More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0996 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0996  L-serine dehydratase 1  100 
 
 		 456 aa  909    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0239492  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1803  L-serine dehydratase 1  67.98 
 
 		 456 aa  595  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2194  L-serine dehydratase 1  67.32 
 
 		 452 aa  576  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0871  L-serine dehydratase 1  64.91 
 
 		 448 aa  528  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4265  L-serine ammonia-lyase  59.35 
 
 		 460 aa  521  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  59.09 
 
 		 463 aa  513  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1367  L-serine ammonia-lyase  58.58 
 
 		 466 aa  501  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01684  L-serine ammonia-lyase  56.62 
 
 		 468 aa  500  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.737007  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5008  L-serine dehydratase  58.09 
 
 		 470 aa  498  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.941789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3047  L-serine dehydratase 1  55.1 
 
 		 460 aa  495  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3333  L-serine ammonia-lyase  57.68 
 
 		 458 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3334  L-serine dehydratase 1  56.62 
 
 		 462 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0995  L-serine ammonia-lyase  58.17 
 
 		 490 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0095  L-serine ammonia-lyase  58.01 
 
 		 462 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1863  L-serine ammonia-lyase  58.17 
 
 		 504 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3503  L-serine dehydratase 1  57.52 
 
 		 461 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4831  L-serine ammonia-lyase  57.48 
 
 		 462 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0396  L-serine ammonia-lyase  58.17 
 
 		 545 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0316  L-serine ammonia-lyase  57.14 
 
 		 470 aa  488  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1955  L-serine ammonia-lyase  57.95 
 
 		 504 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0112  L-serine dehydratase 1  57.79 
 
 		 462 aa  490  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3164  L-serine dehydratase 1  57.46 
 
 		 458 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3490  L-serine dehydratase 1  57.46 
 
 		 458 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2892  L-serine dehydratase 1  57.61 
 
 		 458 aa  490  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0423  L-serine dehydratase 1  57.69 
 
 		 470 aa  488  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5070  L-serine dehydratase 1  57.08 
 
 		 461 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3296  L-serine dehydratase  57.46 
 
 		 458 aa  485  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6183  L-serine dehydratase 1  57.95 
 
 		 457 aa  485  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0485  L-serine ammonia-lyase  57.08 
 
 		 461 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5127  L-serine dehydratase 1  57.08 
 
 		 461 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4547  L-serine dehydratase 1  57.08 
 
 		 461 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5152  L-serine dehydratase 1  57.08 
 
 		 461 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0045  L-serine dehydratase  56.64 
 
 		 461 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.388959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3483  L-serine ammonia-lyase  57.24 
 
 		 458 aa  484  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3215  L-serine dehydratase 1  57.08 
 
 		 529 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3015  L-serine dehydratase 1  57.05 
 
 		 462 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16840  L-serine ammonia-lyase  54.49 
 
 		 458 aa  483  1e-135  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128912  normal  0.527215 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3740  L-serine dehydratase 1  58.04 
 
 		 453 aa  478  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.205833 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8589  L-serine dehydratase 1  59.74 
 
 		 458 aa  478  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6246  L-serine dehydratase 1  58.21 
 
 		 455 aa  481  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187309  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4547  L-serine ammonia-lyase  56.71 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1601  L-serine ammonia-lyase  56.8 
 
 		 464 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0116  L-serine dehydratase 1  55.99 
 
 		 460 aa  480  1e-134  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117006  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1962  L-serine ammonia-lyase / 2-hydroxymethylglutarate dehydratase  57.08 
 
 		 457 aa  480  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2603  L-serine dehydratase 1  58.42 
 
 		 473 aa  479  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3884  L-serine dehydratase 1  55.82 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3995  L-serine dehydratase 1  59.35 
 
 		 452 aa  478  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0155  L-serine dehydratase 1  56.18 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2991  L-serine ammonia-lyase  56.62 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0131  L-serine ammonia-lyase  56.83 
 
