118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0170 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0170  CarD family transcriptional regulator  100 
 
 		 167 aa  342  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0465  CarD family transcriptional regulator  54.32 
 
 		 164 aa  178  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3093  transcriptional regulator, CarD family  52.47 
 
 		 164 aa  171  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136754 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00900  transcriptional regulator, CarD family  25.15 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.92061e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0259  transcriptional regulator, CarD family  30.07 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000116082  normal  0.0229238 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2613  transcriptional regulator, CarD family  33.81 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0164  transcriptional regulator, CarD family  26.45 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.475576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0392  transcriptional regulator, CarD family  26.62 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000362697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2489  CarD family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00883814  normal  0.0681247 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0185  CarD family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164199  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0399  transcriptional regulator, CarD family  27.67 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00433509  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0173  transcriptional regulator, CarD family  23.74 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0184  CarD family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000461905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0340  transcriptional regulator, CarD family  23.02 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.18012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2124  transcriptional regulator, CarD family  24.22 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0696719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4447  CarD family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.948938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1687  transcriptional regulator, CarD family  26.81 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal  0.385121 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4833  transcriptional regulator, CarD family  23.12 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4465  CarD family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2498  CarD family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860997  hitchhiker  0.00028149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1271  CarD family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0355661  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2592  transcriptional regulator, CarD family  25.79 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0112448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2685  transcriptional regulator, CarD family  25.79 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000114953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2940  CarD family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4611  CarD family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3655  CarD family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000563805  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2290  transcriptional regulator, putative  22.54 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4857  CarD family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4967  CarD family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0352786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4851  transcriptional regulator, CarD family  22.5 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.906261  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1901  transcriptional regulator, CarD family  25.36 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.488949  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2907  CarD family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5340  CarD family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1444  CarD family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0142  transcriptional regulator, CarD family  25.79 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.432895  normal  0.208842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0501  CarD family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0963  CarD family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2880  CarD family transcriptional regulator  21.28 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0553  CarD family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.106892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4740  CarD family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4826  CarD family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.652741  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5126  CarD family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.593452 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13616  transcription factor  24.2 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3201  transcriptional regulator, CarD family  22.62 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0703  transcriptional regulator, CarD family  24.36 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0540347  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0866  transcriptional regulator, CarD family  25.18 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.795809 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0751  transcriptional_regulator  25 
 
 		 197 aa  53.9  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024387  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4319  transcriptional regulator, CarD family  25.32 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4262  transcription factor CarD  23.75 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3388  CarD family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4692  CarD family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0970  transcription factor CarD  24.36 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0421613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2164  transcriptional regulator, CarD family  21.28 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1065  CarD family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0695746  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3814  transcriptional regulator, CarD family  23.03 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4143  transcriptional regulator, CarD family  23.03 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239678  normal  0.0810654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4522  transcriptional regulator, CarD family  24.46 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1245  transcriptional regulator, CarD family  20.25 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000622315  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0364  transcriptional regulator, CarD family  22.93 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4255  CarD family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0362  CarD family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0755625  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3676  CarD family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0104  putative transcriptional regulator  22.14 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0651  transcriptional regulator, CarD family  23.08 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35090  transcriptional regulator, CarD family  22.93 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.86286 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03720  transcriptional regulator, CarD family  23.08 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31820  transcriptional regulator, CarD family  21.79 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3091  CarD family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 266 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3335  CarD family transcriptional regulator  20.28 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4546  CarD family transcriptional regulator  21.25 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03770  transcriptional regulator, CarD family  22.3 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0832449  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09270  transcriptional regulator, CarD family  22.44 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0601  transcriptional regulator, CarD family  23.02 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3038  transcriptional regulator, CarD family  28.78 
 
 		 404 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.175177  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2959  transcriptional regulator, CarD family  21.79 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4827  transcriptional regulator, CarD family  21.25 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0773  transcriptional regulator, CarD family  21.79 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164526  normal  0.216229 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2944  transcriptional regulator, CarD family  28.78 
 
 		 404 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.070687  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3244  CarD family transcriptional regulator  25 
 
 		 155 aa  48.1  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0898  transcriptional regulator, CarD family  22.44 
 
 		 160 aa  48.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2786  CarD family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 364 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0756679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3112  CarD family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 189 aa  47.8  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0000522164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4352  transcriptional regulator CarD family  22.29 
 
 		 223 aa  47.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2077  transcriptional regulator, CarD family  21.79 
 
 		 161 aa  47.4  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.90671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0247  CarD family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 175 aa  47.4  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.246568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0726  CarD family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0852  transcriptional regulator, CarD family  21.79 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2129  CarD family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000417327  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2857  CarD family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 399 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.031457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3756  transcriptional regulator, CarD family  20.28 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1560  transcriptional regulator, CarD family  20.28 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.879343  normal  0.22005 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3438  CarD family transcriptional regulator  20.98 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.270269  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3401  CarD family transcriptional regulator  20.98 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3350  CarD family transcriptional regulator  20.98 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3708  CarD family transcriptional regulator  20.98 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0663  transcriptional regulator, CarD family  22.46 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.471723  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2296  CarD family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000229013  normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3681  transcriptional regulator, CarD family  20.98 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0786327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3658  transcriptional regulator, CarD family  20.98 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4112  CarD family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00258914  normal  0.616295 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>