145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0465 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0465  CarD family transcriptional regulator  100 
 
 		 164 aa  328  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3093  transcriptional regulator, CarD family  73.78 
 
 		 164 aa  247  7e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136754 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0170  CarD family transcriptional regulator  54.32 
 
 		 167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2613  transcriptional regulator, CarD family  35.57 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0399  transcriptional regulator, CarD family  31.41 
 
 		 159 aa  88.2  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00433509  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2489  CarD family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00883814  normal  0.0681247 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0173  transcriptional regulator, CarD family  25.48 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0184  CarD family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000461905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00900  transcriptional regulator, CarD family  28.12 
 
 		 176 aa  84.3  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.92061e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0259  transcriptional regulator, CarD family  28.76 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000116082  normal  0.0229238 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0185  CarD family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 158 aa  84  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164199  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0164  transcriptional regulator, CarD family  27.56 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.475576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0340  transcriptional regulator, CarD family  28.47 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.18012  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2940  CarD family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1687  transcriptional regulator, CarD family  28.87 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal  0.385121 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0392  transcriptional regulator, CarD family  28.89 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000362697  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1901  transcriptional regulator, CarD family  26.11 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.488949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2124  transcriptional regulator, CarD family  24.53 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0696719  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3091  CarD family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 266 aa  65.1  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0553  CarD family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.106892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4262  transcription factor CarD  23.9 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4692  CarD family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0703  transcriptional regulator, CarD family  24.36 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0540347  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0751  transcriptional_regulator  27.67 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3201  transcriptional regulator, CarD family  24.39 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2077  transcriptional regulator, CarD family  22.64 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.90671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4522  transcriptional regulator, CarD family  27.46 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76792  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4319  transcriptional regulator, CarD family  23.72 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0501  CarD family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0651  transcriptional regulator, CarD family  23.72 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0963  CarD family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2907  CarD family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0078  CarD family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2498  CarD family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860997  hitchhiker  0.00028149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1271  CarD family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0355661  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0601  transcriptional regulator, CarD family  24.84 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3655  CarD family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000563805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2592  transcriptional regulator, CarD family  27.34 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0112448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2685  transcriptional regulator, CarD family  27.34 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000114953  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2290  transcriptional regulator, putative  24.65 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03720  transcriptional regulator, CarD family  24.03 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4857  CarD family transcriptional regulator  21.02 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3388  CarD family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3335  CarD family transcriptional regulator  20.53 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4851  transcriptional regulator, CarD family  21.02 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.906261  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0142  transcriptional regulator, CarD family  22.01 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.432895  normal  0.208842 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4352  transcriptional regulator CarD family  27.27 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3708  CarD family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1245  transcriptional regulator, CarD family  21.6 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000622315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4465  CarD family transcriptional regulator  21.02 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4740  CarD family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4826  CarD family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.652741  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5126  CarD family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.593452 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0598  CarD-like protein  28.12 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.80876 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4143  transcriptional regulator, CarD family  26.62 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239678  normal  0.0810654 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3814  transcriptional regulator, CarD family  26.62 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4190  transcriptional regulator, CarD family  26.88 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.627659  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3676  CarD family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03770  transcriptional regulator, CarD family  22.3 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0832449  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3880  transcription factor CarD  26.88 
 
 		 196 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal  0.0799721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4337  transcriptional regulator, CarD family  26.88 
 
 		 198 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_004310  BR1766  transcriptional regulator, putative  26.62 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000100794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4447  CarD family transcriptional regulator  21.02 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.948938  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09270  transcriptional regulator, CarD family  22.46 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2296  CarD family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000229013  normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4040  CarD family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1702  putative transcriptional regulator  26.62 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000176532  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13616  transcription factor  23.91 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4833  transcriptional regulator, CarD family  21.02 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31820  transcriptional regulator, CarD family  21.02 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0364  transcriptional regulator, CarD family  21.79 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0576  CarD family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.0000000000504519  unclonable  0.0000000218406 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0898  transcriptional regulator, CarD family  21.66 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1134  CarD family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000250032  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35090  transcriptional regulator, CarD family  22.46 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.86286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5340  CarD family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1561  CarD family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0294353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1444  CarD family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0773  transcriptional regulator, CarD family  21.02 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164526  normal  0.216229 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0359  putative transcription factor  27.4 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0436176  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2959  transcriptional regulator, CarD family  21.02 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3112  CarD family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0000522164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0187  CarD family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4255  CarD family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0362  CarD family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0755625  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0490  transcriptional regulator, CarD family  31.21 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00257809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0970  transcription factor CarD  22.29 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0421613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4805  CarD family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0268969  hitchhiker  0.000256244 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2821  CarD family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0104  putative transcriptional regulator  24.48 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1065  CarD family transcriptional regulator  19.87 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0695746  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3438  CarD family transcriptional regulator  20.53 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.270269  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3401  CarD family transcriptional regulator  20.53 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3350  CarD family transcriptional regulator  20.53 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3708  CarD family transcriptional regulator  20.53 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3379  CarD family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818177  n/a   
 
 
 
NC_009952  Dshi_0786  transcriptional regulator  26.57 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000100342  normal  0.0526342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3681  transcriptional regulator, CarD family  20.53 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0786327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1560  transcriptional regulator, CarD family  19.87 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.879343  normal  0.22005 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3658  transcriptional regulator, CarD family  20.53 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>