More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3995 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3740  L-serine dehydratase 1  93.38 
 
 		 453 aa  820    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.205833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3389  L-serine dehydratase 1  83.19 
 
 		 448 aa  735    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4035  L-serine dehydratase 1  94.04 
 
 		 453 aa  803    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2483  L-serine dehydratase 1  74.34 
 
 		 450 aa  665    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.743605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3995  L-serine dehydratase 1  100 
 
 		 452 aa  910    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0871  L-serine dehydratase 1  66.74 
 
 		 448 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3047  L-serine dehydratase 1  58.3 
 
 		 460 aa  507  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2062  L-serine dehydratase 1  58.37 
 
 		 467 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01684  L-serine ammonia-lyase  57.64 
 
 		 468 aa  501  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.737007  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4265  L-serine ammonia-lyase  57.61 
 
 		 460 aa  501  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1862  L-serine dehydratase 1  57.94 
 
 		 467 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0904594  normal  0.063682 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2194  L-serine dehydratase 1  60.92 
 
 		 452 aa  497  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1367  L-serine ammonia-lyase  59.35 
 
 		 466 aa  495  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1803  L-serine dehydratase 1  59.39 
 
 		 456 aa  489  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2612  L-serine dehydratase  57.73 
 
 		 467 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0138144  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2016  L-serine dehydratase 1  58.37 
 
 		 467 aa  482  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5008  L-serine dehydratase  57.02 
 
 		 470 aa  480  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.941789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0316  L-serine ammonia-lyase  57.11 
 
 		 470 aa  481  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  56.01 
 
 		 463 aa  476  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0361  L-serine ammonia-lyase  57.21 
 
 		 459 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.739457  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1037  L-serine dehydratase 1  56.77 
 
 		 466 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2005  L-serine dehydratase 1  57.21 
 
 		 459 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.233439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0423  L-serine dehydratase 1  57.32 
 
 		 470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0995  L-serine ammonia-lyase  54.88 
 
 		 490 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1175  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  58.37 
 
 		 467 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000212512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6246  L-serine dehydratase 1  56.52 
 
 		 455 aa  465  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187309  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0854  hypothetical protein  53.58 
 
 		 458 aa  465  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0828  hypothetical protein  53.58 
 
 		 458 aa  465  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0396  L-serine ammonia-lyase  54.66 
 
 		 545 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8589  L-serine dehydratase 1  57.79 
 
 		 458 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0996  L-serine dehydratase 1  59.35 
 
 		 456 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0239492  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1134  L-serine ammonia-lyase  58.37 
 
 		 467 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000711201  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1863  L-serine ammonia-lyase  54.66 
 
 		 504 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16840  L-serine ammonia-lyase  54.35 
 
 		 458 aa  465  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128912  normal  0.527215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6183  L-serine dehydratase 1  56.06 
 
 		 457 aa  466  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1955  L-serine ammonia-lyase  54.66 
 
 		 504 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0112  L-serine dehydratase 1  56.25 
 
 		 462 aa  464  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0329  L-serine dehydratase 1  54.45 
 
 		 463 aa  463  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3503  L-serine dehydratase 1  54.23 
 
 		 461 aa  464  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0045  L-serine dehydratase  54.66 
 
 		 461 aa  462  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.388959 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3334  L-serine dehydratase 1  53.68 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1601  L-serine ammonia-lyase  54.96 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1962  L-serine ammonia-lyase / 2-hydroxymethylglutarate dehydratase  55.9 
 
 		 457 aa  462  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1473  L-serine ammonia-lyase  56.89 
 
 		 461 aa  462  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0162786  normal  0.053495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0095  L-serine ammonia-lyase  56.03 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5127  L-serine dehydratase 1  54.01 
 
 		 461 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4831  L-serine ammonia-lyase  54.55 
 
 		 462 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0485  L-serine ammonia-lyase  54.01 
 
