More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0603 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0603  putative glycosyl transferase  100 
 
 
364 aa  722    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.447417  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 
359 aa  138  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
370 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
360 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1307  glycosyltransferase-like protein  22.74 
 
 
357 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.325648  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0216  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
352 aa  93.6  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  31.39 
 
 
368 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0296  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  30.24 
 
 
406 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
439 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  38.66 
 
 
768 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
439 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
439 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0522  hypothetical protein  22.26 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1166  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.27899 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0675  glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  28.49 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 
382 aa  72.8  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  30.92 
 
 
407 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
438 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
438 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 
426 aa  72  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.55 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  22.55 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  22.55 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  22.55 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  34.72 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.55 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.55 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.1 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
438 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  38.64 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
437 aa  69.7  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
437 aa  69.7  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  28.03 
 
 
426 aa  68.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3169  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  28.63 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
384 aa  67  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
377 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 
660 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  21.97 
 
 
375 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6087  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
394 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0801874  hitchhiker  0.00307291 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.57 
 
 
381 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2479  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 
380 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0145757  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 
440 aa  66.6  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.48 
 
 
415 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
394 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
394 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
394 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  30.08 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  22.44 
 
 
381 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  21.03 
 
 
372 aa  65.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.57 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4958  glycosyl transferase group 1  39.39 
 
 
822 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0651584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  38.69 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  24.41 
 
 
374 aa  65.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
361 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 
409 aa  64.3  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 
385 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  22.8 
 
 
378 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
370 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 
357 aa  64.3  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 
419 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
403 aa  63.5  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0545  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
413 aa  63.5  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  35.66 
 
 
385 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
422 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 
393 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  22.94 
 
 
378 aa  63.2  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
409 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 
386 aa  62.8  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 
411 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  24.12 
 
 
379 aa  62.8  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  25.25 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  26.7 
 
 
383 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
409 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 
389 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
405 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
377 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
395 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
421 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>