40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0916 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0916  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2890  hypothetical protein  61.43 
 
 		 213 aa  270  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0594932  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1069  hypothetical protein  58.1 
 
 		 210 aa  266  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1086  hypothetical protein  57.62 
 
 		 210 aa  254  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0524339 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1423  hypothetical protein  57.62 
 
 		 213 aa  254  8e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750454  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1987  hypothetical protein  57.82 
 
 		 211 aa  254  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2166  hypothetical protein  56.67 
 
 		 210 aa  253  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3461  hypothetical protein  58.29 
 
 		 211 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.364072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2476  hypothetical protein  59.52 
 
 		 210 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1141  hypothetical protein  59.52 
 
 		 210 aa  248  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.826751 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1643  hypothetical protein  54.29 
 
 		 210 aa  246  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1821  hypothetical protein  56.19 
 
 		 212 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.071229  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3168  hypothetical protein  57.35 
 
 		 213 aa  244  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.0129313 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2113  hypothetical protein  57.62 
 
 		 212 aa  244  8e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0256952  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4977  hypothetical protein  59.13 
 
 		 213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136921 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1421  hypothetical protein  60.58 
 
 		 213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0977119  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1695  hypothetical protein  59.62 
 
 		 213 aa  239  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.196685  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1417  hypothetical protein  58.65 
 
 		 213 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.0735583 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1178  hypothetical protein  53.11 
 
 		 213 aa  238  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3709  glycoside hydrolase family protein  54.76 
 
 		 208 aa  237  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5969  hypothetical protein  58.94 
 
 		 211 aa  224  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0666926  normal  0.313175 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0930  hypothetical protein  55.29 
 
 		 208 aa  224  8e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.261483 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0273  hypothetical protein  55.02 
 
 		 208 aa  218  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1350  hypothetical protein  51.67 
 
 		 211 aa  215  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00122834  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4293  hypothetical protein  57.49 
 
 		 211 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6571  hypothetical protein  56.73 
 
 		 211 aa  210  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2009  hypothetical protein  56.52 
 
 		 211 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934045  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7315  hypothetical protein  56.52 
 
 		 211 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26464  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0598  hypothetical protein  52.38 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2602  hypothetical protein  56.04 
 
 		 211 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3904  hypothetical protein  54.07 
 
 		 210 aa  205  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_002978  WD1311  hypothetical protein  43.54 
 
 		 198 aa  188  5e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000230113  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0528  hypothetical protein  36.84 
 
 		 199 aa  160  9e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0500  hypothetical protein  35.24 
 
 		 199 aa  158  5e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3129  hypothetical protein  41.15 
 
 		 779 aa  145  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416541  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0796  hypothetical protein  41.26 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1992  hypothetical protein  45.93 
 
 		 774 aa  131  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0145174  hitchhiker  0.0070387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4083  hypothetical protein  35.35 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216019  normal  0.0137038 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7154  hypothetical protein  32.54 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0442341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1644  hypothetical protein  35.75 
 
 		 204 aa  94.7  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>