40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2728 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3054  hypothetical protein  61.22 
 
 
754 aa  955    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2728  hypothetical protein  100 
 
 
752 aa  1547    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00269441  normal  0.0201961 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1072  hypothetical protein  36.38 
 
 
1306 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0995947 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3714  hypothetical protein  36.14 
 
 
1117 aa  332  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1089  hypothetical protein  36.22 
 
 
1297 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.466235  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2479  putative phage host specificity protein  36.6 
 
 
1296 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0792  gene transfer agent (GTA) like protein  35.45 
 
 
1313 aa  313  5.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.780926 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0919  gene transfer agent (GTA) like protein  34.37 
 
 
1286 aa  312  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1144  putative phage host specificity protein  36.14 
 
 
1296 aa  310  8e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383644  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3077  gene transfer agent (GTA) like protein  39.53 
 
 
996 aa  300  7e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.759421  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0270  gene transfer agent (GTA) like protein  34.21 
 
 
1339 aa  300  9e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.67619  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2887  putative phage host specificity protein  33.75 
 
 
1296 aa  293  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0568102  normal  0.211291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6574  gene transfer agent (GTA) like protein  33.59 
 
 
1300 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2012  gene transfer agent (GTA) like protein  33.44 
 
 
1300 aa  284  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190757  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4296  gene transfer agent (GTA) like protein  33.72 
 
 
1301 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7312  gene transfer agent (GTA) like protein  32.85 
 
 
1300 aa  283  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1354  gene transfer agent (GTA) orfg15  32.29 
 
 
1263 aa  281  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678989  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1993  gene transfer agent (GTA) orfg15  33.86 
 
 
1283 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.263252  normal  0.679187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5975  gene transfer agent (GTA) like protein  33.8 
 
 
1301 aa  280  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161454 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0933  gene transfer agent (GTA) orfg15  33.28 
 
 
1252 aa  279  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.264711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3458  gene transfer agent (GTA) orfg15  33.07 
 
 
1297 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384127  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3901  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  33.23 
 
 
1279 aa  276  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75252  normal  0.0322249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2599  gene transfer agent (GTA) like protein  32.81 
 
 
1301 aa  274  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0600  hypothetical protein  34.13 
 
 
1287 aa  273  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1181  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  33.28 
 
 
1285 aa  273  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2163  hypothetical protein  33.44 
 
 
1305 aa  272  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2122  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  33.92 
 
 
1290 aa  267  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0264351  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1426  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  32.87 
 
 
1284 aa  267  7e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1824  gene transfer agent (GTA) orfg15  33.39 
 
 
1280 aa  259  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51325  normal  0.391339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1418  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  32.36 
 
 
1302 aa  246  9e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170545  normal  0.0550012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3171  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  31.3 
 
 
1300 aa  244  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.997359  normal  0.0327353 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1692  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  31.59 
 
 
1302 aa  239  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281256  normal  0.701211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1414  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  30.82 
 
 
1300 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186863  normal  0.0805686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4980  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  30.42 
 
 
1302 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661116 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1646  hypothetical protein  32.72 
 
 
1483 aa  193  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.734787 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0253  hypothetical protein  24.8 
 
 
1206 aa  173  1e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0836  hypothetical protein  24.47 
 
 
1201 aa  159  2e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0382  hypothetical protein  28.89 
 
 
1111 aa  133  1.0000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2727  putative phage associated protein  43.48 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000109744  normal  0.0231233 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3055  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  38.78 
 
 
202 aa  67  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>