41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2009 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2009  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934045  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2602  hypothetical protein  98.58 
 
 
211 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7315  hypothetical protein  97.63 
 
 
211 aa  391  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6571  hypothetical protein  95.73 
 
 
211 aa  384  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4293  hypothetical protein  95.73 
 
 
211 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5969  hypothetical protein  86.26 
 
 
211 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0666926  normal  0.313175 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1086  hypothetical protein  61.35 
 
 
210 aa  248  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0524339 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1141  hypothetical protein  63.77 
 
 
210 aa  238  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.826751 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2476  hypothetical protein  63.77 
 
 
210 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1821  hypothetical protein  56.73 
 
 
212 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.071229  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1987  hypothetical protein  58.65 
 
 
211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3461  hypothetical protein  58.85 
 
 
211 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.364072  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4977  hypothetical protein  59.24 
 
 
213 aa  229  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136921 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1421  hypothetical protein  58.77 
 
 
213 aa  229  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0977119  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1417  hypothetical protein  58.29 
 
 
213 aa  228  6e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.0735583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1423  hypothetical protein  55.98 
 
 
213 aa  227  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750454  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1695  hypothetical protein  58.77 
 
 
213 aa  226  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.196685  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0916  hypothetical protein  56.52 
 
 
210 aa  219  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1643  hypothetical protein  52.66 
 
 
210 aa  218  6e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1178  hypothetical protein  54.33 
 
 
213 aa  216  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0930  hypothetical protein  55.83 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.261483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2113  hypothetical protein  55.98 
 
 
212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0256952  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3709  glycoside hydrolase family protein  52.43 
 
 
208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1069  hypothetical protein  53.14 
 
 
210 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2166  hypothetical protein  51.69 
 
 
210 aa  207  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3168  hypothetical protein  52.61 
 
 
213 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.0129313 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2890  hypothetical protein  51.21 
 
 
213 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0594932  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_004310  BR0598  hypothetical protein  50.23 
 
 
210 aa  190  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799803  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1350  hypothetical protein  48.34 
 
 
211 aa  188  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00122834  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0273  hypothetical protein  49.28 
 
 
208 aa  181  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3904  hypothetical protein  53.4 
 
 
210 aa  178  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3129  hypothetical protein  44.17 
 
 
779 aa  159  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416541  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1311  hypothetical protein  38.35 
 
 
198 aa  150  1e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000230113  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1992  hypothetical protein  48.06 
 
 
774 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0145174  hitchhiker  0.0070387 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0796  hypothetical protein  37.91 
 
 
196 aa  132  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0528  hypothetical protein  33.5 
 
 
199 aa  125  7e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0500  hypothetical protein  31.55 
 
 
199 aa  118  6e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4083  hypothetical protein  37.16 
 
 
195 aa  95.9  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216019  normal  0.0137038 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7154  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0442341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1644  hypothetical protein  36.67 
 
 
204 aa  84.7  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2727  putative phage associated protein  27.21 
 
 
202 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000109744  normal  0.0231233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>