100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0194 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0194  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  777    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  0.707381 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0141  hypothetical protein  78.92 
 
 
388 aa  591  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0215  hypothetical protein  68.91 
 
 
390 aa  551  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3731  hypothetical protein  61.03 
 
 
385 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3626  hypothetical protein  61.54 
 
 
385 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.405616  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0626  hypothetical protein  60.84 
 
 
392 aa  451  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3163  protein of unknown function DUF111  50.76 
 
 
394 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2401  hypothetical protein  47.81 
 
 
394 aa  350  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2531  hypothetical protein  50.26 
 
 
388 aa  342  7e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.385418  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2215  hypothetical protein  47.67 
 
 
394 aa  333  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00110232  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1544  protein of unknown function DUF111  40.77 
 
 
389 aa  329  4e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3339  hypothetical protein  44.53 
 
 
402 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000998709  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2512  hypothetical protein  45.6 
 
 
396 aa  313  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0156591 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1826  hypothetical protein  42.22 
 
 
402 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0253  hypothetical protein  41.58 
 
 
395 aa  312  7.999999999999999e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0369  hypothetical protein  42.07 
 
 
407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1783  hypothetical protein  42.36 
 
 
397 aa  301  1e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00757644  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1404  protein of unknown function DUF111  42.03 
 
 
404 aa  296  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2227  hypothetical protein  44.39 
 
 
408 aa  295  7e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3696  hypothetical protein  39.31 
 
 
419 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3548  hypothetical protein  38.21 
 
 
427 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2864  protein of unknown function DUF111  38.21 
 
 
395 aa  288  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000578609 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2415  hypothetical protein  39.07 
 
 
419 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2204  protein of unknown function DUF111  38.35 
 
 
432 aa  286  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2400  protein of unknown function DUF111  40.93 
 
 
475 aa  272  9e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1474  hypothetical protein  40.39 
 
 
407 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0123523 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0652  hypothetical protein  35.33 
 
 
446 aa  270  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1165  hypothetical protein  41.86 
 
 
395 aa  269  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189277  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2351  hypothetical protein  41.75 
 
 
402 aa  266  5e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1278  protein of unknown function DUF111  37.62 
 
 
408 aa  261  1e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0590  hypothetical protein  39.9 
 
 
411 aa  260  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.297044  hitchhiker  0.000815956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3737  hypothetical protein  36.18 
 
 
410 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173337  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2031  hypothetical protein  44.13 
 
 
462 aa  258  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1635  protein of unknown function DUF111  39.01 
 
 
373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.165553  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1719  hypothetical protein  36.01 
 
 
394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2692  hypothetical protein  36.84 
 
 
429 aa  253  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4313  hypothetical protein  43.94 
 
 
395 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4458  hypothetical protein  42.71 
 
 
406 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0528  protein of unknown function DUF111  42.47 
 
 
499 aa  249  6e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659474 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0168  hypothetical protein  42.56 
 
 
393 aa  246  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4468  protein of unknown function DUF111  43.63 
 
 
395 aa  245  9e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0284485  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4449  protein of unknown function DUF111  43.36 
 
 
395 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.438751  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1002  hypothetical protein  37.47 
 
 
396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4936  hypothetical protein  36.98 
 
 
420 aa  240  4e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1785  hypothetical protein  39.63 
 
 
398 aa  236  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.28441  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2265  hypothetical protein  35.19 
 
 
396 aa  235  8e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0715  hypothetical protein  37.11 
 
 
390 aa  231  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356802  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1127  hypothetical protein  37.31 
 
 
392 aa  227  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0761  hypothetical protein  36.62 
 
 
396 aa  228  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000360196 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0175  protein of unknown function DUF111  42.26 
 
 
480 aa  227  3e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04881  hypothetical protein  35.41 
 
 
410 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.701312 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1596  protein of unknown function DUF111  39.95 
 
 
406 aa  226  6e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07031  hypothetical protein  37.78 
 
 
410 aa  222  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1561  protein of unknown function DUF111  37.95 
 
 
408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42597  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0709  hypothetical protein  37.63 
 
 
380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0176  hypothetical protein  43.6 
 
 
384 aa  219  5e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0150  hypothetical protein  49.37 
 
 
268 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.647615  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0903  hypothetical protein  35.65 
 
 
426 aa  215  8e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4211  hypothetical protein  38.59 
 
 
437 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2562  protein of unknown function DUF111  37.56 
 
 
458 aa  209  9e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210764 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2428  hypothetical protein  38.9 
 
 
401 aa  207  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0666  hypothetical protein  38.87 
 
 
387 aa  207  3e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.62938  normal  0.89141 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0339  hypothetical protein  32.4 
 
 
406 aa  206  7e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1273  hypothetical protein  37.31 
 
 
387 aa  205  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4915  protein of unknown function DUF111  41.34 
 
 
386 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0488  hypothetical protein  33.17 
 
 
408 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05431  hypothetical protein  33.58 
 
 
410 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1820  hypothetical protein  33.15 
 
 
407 aa  202  7e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.493848  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31470  hypothetical protein  33.71 
 
 
463 aa  202  8e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2452  hypothetical protein  37.25 
 
 
395 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05141  hypothetical protein  32.92 
 
 
410 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05441  hypothetical protein  32.68 
 
 
408 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.307892 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1694  hypothetical protein  39.69 
 
 
413 aa  199  7e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1654  hypothetical protein  38.2 
 
 
492 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.10098 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1782  hypothetical protein  39.88 
 
 
435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.139108  normal  0.205062 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2177  protein of unknown function DUF111  39.53 
 
 
468 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05511  hypothetical protein  30.17 
 
 
407 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.584195  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6460  hypothetical protein  37.31 
 
 
414 aa  196  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0766  hypothetical protein  38.79 
 
 
379 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3317  hypothetical protein  32.81 
 
 
391 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2158  hypothetical protein  36.62 
 
 
397 aa  192  6e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0537  hypothetical protein  36.67 
 
 
435 aa  189  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.968061  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0157  hypothetical protein  29.47 
 
 
411 aa  184  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1915  hypothetical protein  39.02 
 
 
398 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1403  hypothetical protein  30.63 
 
 
405 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0683  hypothetical protein  30.38 
 
 
405 aa  180  4e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0261  hypothetical protein  34.25 
 
 
396 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.991646 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1273  hypothetical protein  30.81 
 
 
405 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26870  conserved hypothetical protein TIGR00299  39.31 
 
 
525 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.487711  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1281  hypothetical protein  28.17 
 
 
405 aa  167  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1358  hypothetical protein  40.61 
 
 
450 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3799  hypothetical protein  37.37 
 
 
417 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1706  protein of unknown function DUF111  36.27 
 
 
293 aa  159  7e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0274  hypothetical protein  37.34 
 
 
248 aa  152  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46843  predicted protein  47.25 
 
 
455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.190085  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0099  protein of unknown function DUF111  35.8 
 
 
386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.663305  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0016  hypothetical protein  30.23 
 
 
341 aa  86.3  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42941  predicted protein  29.39 
 
 
461 aa  85.9  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1214  hypothetical protein  34.88 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000810306  normal  0.0630526 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1707  hypothetical protein  26.67 
 
 
120 aa  45.8  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>