42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1821 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1821  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.071229  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3461  hypothetical protein  81.13 
 
 		 211 aa  353  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.364072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1987  hypothetical protein  82.08 
 
 		 211 aa  352  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1423  hypothetical protein  80.19 
 
 		 213 aa  344  6e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750454  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1178  hypothetical protein  79.62 
 
 		 213 aa  339  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2113  hypothetical protein  80.19 
 
 		 212 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0256952  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4977  hypothetical protein  68.6 
 
 		 213 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136921 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1421  hypothetical protein  64.59 
 
 		 213 aa  277  8e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0977119  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1417  hypothetical protein  64.59 
 
 		 213 aa  275  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.0735583 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1695  hypothetical protein  64.59 
 
 		 213 aa  272  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.196685  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3168  hypothetical protein  62.91 
 
 		 213 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.0129313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0916  hypothetical protein  56.19 
 
 		 210 aa  246  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5969  hypothetical protein  56.73 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0666926  normal  0.313175 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1350  hypothetical protein  56.94 
 
 		 211 aa  231  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00122834  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6571  hypothetical protein  56.4 
 
 		 211 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1086  hypothetical protein  53.33 
 
 		 210 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0524339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7315  hypothetical protein  56.73 
 
 		 211 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2602  hypothetical protein  56.25 
 
 		 211 aa  225  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2009  hypothetical protein  56.25 
 
 		 211 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934045  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4293  hypothetical protein  56.73 
 
 		 211 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1141  hypothetical protein  52.61 
 
 		 210 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.826751 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2476  hypothetical protein  52.61 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1643  hypothetical protein  52.13 
 
 		 210 aa  218  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2890  hypothetical protein  51.9 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0594932  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2166  hypothetical protein  49.52 
 
 		 210 aa  208  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1069  hypothetical protein  49.05 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3709  glycoside hydrolase family protein  51.67 
 
 		 208 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0930  hypothetical protein  51.42 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.261483 
 
 
-
 
NC_004310  BR0598  hypothetical protein  47.17 
 
 		 210 aa  192  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799803  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0273  hypothetical protein  49.04 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3904  hypothetical protein  49.06 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_002978  WD1311  hypothetical protein  40.19 
 
 		 198 aa  165  5.9999999999999996e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000230113  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3129  hypothetical protein  42.65 
 
 		 779 aa  159  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416541  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1992  hypothetical protein  44.55 
 
 		 774 aa  136  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0145174  hitchhiker  0.0070387 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0528  hypothetical protein  35.89 
 
 		 199 aa  135  5e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0500  hypothetical protein  33.97 
 
 		 199 aa  135  5e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0796  hypothetical protein  36.23 
 
 		 196 aa  121  7e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4083  hypothetical protein  38.73 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216019  normal  0.0137038 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7154  hypothetical protein  33.01 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0442341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1644  hypothetical protein  32.96 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3055  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  26.32 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2727  putative phage associated protein  25.4 
 
 		 202 aa  42  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000109744  normal  0.0231233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>