100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0141 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0141  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  773    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0194  hypothetical protein  78.92 
 
 		 390 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  0.707381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0215  hypothetical protein  64.95 
 
 		 390 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3626  hypothetical protein  60.93 
 
 		 385 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.405616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3731  hypothetical protein  59.9 
 
 		 385 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0626  hypothetical protein  58.75 
 
 		 392 aa  422  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3163  protein of unknown function DUF111  51.91 
 
 		 394 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2401  hypothetical protein  48.58 
 
 		 394 aa  345  8e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2531  hypothetical protein  50.26 
 
 		 388 aa  342  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.385418  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1544  protein of unknown function DUF111  41.54 
 
 		 389 aa  339  4e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2215  hypothetical protein  46.89 
 
 		 394 aa  323  3e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00110232  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1826  hypothetical protein  43.11 
 
 		 402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3339  hypothetical protein  42.86 
 
 		 402 aa  306  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000998709  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0369  hypothetical protein  41.41 
 
 		 407 aa  305  8.000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2204  protein of unknown function DUF111  39.81 
 
 		 432 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0253  hypothetical protein  41.13 
 
 		 395 aa  301  2e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2512  hypothetical protein  43.78 
 
 		 396 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0156591 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1404  protein of unknown function DUF111  42.89 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1783  hypothetical protein  42.11 
 
 		 397 aa  294  2e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00757644  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3696  hypothetical protein  39.56 
 
 		 419 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2415  hypothetical protein  39.8 
 
 		 419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3548  hypothetical protein  37.59 
 
 		 427 aa  281  9e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2864  protein of unknown function DUF111  39.49 
 
 		 395 aa  280  3e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000578609 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0652  hypothetical protein  36.72 
 
 		 446 aa  279  5e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1165  hypothetical protein  42.89 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189277  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2400  protein of unknown function DUF111  41.97 
 
 		 475 aa  269  5e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2227  hypothetical protein  41.99 
 
 		 408 aa  269  7e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0590  hypothetical protein  41.79 
 
 		 411 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.297044  hitchhiker  0.000815956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3737  hypothetical protein  37.94 
 
 		 410 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1474  hypothetical protein  39.6 
 
 		 407 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0123523 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2692  hypothetical protein  38.76 
 
 		 429 aa  259  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2351  hypothetical protein  40.97 
 
 		 402 aa  257  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1635  protein of unknown function DUF111  38.73 
 
 		 373 aa  257  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.165553  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1278  protein of unknown function DUF111  37.38 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2031  hypothetical protein  44.76 
 
 		 462 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4313  hypothetical protein  43.94 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1719  hypothetical protein  37.4 
 
 		 394 aa  243  6e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4936  hypothetical protein  37.23 
 
 		 420 aa  242  9e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4468  protein of unknown function DUF111  43.24 
 
 		 395 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0284485  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4449  protein of unknown function DUF111  43.51 
 
 		 395 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.438751  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4458  hypothetical protein  41.98 
 
 		 406 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1785  hypothetical protein  40.62 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.28441  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2265  hypothetical protein  35.68 
 
 		 396 aa  233  5e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0715  hypothetical protein  38.26 
 
 		 390 aa  228  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356802  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0168  hypothetical protein  41.05 
 
 		 393 aa  227  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1561  protein of unknown function DUF111  38.21 
 
 		 408 aa  225  9e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42597  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0528  protein of unknown function DUF111  40.36 
 
 		 499 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659474 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0176  hypothetical protein  44.18 
 
 		 384 aa  225  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1002  hypothetical protein  37.31 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0761  hypothetical protein  37.15 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000360196 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1127  hypothetical protein  38.87 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1820  hypothetical protein  34.44 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.493848  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1596  protein of unknown function DUF111  39.85 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05441  hypothetical protein  33.85 
 
 		 408 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.307892 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0903  hypothetical protein  36.07 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04881  hypothetical protein  35.37 
 
 		 410 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.701312 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07031  hypothetical protein  38.5 
 
 		 410 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0150  hypothetical protein  48.15 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.647615  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4915  protein of unknown function DUF111  41.16 
 
 		 386 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1273  hypothetical protein  37.06 
 
 		 387 aa  210  4e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0488  hypothetical protein  32.59 
 
 		 408 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1782  hypothetical protein  41.1 
 
 		 435 aa  206  4e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.139108  normal  0.205062 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0709  hypothetical protein  35.06 
 
 		 380 aa  206  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2562  protein of unknown function DUF111  38.18 
 
 		 458 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210764 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05431  hypothetical protein  32.92 
 
 		 410 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1694  hypothetical protein  37.69 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05511  hypothetical protein  29.93 
 
 		 407 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.584195  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4211  hypothetical protein  38.32 
 
 		 437 aa  203  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1654  hypothetical protein  39.06 
 
 		 492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.10098 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0175  protein of unknown function DUF111  41.32 
 
 		 480 aa  201  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05141  hypothetical protein  31.58 
 
 		 410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0666  hypothetical protein  38.61 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.62938  normal  0.89141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6460  hypothetical protein  37.16 
 
 		 414 aa  190  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2452  hypothetical protein  35.34 
 
 		 395 aa  190  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31470  hypothetical protein  33.26 
 
 		 463 aa  189  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0339  hypothetical protein  30.28 
 
 		 406 aa  187  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0537  hypothetical protein  35.01 
 
 		 435 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.968061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2428  hypothetical protein  36.82 
 
 		 401 aa  186  8e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3317  hypothetical protein  32.3 
 
 		 391 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2158  hypothetical protein  35.01 
 
 		 397 aa  176  8e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2177  protein of unknown function DUF111  38.32 
 
 		 468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26870  conserved hypothetical protein TIGR00299  41.51 
 
 		 525 aa  174  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.487711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0157  hypothetical protein  28.89 
 
 		 411 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0683  hypothetical protein  29.29 
 
 		 405 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1403  hypothetical protein  29.04 
 
 		 405 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1273  hypothetical protein  30.08 
 
 		 405 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1358  hypothetical protein  41.88 
 
 		 450 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955528 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0261  hypothetical protein  33.92 
 
 		 396 aa  170  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.991646 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1281  hypothetical protein  28.07 
 
 		 405 aa  168  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3799  hypothetical protein  37.47 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0766  hypothetical protein  36.09 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1915  hypothetical protein  36.78 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1706  protein of unknown function DUF111  35.42 
 
 		 293 aa  157  4e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0274  hypothetical protein  38.4 
 
 		 248 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46843  predicted protein  45.64 
 
 		 455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.190085  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0099  protein of unknown function DUF111  34.47 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.663305  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0016  hypothetical protein  33.17 
 
 		 341 aa  92.8  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42941  predicted protein  30.93 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1214  hypothetical protein  34.4 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000810306  normal  0.0630526 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1707  hypothetical protein  28.18 
 
 		 120 aa  48.5  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>