40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5969 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5969  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  413  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0666926  normal  0.313175 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4293  hypothetical protein  88.15 
 
 
211 aa  362  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7315  hypothetical protein  87.2 
 
 
211 aa  359  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2009  hypothetical protein  86.26 
 
 
211 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934045  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6571  hypothetical protein  86.26 
 
 
211 aa  354  5e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2602  hypothetical protein  85.78 
 
 
211 aa  352  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1086  hypothetical protein  59.9 
 
 
210 aa  237  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0524339 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1821  hypothetical protein  56.73 
 
 
212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.071229  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2476  hypothetical protein  61.84 
 
 
210 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1695  hypothetical protein  60.66 
 
 
213 aa  229  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.196685  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4977  hypothetical protein  60.19 
 
 
213 aa  228  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136921 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1141  hypothetical protein  61.35 
 
 
210 aa  228  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.826751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1417  hypothetical protein  58.77 
 
 
213 aa  228  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.0735583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3461  hypothetical protein  58.17 
 
 
211 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.364072  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1421  hypothetical protein  59.72 
 
 
213 aa  226  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0977119  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1987  hypothetical protein  57.14 
 
 
211 aa  224  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0916  hypothetical protein  58.94 
 
 
210 aa  224  6e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1423  hypothetical protein  56.87 
 
 
213 aa  224  9e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750454  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1178  hypothetical protein  55.24 
 
 
213 aa  215  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1643  hypothetical protein  51.21 
 
 
210 aa  211  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3168  hypothetical protein  53.59 
 
 
213 aa  210  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.0129313 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2113  hypothetical protein  56.67 
 
 
212 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0256952  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0930  hypothetical protein  54.37 
 
 
208 aa  207  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.261483 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3709  glycoside hydrolase family protein  51.46 
 
 
208 aa  203  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1069  hypothetical protein  52.17 
 
 
210 aa  203  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2166  hypothetical protein  50.72 
 
 
210 aa  198  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1350  hypothetical protein  48.34 
 
 
211 aa  194  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00122834  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2890  hypothetical protein  50.72 
 
 
213 aa  191  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0594932  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_004310  BR0598  hypothetical protein  49.53 
 
 
210 aa  189  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799803  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0273  hypothetical protein  48.79 
 
 
208 aa  175  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3904  hypothetical protein  52.88 
 
 
210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3129  hypothetical protein  44.44 
 
 
779 aa  155  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416541  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1311  hypothetical protein  38.83 
 
 
198 aa  149  2e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000230113  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1992  hypothetical protein  48.06 
 
 
774 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0145174  hitchhiker  0.0070387 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0796  hypothetical protein  39.71 
 
 
196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0528  hypothetical protein  32.04 
 
 
199 aa  122  4e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0500  hypothetical protein  31.07 
 
 
199 aa  121  7e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7154  hypothetical protein  34.45 
 
 
207 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0442341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4083  hypothetical protein  34.97 
 
 
195 aa  85.9  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216019  normal  0.0137038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1644  hypothetical protein  37.78 
 
 
204 aa  85.5  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>