99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3317 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3317  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  783    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1544  protein of unknown function DUF111  35.31 
 
 
389 aa  224  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3731  hypothetical protein  32.9 
 
 
385 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3548  hypothetical protein  31.78 
 
 
427 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3626  hypothetical protein  32.9 
 
 
385 aa  209  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.405616  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0369  hypothetical protein  31.74 
 
 
407 aa  206  6e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0215  hypothetical protein  32.9 
 
 
390 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0194  hypothetical protein  32.81 
 
 
390 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  0.707381 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1404  protein of unknown function DUF111  31.41 
 
 
404 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1826  hypothetical protein  32 
 
 
402 aa  199  5e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2031  hypothetical protein  34.07 
 
 
462 aa  196  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1783  hypothetical protein  30.53 
 
 
397 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00757644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2531  hypothetical protein  32.3 
 
 
388 aa  192  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.385418  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2204  protein of unknown function DUF111  30.38 
 
 
432 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0253  hypothetical protein  32.64 
 
 
395 aa  191  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2227  hypothetical protein  32.46 
 
 
408 aa  189  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1278  protein of unknown function DUF111  31.31 
 
 
408 aa  182  8.000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0626  hypothetical protein  32.03 
 
 
392 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2512  hypothetical protein  30.65 
 
 
396 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0156591 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3339  hypothetical protein  29.28 
 
 
402 aa  179  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000998709  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0141  hypothetical protein  32.3 
 
 
388 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1165  hypothetical protein  30.23 
 
 
395 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189277  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2215  hypothetical protein  30.15 
 
 
394 aa  173  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00110232  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3163  protein of unknown function DUF111  29.32 
 
 
394 aa  172  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2401  hypothetical protein  28.8 
 
 
394 aa  170  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4313  hypothetical protein  28.84 
 
 
395 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2415  hypothetical protein  28.14 
 
 
419 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3696  hypothetical protein  28.39 
 
 
419 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3737  hypothetical protein  27.16 
 
 
410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173337  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4458  hypothetical protein  27.74 
 
 
406 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4449  protein of unknown function DUF111  29.46 
 
 
395 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.438751  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1002  hypothetical protein  28.9 
 
 
396 aa  160  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2351  hypothetical protein  28.5 
 
 
402 aa  160  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4468  protein of unknown function DUF111  29.46 
 
 
395 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0284485  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1719  hypothetical protein  27.46 
 
 
394 aa  157  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2400  protein of unknown function DUF111  28.5 
 
 
475 aa  155  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1127  hypothetical protein  28.87 
 
 
392 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2692  hypothetical protein  25.97 
 
 
429 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1474  hypothetical protein  27.23 
 
 
407 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0123523 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2864  protein of unknown function DUF111  29.27 
 
 
395 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000578609 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0590  hypothetical protein  26.93 
 
 
411 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.297044  hitchhiker  0.000815956 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0528  protein of unknown function DUF111  26.47 
 
 
499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659474 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1596  protein of unknown function DUF111  27.76 
 
 
406 aa  145  9e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1561  protein of unknown function DUF111  25.44 
 
 
408 aa  145  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42597  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1785  hypothetical protein  28.57 
 
 
398 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.28441  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4211  hypothetical protein  28.69 
 
 
437 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0176  hypothetical protein  27.76 
 
 
384 aa  143  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0652  hypothetical protein  24.6 
 
 
446 aa  144  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4936  hypothetical protein  34.8 
 
 
420 aa  140  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1654  hypothetical protein  28.33 
 
 
492 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.10098 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1281  hypothetical protein  30.73 
 
 
405 aa  139  6e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0709  hypothetical protein  28.65 
 
 
380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2265  hypothetical protein  27.69 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0761  hypothetical protein  29.35 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000360196 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0666  hypothetical protein  26.61 
 
 
387 aa  134  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.62938  normal  0.89141 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1403  hypothetical protein  30.17 
 
 
405 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0683  hypothetical protein  30 
 
 
405 aa  133  5e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0903  hypothetical protein  29.28 
 
 
426 aa  132  9e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2562  protein of unknown function DUF111  28.26 
 
 
458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210764 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05431  hypothetical protein  28.54 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0175  protein of unknown function DUF111  32.89 
 
 
480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0488  hypothetical protein  28.32 
 
 
408 aa  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1635  protein of unknown function DUF111  26.94 
 
 
373 aa  127  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.165553  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1273  hypothetical protein  28.79 
 
 
405 aa  126  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0168  hypothetical protein  25.95 
 
 
393 aa  125  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1782  hypothetical protein  30.89 
 
 
435 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.139108  normal  0.205062 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2177  protein of unknown function DUF111  29.36 
 
 
468 aa  123  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0715  hypothetical protein  26.79 
 
 
390 aa  123  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356802  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07031  hypothetical protein  27.21 
 
 
410 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05511  hypothetical protein  26.34 
 
 
407 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.584195  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31470  hypothetical protein  24.94 
 
 
463 aa  119  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05141  hypothetical protein  27.16 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1694  hypothetical protein  24.8 
 
 
413 aa  113  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1273  hypothetical protein  25.97 
 
 
387 aa  113  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6460  hypothetical protein  26.25 
 
 
414 aa  112  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05441  hypothetical protein  25.58 
 
 
408 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.307892 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04881  hypothetical protein  25.44 
 
 
410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.701312 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26870  conserved hypothetical protein TIGR00299  26.56 
 
 
525 aa  110  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.487711  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1820  hypothetical protein  25 
 
 
407 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.493848  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2158  hypothetical protein  26.08 
 
 
397 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2428  hypothetical protein  27.43 
 
 
401 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2452  hypothetical protein  25.9 
 
 
395 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0157  hypothetical protein  27.05 
 
 
411 aa  107  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4915  protein of unknown function DUF111  29.17 
 
 
386 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0339  hypothetical protein  27.04 
 
 
406 aa  99.8  8e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0261  hypothetical protein  23.68 
 
 
396 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.991646 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42941  predicted protein  35.09 
 
 
461 aa  94.4  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0150  hypothetical protein  25.31 
 
 
268 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.647615  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0766  hypothetical protein  23.01 
 
 
379 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1915  hypothetical protein  25.64 
 
 
398 aa  86.7  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0537  hypothetical protein  21.41 
 
 
435 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.968061  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0016  hypothetical protein  33.8 
 
 
341 aa  82.4  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3799  hypothetical protein  25.61 
 
 
417 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0099  protein of unknown function DUF111  38.82 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.663305  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1358  hypothetical protein  25.36 
 
 
450 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955528 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1707  hypothetical protein  35.96 
 
 
120 aa  61.2  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46843  predicted protein  28.35 
 
 
455 aa  49.7  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.190085  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0274  hypothetical protein  22.59 
 
 
248 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1706  protein of unknown function DUF111  29.11 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>