40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7154 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_7154  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0442341 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3709  glycoside hydrolase family protein  41.35 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1311  hypothetical protein  35.68 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000230113  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2166  hypothetical protein  35.55 
 
 
210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1086  hypothetical protein  35.41 
 
 
210 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0524339 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1069  hypothetical protein  34.45 
 
 
210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0273  hypothetical protein  39.32 
 
 
208 aa  111  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1141  hypothetical protein  33.01 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.826751 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2890  hypothetical protein  33.01 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0594932  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2476  hypothetical protein  33.01 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0796  hypothetical protein  38.25 
 
 
196 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0930  hypothetical protein  34.74 
 
 
208 aa  108  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.261483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3461  hypothetical protein  35.1 
 
 
211 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.364072  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1987  hypothetical protein  34.13 
 
 
211 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0500  hypothetical protein  29.76 
 
 
199 aa  102  4e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1178  hypothetical protein  35.41 
 
 
213 aa  101  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1643  hypothetical protein  32.54 
 
 
210 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0916  hypothetical protein  32.54 
 
 
210 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0598  hypothetical protein  34.29 
 
 
210 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799803  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1821  hypothetical protein  33.01 
 
 
212 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.071229  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0528  hypothetical protein  28.28 
 
 
199 aa  97.1  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1423  hypothetical protein  33.33 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750454  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1421  hypothetical protein  32.69 
 
 
213 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0977119  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1695  hypothetical protein  32.21 
 
 
213 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.196685  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1417  hypothetical protein  31.48 
 
 
213 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.0735583 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3168  hypothetical protein  34.29 
 
 
213 aa  91.3  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.0129313 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1350  hypothetical protein  31.63 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00122834  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5969  hypothetical protein  34.45 
 
 
211 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0666926  normal  0.313175 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3904  hypothetical protein  34.26 
 
 
210 aa  88.2  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4977  hypothetical protein  31.4 
 
 
213 aa  87  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136921 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6571  hypothetical protein  33.49 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3129  hypothetical protein  31.22 
 
 
779 aa  86.3  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416541  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4293  hypothetical protein  34.3 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2602  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2009  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934045  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7315  hypothetical protein  33.82 
 
 
211 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26464  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2113  hypothetical protein  32.69 
 
 
212 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0256952  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1644  hypothetical protein  30.57 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4083  hypothetical protein  32.1 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216019  normal  0.0137038 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1992  hypothetical protein  31.4 
 
 
774 aa  58.2  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0145174  hitchhiker  0.0070387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>