41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4293 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4293  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  420  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7315  hypothetical protein  98.1 
 
 
211 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6571  hypothetical protein  96.21 
 
 
211 aa  388  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2009  hypothetical protein  95.73 
 
 
211 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934045  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2602  hypothetical protein  95.26 
 
 
211 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5969  hypothetical protein  88.15 
 
 
211 aa  373  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0666926  normal  0.313175 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1086  hypothetical protein  61.84 
 
 
210 aa  248  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0524339 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1821  hypothetical protein  57.21 
 
 
212 aa  237  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.071229  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1141  hypothetical protein  63.77 
 
 
210 aa  235  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.826751 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2476  hypothetical protein  63.77 
 
 
210 aa  234  6e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3461  hypothetical protein  58.17 
 
 
211 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.364072  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1987  hypothetical protein  58.17 
 
 
211 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1417  hypothetical protein  58.77 
 
 
213 aa  229  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.0735583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1423  hypothetical protein  57.42 
 
 
213 aa  228  7e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750454  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1421  hypothetical protein  58.77 
 
 
213 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0977119  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1695  hypothetical protein  58.77 
 
 
213 aa  223  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.196685  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4977  hypothetical protein  58.29 
 
 
213 aa  222  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136921 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0916  hypothetical protein  57.49 
 
 
210 aa  222  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1643  hypothetical protein  52.66 
 
 
210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1178  hypothetical protein  55.77 
 
 
213 aa  218  5e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2113  hypothetical protein  56.94 
 
 
212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0256952  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2166  hypothetical protein  52.66 
 
 
210 aa  211  7.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1069  hypothetical protein  53.14 
 
 
210 aa  210  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0930  hypothetical protein  54.85 
 
 
208 aa  208  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.261483 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3709  glycoside hydrolase family protein  51.94 
 
 
208 aa  207  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3168  hypothetical protein  52.13 
 
 
213 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.0129313 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2890  hypothetical protein  51.69 
 
 
213 aa  200  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0594932  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_004310  BR0598  hypothetical protein  51.4 
 
 
210 aa  198  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799803  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1350  hypothetical protein  49.29 
 
 
211 aa  194  8.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00122834  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3904  hypothetical protein  53.4 
 
 
210 aa  181  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0273  hypothetical protein  49.76 
 
 
208 aa  179  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3129  hypothetical protein  43.69 
 
 
779 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416541  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1311  hypothetical protein  39.32 
 
 
198 aa  153  2e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000230113  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1992  hypothetical protein  49.03 
 
 
774 aa  143  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0145174  hitchhiker  0.0070387 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0796  hypothetical protein  39.71 
 
 
196 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0528  hypothetical protein  32.52 
 
 
199 aa  122  4e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0500  hypothetical protein  31.07 
 
 
199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4083  hypothetical protein  37.16 
 
 
195 aa  95.1  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216019  normal  0.0137038 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7154  hypothetical protein  34.3 
 
 
207 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0442341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1644  hypothetical protein  37.78 
 
 
204 aa  85.1  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2727  putative phage associated protein  27.21 
 
 
202 aa  48.1  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000109744  normal  0.0231233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>