41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1086 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1086  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0524339 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1141  hypothetical protein  80.95 
 
 		 210 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.826751 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2476  hypothetical protein  80.95 
 
 		 210 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1643  hypothetical protein  67.62 
 
 		 210 aa  303  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2166  hypothetical protein  64.76 
 
 		 210 aa  291  5e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1069  hypothetical protein  66.19 
 
 		 210 aa  291  6e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2890  hypothetical protein  65.71 
 
 		 213 aa  282  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0594932  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0916  hypothetical protein  57.62 
 
 		 210 aa  254  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3709  glycoside hydrolase family protein  57.14 
 
 		 208 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5969  hypothetical protein  59.9 
 
 		 211 aa  237  9e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0666926  normal  0.313175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1421  hypothetical protein  57.69 
 
 		 213 aa  235  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0977119  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4293  hypothetical protein  61.84 
 
 		 211 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2009  hypothetical protein  61.35 
 
 		 211 aa  235  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934045  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2602  hypothetical protein  61.84 
 
 		 211 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1417  hypothetical protein  56.94 
 
 		 213 aa  234  6e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.0735583 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1695  hypothetical protein  56.46 
 
 		 213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.196685  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7315  hypothetical protein  59.9 
 
 		 211 aa  231  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6571  hypothetical protein  59.62 
 
 		 211 aa  230  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1821  hypothetical protein  53.33 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.071229  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1987  hypothetical protein  53.08 
 
 		 211 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_004310  BR0598  hypothetical protein  54.76 
 
 		 210 aa  224  8e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3461  hypothetical protein  52.61 
 
 		 211 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.364072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4977  hypothetical protein  55.77 
 
 		 213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136921 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1423  hypothetical protein  51.43 
 
 		 213 aa  219  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750454  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0930  hypothetical protein  53.85 
 
 		 208 aa  217  7.999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.261483 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3168  hypothetical protein  51.66 
 
 		 213 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.0129313 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1178  hypothetical protein  51.2 
 
 		 213 aa  215  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3904  hypothetical protein  59.81 
 
 		 210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1350  hypothetical protein  51.67 
 
 		 211 aa  211  7.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00122834  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0273  hypothetical protein  51.2 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2113  hypothetical protein  51.43 
 
 		 212 aa  197  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0256952  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1311  hypothetical protein  42.58 
 
 		 198 aa  182  3e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000230113  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3129  hypothetical protein  45.67 
 
 		 779 aa  163  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416541  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0528  hypothetical protein  34.45 
 
 		 199 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0500  hypothetical protein  34.76 
 
 		 199 aa  152  5e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1992  hypothetical protein  48.56 
 
 		 774 aa  142  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0145174  hitchhiker  0.0070387 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0796  hypothetical protein  37.38 
 
 		 196 aa  135  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7154  hypothetical protein  35.41 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0442341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4083  hypothetical protein  37.63 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216019  normal  0.0137038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1644  hypothetical protein  34.43 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2727  putative phage associated protein  27.12 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000109744  normal  0.0231233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>