 		 462 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3056  L-serine ammonia-lyase  56.62 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.541658  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0052  L-serine ammonia-lyase  55.17 
 
 		 462 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4002  L-serine ammonia-lyase  56.62 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1862  L-serine dehydratase 1  56.1 
 
 		 467 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0904594  normal  0.063682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2483  L-serine dehydratase 1  58.95 
 
 		 450 aa  478  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.743605 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5047  L-serine dehydratase 1  55.94 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.533739  normal  0.269496 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3314  L-serine ammonia-lyase  56.62 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544154  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1546  L-serine ammonia-lyase  56.62 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3931  L-serine ammonia-lyase  56.83 
 
 		 462 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.706313  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02760  L-serine ammonia-lyase  56.36 
 
 		 472 aa  472  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26040  L-serine dehydratase  56.21 
 
 		 458 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0329  L-serine dehydratase 1  55.1 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0518  L-serine dehydratase 1  57.3 
 
 		 465 aa  472  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.166535  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0361  L-serine ammonia-lyase  58.48 
 
 		 459 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.739457  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3389  L-serine dehydratase 1  57.83 
 
 		 448 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3251  L-serine ammonia-lyase  56.4 
 
 		 462 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2913  L-serine dehydratase 1  55.97 
 
 		 462 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3700  L-serine ammonia-lyase  55.58 
 
 		 457 aa  473  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0142  L-serine dehydratase 1  55.97 
 
 		 462 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2005  L-serine dehydratase 1  58.48 
 
 		 459 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.233439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0139  L-serine dehydratase 1  55.75 
 
 		 462 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4393  L-serine ammonia-lyase  55.14 
 
 		 458 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0881  L-serine dehydratase 1  59.57 
 
 		 459 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4035  L-serine dehydratase 1  58.7 
 
 		 453 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4369  L-serine ammonia-lyase  53.9 
 
 		 464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0215032  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3591  L-serine dehydratase 1  54.85 
 
 		 475 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2062  L-serine dehydratase 1  55.03 
 
 		 467 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3225  L-serine dehydratase 1  54.55 
 
 		 475 aa  471  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0430  L-serine dehydratase 1  55.79 
 
 		 465 aa  465  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0141  L-serine dehydratase 1  55.75 
 
 		 462 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6540  L-serine dehydratase 1  56.11 
 
 		 459 aa  468  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00743621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3280  L-serine dehydratase 1  54.15 
 
 		 460 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.984034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3321  L-serine ammonia-lyase  55.1 
 
 		 462 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0897  L-serine dehydratase 1  55.51 
 
 		 450 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266509  normal  0.482369 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0129  L-serine dehydratase 1  55.75 
 
 		 462 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1754  L-serine ammonia-lyase  57.64 
 
 		 458 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.244789 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1037  L-serine dehydratase 1  54.72 
 
 		 466 aa  467  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0518  L-serine dehydratase 1  56.18 
 
 		 457 aa  464  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2612  L-serine dehydratase  55.67 
 
 		 467 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0138144  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0992  L-serine dehydratase 1  54.27 
 
 		 458 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0854  hypothetical protein  52.63 
 
 		 458 aa  461  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0082  L-serine ammonia-lyase  54.45 
 
 		 489 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1625  L-serine dehydratase 1  52.49 
 
 		 457 aa  463  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2402  L-serine dehydratase 1  52.17 
 
 		 458 aa  462  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000825911  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0654  L-serine dehydratase 1  57.45 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344045  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4132  L-serine dehydratase 1  56.18 
 
 		 460 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465086  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2808  L-serine dehydratase  55.68 
 
 		 469 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255142  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0819  L-serine dehydratase 1  57.8 
 
 		 452 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101463  normal  0.657436 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1902  L-serine dehydratase  53.49 
 
 		 455 aa  460  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.457679  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0828  hypothetical protein  52.63 
 
 		 458 aa  460  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>