 
 		 779 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416541  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1695  hypothetical protein  26.37 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.196685  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2166  hypothetical protein  25.79 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0930  hypothetical protein  24.73 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.261483 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3168  hypothetical protein  26.15 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.0129313 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>