 		 461 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5070  L-serine dehydratase 1  53.58 
 
 		 461 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0518  L-serine dehydratase 1  56.86 
 
 		 457 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3215  L-serine dehydratase 1  54.01 
 
 		 529 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2892  L-serine dehydratase 1  54.76 
 
 		 458 aa  460  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5047  L-serine dehydratase 1  54.53 
 
 		 464 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.533739  normal  0.269496 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4547  L-serine dehydratase 1  53.58 
 
 		 461 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33030  L-serine dehydratase  55.19 
 
 		 458 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518916  hitchhiker  0.000319155 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5152  L-serine dehydratase 1  54.01 
 
 		 461 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0881  L-serine dehydratase 1  56.99 
 
 		 459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4393  L-serine ammonia-lyase  54.43 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2808  L-serine dehydratase  55.36 
 
 		 469 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255142  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3884  L-serine dehydratase 1  53.13 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4547  L-serine ammonia-lyase  54.21 
 
 		 462 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4369  L-serine ammonia-lyase  53.53 
 
 		 464 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0215032  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0052  L-serine ammonia-lyase  52.27 
 
 		 462 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4231  L-serine dehydratase 1  54 
 
 		 458 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1195  L-serine dehydratase 1  54.43 
 
 		 477 aa  449  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.197277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6540  L-serine dehydratase 1  54.13 
 
 		 459 aa  449  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00743621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4132  L-serine dehydratase 1  55.72 
 
 		 460 aa  451  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465086  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3296  L-serine dehydratase  54.49 
 
 		 458 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3333  L-serine ammonia-lyase  54.13 
 
 		 458 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3620  L-serine dehydratase 1  54.7 
 
 		 467 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.294532  normal  0.0574017 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1084  L-serine dehydratase 1  52.85 
 
 		 472 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3483  L-serine ammonia-lyase  54.47 
 
 		 458 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0116  L-serine dehydratase 1  52.06 
 
 		 460 aa  445  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117006  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26040  L-serine dehydratase  55.12 
 
 		 458 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0679  L-serine dehydratase 1  53.65 
 
 		 460 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02760  L-serine ammonia-lyase  54.01 
 
 		 472 aa  443  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3164  L-serine dehydratase 1  54.27 
 
 		 458 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1625  L-serine dehydratase 1  51.95 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3490  L-serine dehydratase 1  54.05 
 
 		 458 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1149  L-serine dehydratase 1  50.94 
 
 		 499 aa  441  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0992  L-serine dehydratase 1  53.78 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3225  L-serine dehydratase 1  52.73 
 
 		 475 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01946  L-serine dehydratase 1  51.52 
 
 		 457 aa  439  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0568801  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0987  L-serine dehydratase 1  53.35 
 
 		 458 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1024  L-serine dehydratase 1  53.35 
 
 		 458 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.846352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3015  L-serine dehydratase 1  51.19 
 
 		 462 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3280  L-serine dehydratase 1  53.93 
 
 		 460 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1304  L-serine dehydratase 1  53.33 
 
 		 476 aa  438  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039374  normal  0.309635 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1196  L-serine ammonia-lyase  54 
 
 		 477 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.741628  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0155  L-serine dehydratase 1  53.12 
 
 		 462 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2603  L-serine dehydratase 1  55.97 
 
 		 473 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0518  L-serine dehydratase 1  55.15 
 
 		 465 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.166535  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2991  L-serine ammonia-lyase  52.59 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3056  L-serine ammonia-lyase  52.59 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.541658  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3251  L-serine ammonia-lyase  53.02 
 
 		 462 aa  435  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2913  L-serine dehydratase 1  52.9 
 
 		 462 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3256  L-serine dehydratase 1  50.77 
 
 		 456 aa  435  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3314  L-serine ammonia-lyase  52.59 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544154  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1546  L-serine ammonia-lyase  52.59 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3931  L-serine ammonia-lyase  52.8 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.706313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>