70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1707 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1707  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  240  6e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0369  hypothetical protein  36 
 
 
407 aa  79.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1783  hypothetical protein  36.11 
 
 
397 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00757644  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26870  conserved hypothetical protein TIGR00299  37.38 
 
 
525 aa  78.6  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.487711  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1544  protein of unknown function DUF111  34.82 
 
 
389 aa  75.5  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3548  hypothetical protein  40 
 
 
427 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1826  hypothetical protein  36.04 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2692  hypothetical protein  34.58 
 
 
429 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4936  hypothetical protein  34.58 
 
 
420 aa  67.4  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2215  hypothetical protein  34.55 
 
 
394 aa  67.4  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00110232  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0626  hypothetical protein  35.92 
 
 
392 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2204  protein of unknown function DUF111  34.86 
 
 
432 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0652  hypothetical protein  35.58 
 
 
446 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1474  hypothetical protein  33.98 
 
 
407 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0123523 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3696  hypothetical protein  35.85 
 
 
419 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2031  hypothetical protein  28.7 
 
 
462 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3317  hypothetical protein  35.96 
 
 
391 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6460  hypothetical protein  49.21 
 
 
414 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1002  hypothetical protein  33.93 
 
 
396 aa  60.1  0.000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3737  hypothetical protein  32.32 
 
 
410 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173337  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1404  protein of unknown function DUF111  30.71 
 
 
404 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0253  hypothetical protein  33.33 
 
 
395 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1635  protein of unknown function DUF111  37.23 
 
 
373 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.165553  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0168  hypothetical protein  36.08 
 
 
393 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2864  protein of unknown function DUF111  31.25 
 
 
395 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000578609 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0215  hypothetical protein  31.13 
 
 
390 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4211  hypothetical protein  50.98 
 
 
437 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2415  hypothetical protein  35.29 
 
 
419 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1719  hypothetical protein  31.96 
 
 
394 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0709  hypothetical protein  28.45 
 
 
380 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1403  hypothetical protein  34.4 
 
 
405 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2512  hypothetical protein  26.61 
 
 
396 aa  52.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0156591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0766  hypothetical protein  42.11 
 
 
379 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4458  hypothetical protein  27.88 
 
 
406 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1561  protein of unknown function DUF111  26.42 
 
 
408 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42597  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3339  hypothetical protein  27.27 
 
 
402 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000998709  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4468  protein of unknown function DUF111  31.46 
 
 
395 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0284485  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4449  protein of unknown function DUF111  38.1 
 
 
395 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.438751  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3626  hypothetical protein  28.32 
 
 
385 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.405616  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2452  hypothetical protein  29.46 
 
 
395 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4313  hypothetical protein  42.11 
 
 
395 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3731  hypothetical protein  27.43 
 
 
385 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4915  protein of unknown function DUF111  30.56 
 
 
386 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1278  protein of unknown function DUF111  31.62 
 
 
408 aa  51.2  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2531  hypothetical protein  31.86 
 
 
388 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.385418  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1165  hypothetical protein  37.1 
 
 
395 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189277  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0715  hypothetical protein  28.43 
 
 
390 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356802  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0683  hypothetical protein  30.65 
 
 
405 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1273  hypothetical protein  30.89 
 
 
405 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0339  hypothetical protein  33.64 
 
 
406 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0528  protein of unknown function DUF111  27.27 
 
 
499 aa  48.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659474 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0141  hypothetical protein  28.18 
 
 
388 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2400  protein of unknown function DUF111  29.06 
 
 
475 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42941  predicted protein  30 
 
 
461 aa  47  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0157  hypothetical protein  31.19 
 
 
411 aa  47  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3163  protein of unknown function DUF111  27.45 
 
 
394 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1596  protein of unknown function DUF111  27.18 
 
 
406 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0537  hypothetical protein  31 
 
 
435 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.968061  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1654  hypothetical protein  28.83 
 
 
492 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.10098 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1281  hypothetical protein  30.7 
 
 
405 aa  46.2  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2401  hypothetical protein  28.97 
 
 
394 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0176  hypothetical protein  24.35 
 
 
384 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0194  hypothetical protein  26.67 
 
 
390 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  0.707381 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0175  protein of unknown function DUF111  27.05 
 
 
480 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0016  hypothetical protein  27.35 
 
 
341 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2562  protein of unknown function DUF111  30.1 
 
 
458 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210764 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2227  hypothetical protein  39.13 
 
 
408 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31470  hypothetical protein  33.87 
 
 
463 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0761  hypothetical protein  26.55 
 
 
396 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000360196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0590  hypothetical protein  32.26 
 
 
411 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.297044  hitchhiker  0.000815956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>