42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0930 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0930  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  414  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.261483 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3709  glycoside hydrolase family protein  56.31 
 
 
208 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0916  hypothetical protein  55.29 
 
 
210 aa  224  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2166  hypothetical protein  51.44 
 
 
210 aa  218  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1086  hypothetical protein  53.85 
 
 
210 aa  217  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0524339 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1350  hypothetical protein  53.62 
 
 
211 aa  216  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00122834  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1421  hypothetical protein  56.52 
 
 
213 aa  216  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0977119  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1695  hypothetical protein  56.52 
 
 
213 aa  214  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.196685  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1417  hypothetical protein  56.46 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.0735583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1987  hypothetical protein  54.5 
 
 
211 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3461  hypothetical protein  54.03 
 
 
211 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.364072  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0273  hypothetical protein  56.1 
 
 
208 aa  210  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5969  hypothetical protein  54.37 
 
 
211 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0666926  normal  0.313175 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2476  hypothetical protein  54.33 
 
 
210 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1141  hypothetical protein  54.33 
 
 
210 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.826751 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1069  hypothetical protein  51.92 
 
 
210 aa  205  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6571  hypothetical protein  55.5 
 
 
211 aa  203  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1643  hypothetical protein  50.96 
 
 
210 aa  203  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2009  hypothetical protein  55.83 
 
 
211 aa  202  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934045  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7315  hypothetical protein  55.83 
 
 
211 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2602  hypothetical protein  55.83 
 
 
211 aa  201  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1821  hypothetical protein  51.42 
 
 
212 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.071229  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3168  hypothetical protein  52.34 
 
 
213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.0129313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4293  hypothetical protein  54.85 
 
 
211 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1423  hypothetical protein  51.89 
 
 
213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750454  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2113  hypothetical protein  52.83 
 
 
212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0256952  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4977  hypothetical protein  53.62 
 
 
213 aa  192  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136921 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2890  hypothetical protein  48.56 
 
 
213 aa  191  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0594932  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1178  hypothetical protein  49.76 
 
 
213 aa  189  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0598  hypothetical protein  49.76 
 
 
210 aa  184  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799803  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3129  hypothetical protein  48.31 
 
 
779 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416541  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3904  hypothetical protein  50 
 
 
210 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_002978  WD1311  hypothetical protein  41.18 
 
 
198 aa  169  2e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000230113  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1992  hypothetical protein  48.79 
 
 
774 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0145174  hitchhiker  0.0070387 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0528  hypothetical protein  35.12 
 
 
199 aa  142  3e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0500  hypothetical protein  33.5 
 
 
199 aa  135  4e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0796  hypothetical protein  39.41 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7154  hypothetical protein  34.74 
 
 
207 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0442341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4083  hypothetical protein  34.65 
 
 
195 aa  99  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216019  normal  0.0137038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1644  hypothetical protein  35.71 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2727  putative phage associated protein  25.84 
 
 
202 aa  48.1  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000109744  normal  0.0231233 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3055  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  24.73 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>