100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1358 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1358  hypothetical protein  100 
 
 
450 aa  870    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3799  hypothetical protein  61.15 
 
 
417 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3626  hypothetical protein  43.01 
 
 
385 aa  169  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.405616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3731  hypothetical protein  42.36 
 
 
385 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0215  hypothetical protein  40.48 
 
 
390 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0194  hypothetical protein  40.4 
 
 
390 aa  162  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  0.707381 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0141  hypothetical protein  41.67 
 
 
388 aa  160  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2215  hypothetical protein  40.54 
 
 
394 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00110232  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0709  hypothetical protein  32.56 
 
 
380 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0626  hypothetical protein  38.93 
 
 
392 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1165  hypothetical protein  39.85 
 
 
395 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189277  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2531  hypothetical protein  39.94 
 
 
388 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.385418  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4458  hypothetical protein  41.96 
 
 
406 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4313  hypothetical protein  40.99 
 
 
395 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1635  protein of unknown function DUF111  29.4 
 
 
373 aa  149  8e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.165553  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1404  protein of unknown function DUF111  35.9 
 
 
404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3339  hypothetical protein  36.6 
 
 
402 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000998709  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0590  hypothetical protein  38.41 
 
 
411 aa  146  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.297044  hitchhiker  0.000815956 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2351  hypothetical protein  36.56 
 
 
402 aa  145  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4468  protein of unknown function DUF111  40.19 
 
 
395 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0284485  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1820  hypothetical protein  35.43 
 
 
407 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.493848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2031  hypothetical protein  32.7 
 
 
462 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1544  protein of unknown function DUF111  32.24 
 
 
389 aa  143  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3548  hypothetical protein  33.01 
 
 
427 aa  143  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2204  protein of unknown function DUF111  27.91 
 
 
432 aa  142  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05441  hypothetical protein  36.25 
 
 
408 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.307892 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1596  protein of unknown function DUF111  37.38 
 
 
406 aa  141  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1785  hypothetical protein  30.02 
 
 
398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.28441  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4449  protein of unknown function DUF111  35.27 
 
 
395 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.438751  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0528  protein of unknown function DUF111  35.8 
 
 
499 aa  140  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4915  protein of unknown function DUF111  37.31 
 
 
386 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0666  hypothetical protein  39.47 
 
 
387 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.62938  normal  0.89141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3737  hypothetical protein  35.93 
 
 
410 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173337  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0176  hypothetical protein  41.26 
 
 
384 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0652  hypothetical protein  34.09 
 
 
446 aa  136  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1002  hypothetical protein  32.63 
 
 
396 aa  136  8e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2265  hypothetical protein  32.26 
 
 
396 aa  136  9e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46843  predicted protein  35.29 
 
 
455 aa  134  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.190085  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26870  conserved hypothetical protein TIGR00299  40.34 
 
 
525 aa  134  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.487711  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0715  hypothetical protein  37.36 
 
 
390 aa  134  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356802  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1474  hypothetical protein  34.72 
 
 
407 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0123523 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2428  hypothetical protein  37.54 
 
 
401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1783  hypothetical protein  35.82 
 
 
397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00757644  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1719  hypothetical protein  31.6 
 
 
394 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1826  hypothetical protein  29.1 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2512  hypothetical protein  38.28 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0156591 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1915  hypothetical protein  34.98 
 
 
398 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0761  hypothetical protein  36.62 
 
 
396 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000360196 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04881  hypothetical protein  34.08 
 
 
410 aa  127  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.701312 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0175  protein of unknown function DUF111  33.33 
 
 
480 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2692  hypothetical protein  33.33 
 
 
429 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07031  hypothetical protein  35.45 
 
 
410 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2401  hypothetical protein  37.64 
 
 
394 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0488  hypothetical protein  30.29 
 
 
408 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2177  protein of unknown function DUF111  32.54 
 
 
468 aa  123  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0253  hypothetical protein  28.38 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2400  protein of unknown function DUF111  36 
 
 
475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0369  hypothetical protein  31.15 
 
 
407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2415  hypothetical protein  32.07 
 
 
419 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3696  hypothetical protein  32.31 
 
 
419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2227  hypothetical protein  35.34 
 
 
408 aa  120  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2452  hypothetical protein  37.64 
 
 
395 aa  119  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05141  hypothetical protein  27.94 
 
 
410 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2562  protein of unknown function DUF111  32.69 
 
 
458 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210764 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05431  hypothetical protein  27.65 
 
 
410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4211  hypothetical protein  36.48 
 
 
437 aa  116  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2158  hypothetical protein  35.44 
 
 
397 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0168  hypothetical protein  36.75 
 
 
393 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1561  protein of unknown function DUF111  37.97 
 
 
408 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42597  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05511  hypothetical protein  30.97 
 
 
407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.584195  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0766  hypothetical protein  34.39 
 
 
379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31470  hypothetical protein  31.75 
 
 
463 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0903  hypothetical protein  33.26 
 
 
426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2864  protein of unknown function DUF111  31.11 
 
 
395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000578609 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1706  protein of unknown function DUF111  37.14 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1694  hypothetical protein  36.08 
 
 
413 aa  110  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1127  hypothetical protein  36.23 
 
 
392 aa  110  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1782  hypothetical protein  32.63 
 
 
435 aa  107  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.139108  normal  0.205062 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0537  hypothetical protein  33.67 
 
 
435 aa  107  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.968061  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4936  hypothetical protein  31.75 
 
 
420 aa  107  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1654  hypothetical protein  30.73 
 
 
492 aa  106  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.10098 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1273  hypothetical protein  33.55 
 
 
387 aa  103  8e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0274  hypothetical protein  38.55 
 
 
248 aa  100  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1273  hypothetical protein  32.08 
 
 
405 aa  99.8  8e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0339  hypothetical protein  26.45 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0683  hypothetical protein  31.97 
 
 
405 aa  96.7  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0150  hypothetical protein  41.79 
 
 
268 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.647615  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1403  hypothetical protein  30 
 
 
405 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0157  hypothetical protein  30.83 
 
 
411 aa  94.4  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0261  hypothetical protein  31.8 
 
 
396 aa  93.6  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.991646 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1281  hypothetical protein  28.57 
 
 
405 aa  91.3  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6460  hypothetical protein  30.5 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0099  protein of unknown function DUF111  32.46 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.663305  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1214  hypothetical protein  36.36 
 
 
184 aa  63.9  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000810306  normal  0.0630526 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3317  hypothetical protein  24.91 
 
 
391 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  48.89 
 
 
205 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1583  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.76 
 
 
564 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.936512  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42941  predicted protein  28.42 
 
 
461 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0016  hypothetical protein  28.27 
 
 
341 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  51.35 
 
 
443 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.450145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>