152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2613 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2613  transcriptional regulator, CarD family  100 
 
 		 163 aa  322  1e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0392  transcriptional regulator, CarD family  38.56 
 
 		 158 aa  99  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000362697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2489  CarD family transcriptional regulator  40 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00883814  normal  0.0681247 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0184  CarD family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000461905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2164  transcriptional regulator, CarD family  32.45 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3676  CarD family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0465  CarD family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3335  CarD family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0185  CarD family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 158 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0259  transcriptional regulator, CarD family  37.97 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000116082  normal  0.0229238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0963  CarD family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0164  transcriptional regulator, CarD family  37.58 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.475576  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2880  CarD family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 158 aa  87.8  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4255  CarD family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 160 aa  87.4  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0501  CarD family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 163 aa  87.4  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0362  CarD family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 160 aa  87.4  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0755625  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4319  transcriptional regulator, CarD family  35.33 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0703  transcriptional regulator, CarD family  35.33 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0540347  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0340  transcriptional regulator, CarD family  30.07 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.18012  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03770  transcriptional regulator, CarD family  35.44 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0832449  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3093  transcriptional regulator, CarD family  35.33 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35090  transcriptional regulator, CarD family  37.01 
 
 		 163 aa  86.3  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.86286 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0399  transcriptional regulator, CarD family  37.09 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00433509  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2907  CarD family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1687  transcriptional regulator, CarD family  35.77 
 
 		 171 aa  85.5  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal  0.385121 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00900  transcriptional regulator, CarD family  35 
 
 		 176 aa  85.1  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.92061e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1560  transcriptional regulator, CarD family  30.46 
 
 		 158 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.879343  normal  0.22005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0651  transcriptional regulator, CarD family  35.57 
 
 		 160 aa  84  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1065  CarD family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 153 aa  84  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0695746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3756  transcriptional regulator, CarD family  30.46 
 
 		 158 aa  84  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4040  CarD family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0173  transcriptional regulator, CarD family  28.39 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0364  transcriptional regulator, CarD family  35.71 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3438  CarD family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.270269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3350  CarD family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3708  CarD family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0124  CarD family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3244  CarD family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3658  transcriptional regulator, CarD family  30.46 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3401  CarD family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0278  transcription factor CarD  35.14 
 
 		 432 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3681  transcriptional regulator, CarD family  29.8 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0786327  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1901  transcriptional regulator, CarD family  35.53 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.488949  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0412  transcription factor CarD  34.46 
 
 		 283 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.595911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3537  CarD family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0548  CarD family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.300109  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0170  CarD family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3655  CarD family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000563805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0898  transcriptional regulator, CarD family  34 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0726  CarD family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4262  transcription factor CarD  33.77 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4692  CarD family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0852  transcriptional regulator, CarD family  35.1 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0104  putative transcriptional regulator  30.97 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0247  CarD family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.246568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7543  CarD family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 278 aa  78.2  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.330727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0551  CarD family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 429 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207185  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2940  CarD family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4112  CarD family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00258914  normal  0.616295 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2296  CarD family transcriptional regulator  35 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000229013  normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3308  CarD family transcriptional regulator  34 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178714  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1245  transcriptional regulator, CarD family  29.94 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000622315  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0489  transcriptional regulator, CarD family  32.05 
 
 		 278 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0507  CarD family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0122387  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1134  CarD family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000250032  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0866  transcriptional regulator, CarD family  34.48 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.795809 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0490  transcriptional regulator, CarD family  32.72 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00257809 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1271  CarD family transcriptional regulator  30 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0355661  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5340  CarD family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1444  CarD family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2498  CarD family transcriptional regulator  30 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860997  hitchhiker  0.00028149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0142  transcriptional regulator, CarD family  33.56 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.432895  normal  0.208842 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2592  transcriptional regulator, CarD family  30 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0112448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2685  transcriptional regulator, CarD family  30 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000114953  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1766  transcriptional regulator, putative  33.11 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000100794  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09270  transcriptional regulator, CarD family  35.25 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3379  CarD family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818177  n/a   
 
 
 
NC_009505  BOV_1702  putative transcriptional regulator  33.11 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000176532  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13616  transcription factor  32.47 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1694  CarD family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 350 aa  75.5  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.132221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0187  CarD family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160759  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4857  CarD family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3388  CarD family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4851  transcriptional regulator, CarD family  28.97 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.906261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4447  CarD family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.948938  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2425  CarD family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.0000259686  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4143  transcriptional regulator, CarD family  32.43 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239678  normal  0.0810654 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4740  CarD family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0078  CarD family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4826  CarD family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.652741  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1089  CarD family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5126  CarD family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.593452 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1557  CarD family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3814  transcriptional regulator, CarD family  32.43 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4833  transcriptional regulator, CarD family  28.97 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4465  CarD family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1825  CarD family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  unclonable  0.00000000000495809  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3112  CarD family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 189 aa  73.9  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0000522164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1561  CarD family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0294353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4190  transcriptional regulator, CarD family  32.43 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.627659  normal  0.224383 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>