More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0959 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0959  Nucleotidyl transferase  100 
 
 
253 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0240  nucleotidyl transferase  63.35 
 
 
251 aa  311  5.999999999999999e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.392269 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1720  nucleotidyl transferase  38.14 
 
 
296 aa  180  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0056  nucleotidyl transferase  39.44 
 
 
263 aa  149  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1829  nucleotidyl transferase  31.56 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343974  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  30.09 
 
 
355 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.55 
 
 
354 aa  108  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.42 
 
 
358 aa  108  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.8 
 
 
356 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.55 
 
 
355 aa  106  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.52 
 
 
357 aa  105  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  29.32 
 
 
358 aa  105  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.84 
 
 
356 aa  105  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.84 
 
 
357 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.23 
 
 
357 aa  103  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.94 
 
 
355 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1503  nucleotidyl transferase  30.55 
 
 
272 aa  103  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00096925  normal  0.777811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.23 
 
 
355 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.74 
 
 
355 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  29.55 
 
 
396 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.02 
 
 
357 aa  100  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1811  UDP-glucose pyrophosphorylase  32.36 
 
 
255 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.84 
 
 
357 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.84 
 
 
357 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.66 
 
 
353 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.94 
 
 
355 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.78 
 
 
358 aa  99.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  27.64 
 
 
355 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.53 
 
 
355 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.63 
 
 
357 aa  97.1  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.25 
 
 
364 aa  96.7  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.24 
 
 
376 aa  96.3  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  30.12 
 
 
403 aa  95.1  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.4 
 
 
355 aa  94.7  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.21 
 
 
355 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.4 
 
 
355 aa  95.1  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.57 
 
 
344 aa  94.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.32 
 
 
355 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.76 
 
 
349 aa  94  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2075  nucleotidyl transferase  30 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.79 
 
 
359 aa  92.4  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.24 
 
 
397 aa  92.4  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  28.17 
 
 
365 aa  92  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  30.33 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0129  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.91 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.74 
 
 
286 aa  90.5  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.83 
 
 
358 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0372  UDP-glucose pyrophosphorylase  32.08 
 
 
304 aa  90.1  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  28.23 
 
 
399 aa  89.7  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  30.12 
 
 
391 aa  89  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.13 
 
 
354 aa  89  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  28.74 
 
 
411 aa  88.6  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5423  nucleotidyl transferase  28.78 
 
 
273 aa  88.6  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25 
 
 
356 aa  88.2  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0565  UDP-glucose pyrophosphorylase  31.65 
 
 
291 aa  87.4  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.92302  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1627  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.23 
 
 
287 aa  87  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  28.34 
 
 
400 aa  86.7  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1570  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.69 
 
 
294 aa  87  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0406  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.07 
 
 
299 aa  86.7  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1121  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.06 
 
 
295 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.24 
 
 
355 aa  87  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1540  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.69 
 
 
294 aa  87  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1181  nucleotidyl transferase  28.08 
 
 
246 aa  87  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0563368  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
248 aa  86.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.91 
 
 
355 aa  85.9  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4514  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.12 
 
 
294 aa  85.9  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182838  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1151  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.62 
 
 
302 aa  85.5  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109052  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  28.16 
 
 
245 aa  85.1  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.92 
 
 
354 aa  85.1  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2907  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.54 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  27.8 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2905  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.42 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0966738  hitchhiker  0.0003639 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2953  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.17 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  30.04 
 
 
325 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3107  nucleotidyl transferase  28.3 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655372  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2237  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  28.87 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.21 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4740  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.17 
 
 
295 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0459455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1296  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.97 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  28.16 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2073  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.08 
 
 
296 aa  84  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0184  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.17 
 
 
296 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  29.03 
 
 
399 aa  84  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1064  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  27.56 
 
 
275 aa  84  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.936196  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5050  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.17 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80239  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23880  UDP-glucose pyrophosphorylase  29.64 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  27.87 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.61 
 
 
357 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5063  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.17 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1011  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.9 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0541  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.3 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1267  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.42 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  27.34 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2571  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.05 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185896 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0884  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.9 
 
 
304 aa  82.4  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1440  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.27 
 
 
291 aa  82  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1115  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.81 
 
 
245 aa  82  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1798  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.2 
 
 
287 aa  82  0.000000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0493  UDP-glucose pyrophosphorylase  25.72 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.214401  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2524  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.98 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>