144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2786 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_2786  CarD family transcriptional regulator  100 
 
 		 364 aa  687    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0756679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2944  transcriptional regulator, CarD family  82.65 
 
 		 404 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.070687  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3038  transcriptional regulator, CarD family  82.65 
 
 		 404 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.175177  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2857  CarD family transcriptional regulator  83.49 
 
 		 399 aa  348  9e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.031457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2498  CarD family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 171 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860997  hitchhiker  0.00028149 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2290  transcriptional regulator, putative  32.9 
 
 		 208 aa  97.1  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1271  CarD family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 171 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0355661  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2592  transcriptional regulator, CarD family  34.51 
 
 		 171 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0112448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2685  transcriptional regulator, CarD family  34.51 
 
 		 171 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000114953  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4522  transcriptional regulator, CarD family  35.86 
 
 		 162 aa  92.8  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76792  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1516  transcriptional regulator, CarD family  25.75 
 
 		 191 aa  85.1  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0392  transcriptional regulator, CarD family  34.29 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000362697  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2425  CarD family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 169 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.0000259686  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0553  CarD family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.106892 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1089  CarD family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 169 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1557  CarD family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 169 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00900  transcriptional regulator, CarD family  29.09 
 
 		 176 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.92061e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0164  transcriptional regulator, CarD family  27.5 
 
 		 161 aa  78.2  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.475576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0576  CarD family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 169 aa  77.8  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.0000000000504519  unclonable  0.0000000218406 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1825  CarD family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  unclonable  0.00000000000495809  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0340  transcriptional regulator, CarD family  30.5 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.18012  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0786  transcriptional regulator  28.83 
 
 		 170 aa  75.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000100342  normal  0.0526342 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0184  CarD family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 158 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000461905  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3091  CarD family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2821  CarD family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0104  putative transcriptional regulator  29.17 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0185  CarD family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164199  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1371  transcriptional regulator, CarD family  28.06 
 
 		 456 aa  73.2  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0726  CarD family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 160 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0852  transcriptional regulator, CarD family  30.66 
 
 		 160 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4857  CarD family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0703  transcriptional regulator, CarD family  32.12 
 
 		 160 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0540347  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0142  transcriptional regulator, CarD family  33.99 
 
 		 161 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.432895  normal  0.208842 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4851  transcriptional regulator, CarD family  28.21 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.906261  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2940  CarD family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3438  CarD family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.270269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3350  CarD family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3708  CarD family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0970  transcription factor CarD  27.39 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0421613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3335  CarD family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3658  transcriptional regulator, CarD family  29.49 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4447  CarD family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.948938  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4255  CarD family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1694  CarD family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.132221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0362  CarD family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0755625  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0601  transcriptional regulator, CarD family  30.77 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0598  CarD-like protein  29.94 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.80876 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35090  transcriptional regulator, CarD family  31.41 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.86286 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4833  transcriptional regulator, CarD family  28.21 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3401  CarD family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4465  CarD family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13616  transcription factor  30.77 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3681  transcriptional regulator, CarD family  29.49 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0786327  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5340  CarD family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 162 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03720  transcriptional regulator, CarD family  29.41 
 
 		 160 aa  68.9  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3388  CarD family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 159 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2907  CarD family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 160 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4740  CarD family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 162 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4826  CarD family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 162 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.652741  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4319  transcriptional regulator, CarD family  29.75 
 
 		 160 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5126  CarD family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 162 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.593452 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1444  CarD family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 162 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0259  transcriptional regulator, CarD family  26.8 
 
 		 158 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000116082  normal  0.0229238 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0751  transcriptional_regulator  28.48 
 
 		 197 aa  68.6  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024387  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3308  CarD family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178714  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4040  CarD family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 161 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3708  CarD family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.378672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0773  transcriptional regulator, CarD family  30 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164526  normal  0.216229 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2077  transcriptional regulator, CarD family  29.2 
 
 		 161 aa  67.4  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.90671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0364  transcriptional regulator, CarD family  30.13 
 
 		 162 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0501  CarD family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03770  transcriptional regulator, CarD family  30.07 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0832449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1718  transcriptional regulator, CarD family  29.5 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0412  transcription factor CarD  28.06 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.595911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1560  transcriptional regulator, CarD family  28.21 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.879343  normal  0.22005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4262  transcription factor CarD  32.68 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4692  CarD family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09270  transcriptional regulator, CarD family  29.41 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4337  transcriptional regulator, CarD family  30.22 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3676  CarD family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 158 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0399  transcriptional regulator, CarD family  29.94 
 
 		 159 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00433509  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0278  transcription factor CarD  28.06 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1065  CarD family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 153 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0695746  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1687  transcriptional regulator, CarD family  27.78 
 
 		 171 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal  0.385121 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3756  transcriptional regulator, CarD family  26.97 
 
 		 158 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1766  transcriptional regulator, putative  26.81 
 
 		 191 aa  65.1  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000100794  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2489  CarD family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 158 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00883814  normal  0.0681247 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0507  CarD family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0122387  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2959  transcriptional regulator, CarD family  29.2 
 
 		 160 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1702  putative transcriptional regulator  26.81 
 
 		 191 aa  65.1  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000176532  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1901  transcriptional regulator, CarD family  30.72 
 
 		 159 aa  65.1  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.488949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0551  CarD family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207185  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0124  CarD family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 174 aa  64.7  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0548  CarD family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.300109  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0898  transcriptional regulator, CarD family  31.17 
 
 		 160 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3880  transcription factor CarD  30.22 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal  0.0799721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4190  transcriptional regulator, CarD family  30.22 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.627659  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2164  transcriptional regulator, CarD family  26.39 
 
 		 153 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31820  transcriptional regulator, CarD family  29.2 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0866  transcriptional regulator, CarD family  31.85 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.795809 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>