41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1178 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1178  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  427  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1423  hypothetical protein  88.26 
 
 
213 aa  383  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750454  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3461  hypothetical protein  80.09 
 
 
211 aa  341  5e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.364072  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1821  hypothetical protein  79.62 
 
 
212 aa  339  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.071229  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1987  hypothetical protein  77.73 
 
 
211 aa  327  9e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2113  hypothetical protein  76.78 
 
 
212 aa  308  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0256952  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4977  hypothetical protein  65.71 
 
 
213 aa  280  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3168  hypothetical protein  64.93 
 
 
213 aa  274  8e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.0129313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1417  hypothetical protein  61.79 
 
 
213 aa  256  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.0735583 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1421  hypothetical protein  60.38 
 
 
213 aa  256  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0977119  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1695  hypothetical protein  61.32 
 
 
213 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.196685  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0916  hypothetical protein  53.11 
 
 
210 aa  238  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1350  hypothetical protein  55.19 
 
 
211 aa  236  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00122834  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5969  hypothetical protein  55.24 
 
 
211 aa  215  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0666926  normal  0.313175 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1086  hypothetical protein  51.2 
 
 
210 aa  215  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0524339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6571  hypothetical protein  54.76 
 
 
211 aa  209  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7315  hypothetical protein  54.81 
 
 
211 aa  207  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4293  hypothetical protein  55.29 
 
 
211 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2602  hypothetical protein  53.85 
 
 
211 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1643  hypothetical protein  50.96 
 
 
210 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2009  hypothetical protein  53.85 
 
 
211 aa  205  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934045  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1141  hypothetical protein  48.56 
 
 
210 aa  203  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.826751 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2476  hypothetical protein  48.56 
 
 
210 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0598  hypothetical protein  50.24 
 
 
210 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799803  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2890  hypothetical protein  48.1 
 
 
213 aa  200  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0594932  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2166  hypothetical protein  47.39 
 
 
210 aa  197  7.999999999999999e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1069  hypothetical protein  45.93 
 
 
210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0930  hypothetical protein  49.76 
 
 
208 aa  189  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.261483 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3709  glycoside hydrolase family protein  47.37 
 
 
208 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0273  hypothetical protein  44.5 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1311  hypothetical protein  39.23 
 
 
198 aa  160  1e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000230113  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3129  hypothetical protein  41.23 
 
 
779 aa  149  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416541  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3904  hypothetical protein  44.08 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0528  hypothetical protein  34.76 
 
 
199 aa  132  3e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0500  hypothetical protein  31.58 
 
 
199 aa  128  6e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1992  hypothetical protein  43.13 
 
 
774 aa  122  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0145174  hitchhiker  0.0070387 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0796  hypothetical protein  35.89 
 
 
196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7154  hypothetical protein  35.41 
 
 
207 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0442341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4083  hypothetical protein  34.92 
 
 
195 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216019  normal  0.0137038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1644  hypothetical protein  35.71 
 
 
204 aa  87.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3055  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  28.27 
 
 
202 aa  56.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>