99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0590 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0590  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  815    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.297044  hitchhiker  0.000815956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1165  hypothetical protein  75.92 
 
 		 395 aa  617  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189277  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1404  protein of unknown function DUF111  42.6 
 
 		 404 aa  335  1e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3339  hypothetical protein  45.34 
 
 		 402 aa  331  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000998709  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1544  protein of unknown function DUF111  40.69 
 
 		 389 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0369  hypothetical protein  40.05 
 
 		 407 aa  317  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3548  hypothetical protein  36.85 
 
 		 427 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2512  hypothetical protein  44.36 
 
 		 396 aa  308  8e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0156591 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2204  protein of unknown function DUF111  38.11 
 
 		 432 aa  302  8.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1826  hypothetical protein  39.71 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2531  hypothetical protein  46.52 
 
 		 388 aa  290  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.385418  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2227  hypothetical protein  44.92 
 
 		 408 aa  286  7e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2864  protein of unknown function DUF111  39.33 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000578609 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0215  hypothetical protein  42.12 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0626  hypothetical protein  45.54 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3737  hypothetical protein  41.03 
 
 		 410 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2401  hypothetical protein  41.52 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1783  hypothetical protein  37.8 
 
 		 397 aa  280  4e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00757644  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3731  hypothetical protein  44.39 
 
 		 385 aa  277  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3163  protein of unknown function DUF111  43.28 
 
 		 394 aa  276  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3626  hypothetical protein  43.64 
 
 		 385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.405616  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2351  hypothetical protein  44.03 
 
 		 402 aa  274  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1278  protein of unknown function DUF111  37.7 
 
 		 408 aa  271  1e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3696  hypothetical protein  37.91 
 
 		 419 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0652  hypothetical protein  38.16 
 
 		 446 aa  270  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2415  hypothetical protein  38.15 
 
 		 419 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0194  hypothetical protein  39.9 
 
 		 390 aa  260  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  0.707381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1474  hypothetical protein  39 
 
 		 407 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0123523 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0528  protein of unknown function DUF111  45.54 
 
 		 499 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659474 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0253  hypothetical protein  33.99 
 
 		 395 aa  258  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1596  protein of unknown function DUF111  41.09 
 
 		 406 aa  256  7e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1719  hypothetical protein  33.33 
 
 		 394 aa  256  7e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2400  protein of unknown function DUF111  40.69 
 
 		 475 aa  256  7e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4458  hypothetical protein  43.22 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2215  hypothetical protein  40.65 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00110232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0141  hypothetical protein  41.79 
 
 		 388 aa  253  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2692  hypothetical protein  37.91 
 
 		 429 aa  249  7e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4936  hypothetical protein  38.83 
 
 		 420 aa  243  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4313  hypothetical protein  43.31 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1561  protein of unknown function DUF111  41.85 
 
 		 408 aa  237  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42597  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1002  hypothetical protein  32.93 
 
 		 396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2031  hypothetical protein  41.82 
 
 		 462 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0176  hypothetical protein  42.6 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4468  protein of unknown function DUF111  41.95 
 
 		 395 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0284485  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4449  protein of unknown function DUF111  42.89 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.438751  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05441  hypothetical protein  31.25 
 
 		 408 aa  225  9e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.307892 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07031  hypothetical protein  37.93 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1820  hypothetical protein  32.13 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.493848  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2562  protein of unknown function DUF111  38.58 
 
 		 458 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210764 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04881  hypothetical protein  35.42 
 
 		 410 aa  219  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.701312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4915  protein of unknown function DUF111  41.77 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0168  hypothetical protein  40.35 
 
 		 393 aa  212  9e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1785  hypothetical protein  36.87 
 
 		 398 aa  212  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.28441  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1635  protein of unknown function DUF111  33.16 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.165553  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1127  hypothetical protein  35.18 
 
 		 392 aa  209  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1694  hypothetical protein  38.85 
 
 		 413 aa  207  2e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2158  hypothetical protein  37.38 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0150  hypothetical protein  43.73 
 
 		 268 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.647615  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2265  hypothetical protein  32.92 
 
 		 396 aa  203  5e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4211  hypothetical protein  38.54 
 
 		 437 aa  202  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0666  hypothetical protein  40.51 
 
 		 387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.62938  normal  0.89141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6460  hypothetical protein  38.02 
 
 		 414 aa  196  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0715  hypothetical protein  36.39 
 
 		 390 aa  193  6e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356802  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05511  hypothetical protein  31.63 
 
 		 407 aa  193  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.584195  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0488  hypothetical protein  31 
 
 		 408 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05431  hypothetical protein  31.46 
 
 		 410 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05141  hypothetical protein  30.27 
 
 		 410 aa  186  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0761  hypothetical protein  32.62 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000360196 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0903  hypothetical protein  36.49 
 
 		 426 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0709  hypothetical protein  36.83 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1654  hypothetical protein  38.08 
 
 		 492 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.10098 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0261  hypothetical protein  36.08 
 
 		 396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.991646 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2452  hypothetical protein  34.64 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2428  hypothetical protein  36.21 
 
 		 401 aa  179  7e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1782  hypothetical protein  39.83 
 
 		 435 aa  179  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.139108  normal  0.205062 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0683  hypothetical protein  30.73 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31470  hypothetical protein  33.33 
 
 		 463 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1281  hypothetical protein  30.6 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1915  hypothetical protein  38.75 
 
 		 398 aa  169  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1273  hypothetical protein  30.26 
 
 		 405 aa  169  7e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26870  conserved hypothetical protein TIGR00299  39.27 
 
 		 525 aa  168  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.487711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1403  hypothetical protein  29.55 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0175  protein of unknown function DUF111  35.57 
 
 		 480 aa  167  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0537  hypothetical protein  34.64 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.968061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1273  hypothetical protein  32.51 
 
 		 387 aa  159  6e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3799  hypothetical protein  37.34 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2177  protein of unknown function DUF111  33.05 
 
 		 468 aa  156  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0339  hypothetical protein  28.14 
 
 		 406 aa  150  4e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1706  protein of unknown function DUF111  30.14 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0157  hypothetical protein  26.32 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0766  hypothetical protein  35.63 
 
 		 379 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1358  hypothetical protein  38.41 
 
 		 450 aa  147  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955528 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3317  hypothetical protein  26.93 
 
 		 391 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0274  hypothetical protein  35.74 
 
 		 248 aa  133  6e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46843  predicted protein  39.91 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.190085  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0016  hypothetical protein  31.66 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42941  predicted protein  33.84 
 
 		 461 aa  97.8  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0099  protein of unknown function DUF111  31.41 
 
 		 386 aa  82.8  0.000000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.663305  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1214  hypothetical protein  38.06 
 
 		 184 aa  68.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000810306  normal  0.0630526 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>