100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0715 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0715  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  778    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356802  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0709  hypothetical protein  53.54 
 
 
380 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0766  hypothetical protein  50.13 
 
 
379 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0537  hypothetical protein  45.02 
 
 
435 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.968061  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1915  hypothetical protein  42.56 
 
 
398 aa  249  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0215  hypothetical protein  39.74 
 
 
390 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3626  hypothetical protein  39.37 
 
 
385 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.405616  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2512  hypothetical protein  38.64 
 
 
396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0156591 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3731  hypothetical protein  38.85 
 
 
385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1544  protein of unknown function DUF111  36.36 
 
 
389 aa  233  6e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3339  hypothetical protein  37.31 
 
 
402 aa  232  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000998709  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0194  hypothetical protein  37.11 
 
 
390 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  0.707381 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0253  hypothetical protein  33.78 
 
 
395 aa  229  5e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2215  hypothetical protein  35.93 
 
 
394 aa  225  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00110232  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2864  protein of unknown function DUF111  35.79 
 
 
395 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000578609 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0369  hypothetical protein  34.13 
 
 
407 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0141  hypothetical protein  38.26 
 
 
388 aa  223  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1719  hypothetical protein  33.88 
 
 
394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2401  hypothetical protein  38.92 
 
 
394 aa  219  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1783  hypothetical protein  36.27 
 
 
397 aa  218  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00757644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2204  protein of unknown function DUF111  32.85 
 
 
432 aa  218  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1404  protein of unknown function DUF111  34.46 
 
 
404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0666  hypothetical protein  39.26 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.62938  normal  0.89141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2031  hypothetical protein  39.93 
 
 
462 aa  213  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1474  hypothetical protein  36.67 
 
 
407 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0123523 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3696  hypothetical protein  35.59 
 
 
419 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1694  hypothetical protein  37.59 
 
 
413 aa  210  4e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1826  hypothetical protein  34.56 
 
 
402 aa  209  5e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3163  protein of unknown function DUF111  36.08 
 
 
394 aa  209  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2531  hypothetical protein  35.53 
 
 
388 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.385418  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2415  hypothetical protein  35.52 
 
 
419 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0626  hypothetical protein  37.17 
 
 
392 aa  206  7e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1596  protein of unknown function DUF111  35.9 
 
 
406 aa  205  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2400  protein of unknown function DUF111  34.29 
 
 
475 aa  205  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2692  hypothetical protein  35.91 
 
 
429 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4936  hypothetical protein  35.71 
 
 
420 aa  204  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1785  hypothetical protein  36.36 
 
 
398 aa  202  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.28441  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04881  hypothetical protein  33.5 
 
 
410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.701312 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1165  hypothetical protein  36.87 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189277  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1278  protein of unknown function DUF111  32.47 
 
 
408 aa  199  7e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2227  hypothetical protein  37.43 
 
 
408 aa  199  9e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0652  hypothetical protein  32.39 
 
 
446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2265  hypothetical protein  32.55 
 
 
396 aa  196  6e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05511  hypothetical protein  31.63 
 
 
407 aa  196  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.584195  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0761  hypothetical protein  33.68 
 
 
396 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000360196 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1002  hypothetical protein  30.26 
 
 
396 aa  195  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4313  hypothetical protein  38.15 
 
 
395 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0590  hypothetical protein  36.39 
 
 
411 aa  193  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.297044  hitchhiker  0.000815956 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3548  hypothetical protein  29.64 
 
 
427 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4915  protein of unknown function DUF111  38.99 
 
 
386 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4449  protein of unknown function DUF111  38.15 
 
 
395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.438751  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05441  hypothetical protein  31.08 
 
 
408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.307892 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2351  hypothetical protein  35.98 
 
 
402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4468  protein of unknown function DUF111  37.87 
 
 
395 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0284485  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07031  hypothetical protein  36.12 
 
 
410 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1561  protein of unknown function DUF111  34.72 
 
 
408 aa  189  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42597  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0528  protein of unknown function DUF111  33.93 
 
 
499 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659474 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1273  hypothetical protein  32.99 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0903  hypothetical protein  33.96 
 
 
426 aa  184  3e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1820  hypothetical protein  30.5 
 
 
407 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.493848  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4458  hypothetical protein  34.95 
 
 
406 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3737  hypothetical protein  36.53 
 
 
410 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173337  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1635  protein of unknown function DUF111  30.67 
 
 
373 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.165553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0150  hypothetical protein  42.98 
 
 
268 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.647615  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1127  hypothetical protein  32.71 
 
 
392 aa  177  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0175  protein of unknown function DUF111  36.56 
 
 
480 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0157  hypothetical protein  28.98 
 
 
411 aa  168  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05431  hypothetical protein  29.62 
 
 
410 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0488  hypothetical protein  28.83 
 
 
408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1782  hypothetical protein  36.86 
 
 
435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.139108  normal  0.205062 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05141  hypothetical protein  29.37 
 
 
410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0168  hypothetical protein  32.64 
 
 
393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4211  hypothetical protein  33.79 
 
 
437 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0176  hypothetical protein  36.54 
 
 
384 aa  160  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1273  hypothetical protein  29.82 
 
 
405 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0339  hypothetical protein  25.84 
 
 
406 aa  158  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2452  hypothetical protein  34.35 
 
 
395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2177  protein of unknown function DUF111  36.84 
 
 
468 aa  149  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2428  hypothetical protein  31.63 
 
 
401 aa  149  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2158  hypothetical protein  34.57 
 
 
397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1403  hypothetical protein  28.5 
 
 
405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0683  hypothetical protein  28.42 
 
 
405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1281  hypothetical protein  27.79 
 
 
405 aa  146  6e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26870  conserved hypothetical protein TIGR00299  36.01 
 
 
525 aa  145  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.487711  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1654  hypothetical protein  33.03 
 
 
492 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.10098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6460  hypothetical protein  31.44 
 
 
414 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31470  hypothetical protein  27.92 
 
 
463 aa  138  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1358  hypothetical protein  37.36 
 
 
450 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955528 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2562  protein of unknown function DUF111  28.78 
 
 
458 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210764 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0261  hypothetical protein  32.76 
 
 
396 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.991646 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46843  predicted protein  38.81 
 
 
455 aa  119  7.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.190085  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0274  hypothetical protein  31.8 
 
 
248 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3317  hypothetical protein  26.79 
 
 
391 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1706  protein of unknown function DUF111  35.23 
 
 
293 aa  113  5e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3799  hypothetical protein  34.44 
 
 
417 aa  112  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0099  protein of unknown function DUF111  30.29 
 
 
386 aa  99  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.663305  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0016  hypothetical protein  31 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1214  hypothetical protein  35.15 
 
 
184 aa  62.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000810306  normal  0.0630526 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42941  predicted protein  30.99 
 
 
461 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1707  hypothetical protein  28.43 
 
 
120 aa  49.7  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>