41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1992 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1992  hypothetical protein  100 
 
 		 774 aa  1520    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0145174  hitchhiker  0.0070387 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3129  hypothetical protein  55.79 
 
 		 779 aa  802    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416541  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0930  hypothetical protein  48.79 
 
 		 208 aa  174  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.261483 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1086  hypothetical protein  48.56 
 
 		 210 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0524339 
 
 
-
 
NC_004310  BR0598  hypothetical protein  48.11 
 
 		 210 aa  164  8.000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799803  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1141  hypothetical protein  50.24 
 
 		 210 aa  163  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.826751 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2476  hypothetical protein  50.24 
 
 		 210 aa  163  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1987  hypothetical protein  47.14 
 
 		 211 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1069  hypothetical protein  46.45 
 
 		 210 aa  161  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1821  hypothetical protein  44.55 
 
 		 212 aa  161  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.071229  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2890  hypothetical protein  49.04 
 
 		 213 aa  160  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0594932  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5969  hypothetical protein  48.06 
 
 		 211 aa  157  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0666926  normal  0.313175 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3461  hypothetical protein  46.19 
 
 		 211 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.364072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6571  hypothetical protein  48.79 
 
 		 211 aa  156  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0916  hypothetical protein  45.93 
 
 		 210 aa  155  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2602  hypothetical protein  48.06 
 
 		 211 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4293  hypothetical protein  49.03 
 
 		 211 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1350  hypothetical protein  44.17 
 
 		 211 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00122834  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1417  hypothetical protein  45.89 
 
 		 213 aa  155  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.0735583 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1695  hypothetical protein  45.89 
 
 		 213 aa  154  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.196685  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7315  hypothetical protein  48.06 
 
 		 211 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26464  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1421  hypothetical protein  44.44 
 
 		 213 aa  152  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0977119  normal  0.124589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2009  hypothetical protein  48.06 
 
 		 211 aa  151  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934045  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2166  hypothetical protein  43.96 
 
 		 210 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3904  hypothetical protein  46.89 
 
 		 210 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1178  hypothetical protein  43.13 
 
 		 213 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1423  hypothetical protein  44.34 
 
 		 213 aa  146  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750454  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3709  glycoside hydrolase family protein  43.2 
 
 		 208 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1643  hypothetical protein  41.35 
 
 		 210 aa  144  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3168  hypothetical protein  42.38 
 
 		 213 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.0129313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4977  hypothetical protein  44.98 
 
 		 213 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2113  hypothetical protein  45.19 
 
 		 212 aa  138  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0256952  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1311  hypothetical protein  35.61 
 
 		 198 aa  132  2.0000000000000002e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000230113  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0273  hypothetical protein  40.29 
 
 		 208 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0796  hypothetical protein  37.56 
 
 		 196 aa  109  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0528  hypothetical protein  28.29 
 
 		 199 aa  91.3  6e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0500  hypothetical protein  27.32 
 
 		 199 aa  81.6  0.00000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7154  hypothetical protein  31.4 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0442341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4083  hypothetical protein  34.43 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216019  normal  0.0137038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1644  hypothetical protein  33.68 
 
 		 204 aa  59.7  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2727  putative phage associated protein  25.76 
 
 		 202 aa  45.4  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000109744  normal  0.0231233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>