21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2727 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2727  putative phage associated protein  100 
 
 
202 aa  417  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000109744  normal  0.0231233 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3055  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  60.2 
 
 
202 aa  261  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2728  hypothetical protein  43.48 
 
 
752 aa  74.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00269441  normal  0.0201961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1644  hypothetical protein  28 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3054  hypothetical protein  36.26 
 
 
754 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3129  hypothetical protein  27.46 
 
 
779 aa  53.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416541  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1695  hypothetical protein  27.62 
 
 
213 aa  52  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.196685  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1421  hypothetical protein  27.07 
 
 
213 aa  52  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0977119  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0930  hypothetical protein  25.84 
 
 
208 aa  48.1  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.261483 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0273  hypothetical protein  24.37 
 
 
208 aa  48.1  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1313  hypothetical protein  32.63 
 
 
127 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0528  hypothetical protein  23.03 
 
 
199 aa  47  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1086  hypothetical protein  27.12 
 
 
210 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0524339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1417  hypothetical protein  25.97 
 
 
213 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.0735583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1987  hypothetical protein  25 
 
 
211 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3709  glycoside hydrolase family protein  24.61 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1423  hypothetical protein  26.34 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750454  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2166  hypothetical protein  27.48 
 
 
210 aa  42.4  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1311  hypothetical protein  25.9 
 
 
198 aa  42  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000230113  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1821  hypothetical protein  25.4 
 
 
212 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.071229  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4977  hypothetical protein  24.29 
 
 
213 aa  41.6  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>