100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2204 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2204  protein of unknown function DUF111  100 
 
 
432 aa  887    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0369  hypothetical protein  54.29 
 
 
407 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1544  protein of unknown function DUF111  45.65 
 
 
389 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3548  hypothetical protein  45.12 
 
 
427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3339  hypothetical protein  41.59 
 
 
402 aa  329  6e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000998709  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3626  hypothetical protein  41.88 
 
 
385 aa  323  5e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.405616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3731  hypothetical protein  41.18 
 
 
385 aa  317  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2031  hypothetical protein  39.51 
 
 
462 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0215  hypothetical protein  39.76 
 
 
390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0590  hypothetical protein  38.34 
 
 
411 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.297044  hitchhiker  0.000815956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1165  hypothetical protein  40.57 
 
 
395 aa  301  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189277  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1404  protein of unknown function DUF111  38.98 
 
 
404 aa  300  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2512  hypothetical protein  37.86 
 
 
396 aa  297  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0156591 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3737  hypothetical protein  38.11 
 
 
410 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173337  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3696  hypothetical protein  38.89 
 
 
419 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2415  hypothetical protein  38.9 
 
 
419 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0652  hypothetical protein  40 
 
 
446 aa  295  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0141  hypothetical protein  40.05 
 
 
388 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2215  hypothetical protein  38.8 
 
 
394 aa  294  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00110232  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2531  hypothetical protein  40 
 
 
388 aa  292  7e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.385418  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0253  hypothetical protein  37.97 
 
 
395 aa  292  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2400  protein of unknown function DUF111  38.75 
 
 
475 aa  287  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2401  hypothetical protein  36.19 
 
 
394 aa  286  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0194  hypothetical protein  38.35 
 
 
390 aa  286  7e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  0.707381 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1278  protein of unknown function DUF111  41.09 
 
 
408 aa  285  9e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1474  hypothetical protein  38.84 
 
 
407 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0123523 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1719  hypothetical protein  36.94 
 
 
394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1826  hypothetical protein  38.68 
 
 
402 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2692  hypothetical protein  37.25 
 
 
429 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1783  hypothetical protein  38.41 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00757644  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2227  hypothetical protein  38.28 
 
 
408 aa  269  7e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0626  hypothetical protein  36.74 
 
 
392 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3163  protein of unknown function DUF111  37.67 
 
 
394 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2351  hypothetical protein  36.56 
 
 
402 aa  267  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1635  protein of unknown function DUF111  39.15 
 
 
373 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.165553  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1002  hypothetical protein  37.53 
 
 
396 aa  262  8e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2864  protein of unknown function DUF111  34.2 
 
 
395 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000578609 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4313  hypothetical protein  35.06 
 
 
395 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4458  hypothetical protein  34.12 
 
 
406 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4468  protein of unknown function DUF111  34.9 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0284485  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4449  protein of unknown function DUF111  34.65 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.438751  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1785  hypothetical protein  33.49 
 
 
398 aa  244  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.28441  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2562  protein of unknown function DUF111  34.52 
 
 
458 aa  245  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210764 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4936  hypothetical protein  35.21 
 
 
420 aa  242  7.999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1596  protein of unknown function DUF111  35.34 
 
 
406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1782  hypothetical protein  33.41 
 
 
435 aa  234  3e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.139108  normal  0.205062 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0903  hypothetical protein  34.36 
 
 
426 aa  229  5e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1561  protein of unknown function DUF111  31.53 
 
 
408 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42597  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2265  hypothetical protein  33.41 
 
 
396 aa  222  9e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4211  hypothetical protein  32.25 
 
 
437 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1127  hypothetical protein  31.87 
 
 
392 aa  218  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0715  hypothetical protein  33.57 
 
 
390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356802  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0709  hypothetical protein  32.14 
 
 
380 aa  216  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07031  hypothetical protein  31.55 
 
 
410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2177  protein of unknown function DUF111  32.66 
 
 
468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0175  protein of unknown function DUF111  32.12 
 
 
480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1820  hypothetical protein  32.08 
 
 
407 aa  213  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.493848  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1654  hypothetical protein  33.89 
 
 
492 aa  212  9e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.10098 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05441  hypothetical protein  32.55 
 
 
408 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.307892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0761  hypothetical protein  31.87 
 
 
396 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000360196 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0666  hypothetical protein  34.05 
 
 
387 aa  206  9e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.62938  normal  0.89141 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0150  hypothetical protein  41.18 
 
 
268 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.647615  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04881  hypothetical protein  30.35 
 
 
410 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.701312 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2158  hypothetical protein  31.19 
 
 
397 aa  197  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2452  hypothetical protein  31.71 
 
 
395 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1694  hypothetical protein  31.92 
 
 
413 aa  196  6e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0176  hypothetical protein  36 
 
 
384 aa  192  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1281  hypothetical protein  32.49 
 
 
405 aa  191  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0157  hypothetical protein  31.02 
 
 
411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0683  hypothetical protein  35.97 
 
 
405 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6460  hypothetical protein  29.15 
 
 
414 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0168  hypothetical protein  29.59 
 
 
393 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4915  protein of unknown function DUF111  29.09 
 
 
386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31470  hypothetical protein  27.54 
 
 
463 aa  183  6e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3317  hypothetical protein  30.38 
 
 
391 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1273  hypothetical protein  29.77 
 
 
387 aa  182  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0339  hypothetical protein  30.95 
 
 
406 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26870  conserved hypothetical protein TIGR00299  38.17 
 
 
525 aa  181  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.487711  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1403  hypothetical protein  36.3 
 
 
405 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2428  hypothetical protein  28.24 
 
 
401 aa  178  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1273  hypothetical protein  35.26 
 
 
405 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1706  protein of unknown function DUF111  42.05 
 
 
293 aa  177  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0488  hypothetical protein  28.8 
 
 
408 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05431  hypothetical protein  30.71 
 
 
410 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0261  hypothetical protein  27.55 
 
 
396 aa  168  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.991646 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0766  hypothetical protein  31.51 
 
 
379 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05141  hypothetical protein  28.64 
 
 
410 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05511  hypothetical protein  27.65 
 
 
407 aa  159  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.584195  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0537  hypothetical protein  27.31 
 
 
435 aa  153  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.968061  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1915  hypothetical protein  29.92 
 
 
398 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3799  hypothetical protein  30.33 
 
 
417 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1358  hypothetical protein  32.13 
 
 
450 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955528 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0274  hypothetical protein  31.43 
 
 
248 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46843  predicted protein  36.24 
 
 
455 aa  121  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.190085  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0016  hypothetical protein  33.78 
 
 
341 aa  113  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42941  predicted protein  33.33 
 
 
461 aa  100  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0099  protein of unknown function DUF111  23.08 
 
 
386 aa  75.9  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.663305  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1707  hypothetical protein  33.94 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1214  hypothetical protein  30.71 
 
 
184 aa  66.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000810306  normal  0.0630526 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0528  protein of unknown function DUF111  37.18 
 
 
499 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>