More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0240 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0240  nucleotidyl transferase  100 
 
 
251 aa  506  9.999999999999999e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.392269 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0959  Nucleotidyl transferase  63.35 
 
 
253 aa  311  5.999999999999999e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1720  nucleotidyl transferase  37.41 
 
 
296 aa  166  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0056  nucleotidyl transferase  37.5 
 
 
263 aa  142  6e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1829  nucleotidyl transferase  32 
 
 
299 aa  132  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343974  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.64 
 
 
357 aa  118  9e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.17 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.67 
 
 
354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.58 
 
 
356 aa  116  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.47 
 
 
355 aa  112  5e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  30.67 
 
 
355 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.23 
 
 
364 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.36 
 
 
357 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.15 
 
 
357 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.15 
 
 
358 aa  109  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.05 
 
 
355 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.1 
 
 
353 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.77 
 
 
355 aa  106  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1811  UDP-glucose pyrophosphorylase  33.95 
 
 
255 aa  105  9e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.13 
 
 
355 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.74 
 
 
356 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.46 
 
 
355 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.15 
 
 
357 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  30.13 
 
 
355 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.15 
 
 
357 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.64 
 
 
355 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  29.44 
 
 
358 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.92 
 
 
356 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.29 
 
 
358 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.63 
 
 
357 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.47 
 
 
355 aa  99.4  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.87 
 
 
355 aa  99.8  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.34 
 
 
357 aa  98.6  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.92 
 
 
355 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.06 
 
 
376 aa  96.3  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1503  nucleotidyl transferase  29.24 
 
 
272 aa  96.3  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00096925  normal  0.777811 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.88 
 
 
344 aa  95.5  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.09 
 
 
286 aa  95.1  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  29.67 
 
 
396 aa  95.5  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.55 
 
 
358 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  29.22 
 
 
365 aa  95.1  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.1 
 
 
355 aa  94.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.1 
 
 
355 aa  94  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  28.97 
 
 
291 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  31.6 
 
 
257 aa  93.2  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1059  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.17 
 
 
291 aa  92.8  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.03 
 
 
359 aa  91.7  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1151  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.16 
 
 
302 aa  90.9  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109052  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.28 
 
 
349 aa  90.9  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.15 
 
 
354 aa  90.9  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  30.12 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.35 
 
 
354 aa  90.5  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3810  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.76 
 
 
292 aa  89.7  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  29.72 
 
 
247 aa  89.4  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1570  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.96 
 
 
294 aa  89  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2760  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.13 
 
 
293 aa  89  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1540  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.96 
 
 
294 aa  89  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.53 
 
 
357 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2597  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.02 
 
 
297 aa  88.6  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2813  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.18 
 
 
307 aa  87.8  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.97 
 
 
397 aa  87.8  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.6 
 
 
351 aa  87.8  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  29.63 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1798  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.6 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1970  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.44 
 
 
290 aa  87  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2537  UDP-glucose pyrophosphorylase  32.27 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.619652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  27.35 
 
 
330 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2075  nucleotidyl transferase  26.52 
 
 
273 aa  87  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.63 
 
 
297 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0872  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.63 
 
 
297 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0774  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  27.13 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.38 
 
 
296 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1612  UDP-glucose pyrophosphorylase  26.79 
 
 
290 aa  85.9  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0843  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.63 
 
 
297 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0237145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1783  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.29 
 
 
293 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3407  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.42 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5423  nucleotidyl transferase  25.09 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0702  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.62 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3965  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.49 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1296  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.72 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0208  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.34 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0752  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.84 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0565  UDP-glucose pyrophosphorylase  31.2 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.92302  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2955  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.68 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  33.06 
 
 
400 aa  84  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  27.94 
 
 
393 aa  84  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0406  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.77 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3469  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.26 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.300387  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0879  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.27 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00988  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.87 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4021  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.25 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401685  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1462  UDP-glucose pyrophosphorylase  31.37 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.430614  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0684  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase protein  27.45 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1079  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.9 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857116  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5449  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.36 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.784502  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3107  nucleotidyl transferase  29.6 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655372  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0054  Nucleotidyl transferase  28.69 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1681  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.29 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.180776  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2354  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.82 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0465  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.57 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.021215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>