128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2400 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2400  protein of unknown function DUF111  100 
 
 
475 aa  956    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2204  protein of unknown function DUF111  38.64 
 
 
432 aa  287  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3339  hypothetical protein  40.57 
 
 
402 aa  280  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000998709  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3163  protein of unknown function DUF111  42.39 
 
 
394 aa  278  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3626  hypothetical protein  42.08 
 
 
385 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.405616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3731  hypothetical protein  42.08 
 
 
385 aa  276  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0369  hypothetical protein  41.04 
 
 
407 aa  273  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1826  hypothetical protein  39.7 
 
 
402 aa  273  6e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1544  protein of unknown function DUF111  37.2 
 
 
389 aa  272  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0194  hypothetical protein  40.93 
 
 
390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  0.707381 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2215  hypothetical protein  42.01 
 
 
394 aa  266  7e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00110232  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0215  hypothetical protein  40.41 
 
 
390 aa  265  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0626  hypothetical protein  43.65 
 
 
392 aa  263  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1783  hypothetical protein  40.05 
 
 
397 aa  263  6e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00757644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3737  hypothetical protein  38.37 
 
 
410 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173337  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0141  hypothetical protein  41.97 
 
 
388 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0253  hypothetical protein  37.14 
 
 
395 aa  257  3e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0590  hypothetical protein  40.69 
 
 
411 aa  256  5e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.297044  hitchhiker  0.000815956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1165  hypothetical protein  41.49 
 
 
395 aa  254  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189277  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3696  hypothetical protein  37.16 
 
 
419 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2351  hypothetical protein  39.37 
 
 
402 aa  251  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2415  hypothetical protein  37.56 
 
 
419 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2512  hypothetical protein  37.02 
 
 
396 aa  248  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0156591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2692  hypothetical protein  38.24 
 
 
429 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1474  hypothetical protein  37.89 
 
 
407 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0123523 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2401  hypothetical protein  40.36 
 
 
394 aa  247  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3548  hypothetical protein  36.56 
 
 
427 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2031  hypothetical protein  41.05 
 
 
462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2864  protein of unknown function DUF111  37.47 
 
 
395 aa  242  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000578609 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4313  hypothetical protein  41.27 
 
 
395 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1719  hypothetical protein  36.53 
 
 
394 aa  239  1e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2531  hypothetical protein  38.34 
 
 
388 aa  237  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.385418  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1404  protein of unknown function DUF111  37.15 
 
 
404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4458  hypothetical protein  38.82 
 
 
406 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4936  hypothetical protein  34.91 
 
 
420 aa  232  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4449  protein of unknown function DUF111  40.51 
 
 
395 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.438751  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4468  protein of unknown function DUF111  40.51 
 
 
395 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0284485  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1002  hypothetical protein  35.9 
 
 
396 aa  226  9e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0652  hypothetical protein  34.02 
 
 
446 aa  223  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2227  hypothetical protein  38.2 
 
 
408 aa  223  7e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1785  hypothetical protein  36.21 
 
 
398 aa  222  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.28441  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1278  protein of unknown function DUF111  36.91 
 
 
408 aa  219  6e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1561  protein of unknown function DUF111  36.67 
 
 
408 aa  217  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42597  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4211  hypothetical protein  40.39 
 
 
437 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1635  protein of unknown function DUF111  37.72 
 
 
373 aa  202  9e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.165553  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0528  protein of unknown function DUF111  39.1 
 
 
499 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659474 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0715  hypothetical protein  34.29 
 
 
390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356802  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0168  hypothetical protein  36.29 
 
 
393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0709  hypothetical protein  35.54 
 
 
380 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1127  hypothetical protein  36.79 
 
 
392 aa  197  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1596  protein of unknown function DUF111  35.48 
 
 
406 aa  196  8.000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1273  hypothetical protein  34.95 
 
 
387 aa  195  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0903  hypothetical protein  33.26 
 
 
426 aa  194  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2265  hypothetical protein  34.01 
 
 
396 aa  192  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2428  hypothetical protein  35.48 
 
 
401 aa  192  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4915  protein of unknown function DUF111  36.02 
 
 
386 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0176  hypothetical protein  37.1 
 
 
384 aa  187  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0537  hypothetical protein  36.09 
 
 
435 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.968061  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2158  hypothetical protein  34.67 
 
 
397 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0339  hypothetical protein  31.03 
 
 
406 aa  179  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26870  conserved hypothetical protein TIGR00299  39.82 
 
 
525 aa  177  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.487711  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0761  hypothetical protein  32.5 
 
 
396 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000360196 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0150  hypothetical protein  42.56 
 
 
268 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.647615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2562  protein of unknown function DUF111  33.18 
 
 
458 aa  176  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210764 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0666  hypothetical protein  35.47 
 
 
387 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.62938  normal  0.89141 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0157  hypothetical protein  30.89 
 
 
411 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05441  hypothetical protein  31.12 
 
 
408 aa  173  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.307892 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1281  hypothetical protein  31.66 
 
 
405 aa  172  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31470  hypothetical protein  32.74 
 
 
463 aa  171  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0683  hypothetical protein  31.3 
 
 
405 aa  170  4e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1820  hypothetical protein  30.53 
 
 
407 aa  170  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.493848  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0766  hypothetical protein  35.33 
 
 
379 aa  169  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1273  hypothetical protein  31.22 
 
 
405 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1782  hypothetical protein  35.06 
 
 
435 aa  169  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.139108  normal  0.205062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2452  hypothetical protein  38.04 
 
 
395 aa  168  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07031  hypothetical protein  33.88 
 
 
410 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0175  protein of unknown function DUF111  38.08 
 
 
480 aa  167  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0261  hypothetical protein  33.09 
 
 
396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.991646 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1694  hypothetical protein  32.69 
 
 
413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1403  hypothetical protein  31.39 
 
 
405 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1654  hypothetical protein  32.38 
 
 
492 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.10098 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1915  hypothetical protein  35.61 
 
 
398 aa  162  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2177  protein of unknown function DUF111  37.82 
 
 
468 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6460  hypothetical protein  35.28 
 
 
414 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04881  hypothetical protein  32.42 
 
 
410 aa  156  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.701312 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05511  hypothetical protein  28.72 
 
 
407 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.584195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3317  hypothetical protein  28.86 
 
 
391 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0488  hypothetical protein  27.72 
 
 
408 aa  140  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05141  hypothetical protein  27.12 
 
 
410 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05431  hypothetical protein  28.81 
 
 
410 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1706  protein of unknown function DUF111  33.1 
 
 
293 aa  131  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1358  hypothetical protein  36.26 
 
 
450 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955528 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0099  protein of unknown function DUF111  33.54 
 
 
386 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.663305  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3799  hypothetical protein  32.43 
 
 
417 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46843  predicted protein  36.14 
 
 
455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.190085  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0274  hypothetical protein  34.33 
 
 
248 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0016  hypothetical protein  33.77 
 
 
341 aa  97.8  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42941  predicted protein  28.88 
 
 
461 aa  89.7  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  75.56 
 
 
205 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1214  hypothetical protein  33.58 
 
 
184 aa  68.2  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000810306  normal  0.0630526 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>