More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1255 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_1272  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 329 aa  670    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1255  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 329 aa  670    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2416  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 329 aa  670    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571149  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  70.39 
 
 		 329 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1107  Integrase catalytic region  66.67 
 
 		 332 aa  429  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.528266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1813  Integrase catalytic region  66.97 
 
 		 332 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1510  integrase catalytic subunit  57.19 
 
 		 325 aa  361  8e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  53.78 
 
 		 328 aa  345  5e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4313  integrase catalytic subunit  57.14 
 
 		 309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0419733  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  53.47 
 
 		 328 aa  339  4e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  51.34 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  51.34 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  51.5 
 
 		 358 aa  326  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  51.5 
 
 		 358 aa  326  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  51.5 
 
 		 358 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  53.17 
 
 		 481 aa  322  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22790  integrase family protein  53.29 
 
 		 318 aa  318  6e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.582156  normal  0.782085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  48.82 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  48.68 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  48.68 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  48.82 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  48.52 
 
 		 347 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  54.66 
 
 		 422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21500  transposase  44.06 
 
 		 335 aa  239  5e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  43.71 
 
 		 335 aa  236  4e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0287  Integrase catalytic region  44.58 
 
 		 318 aa  236  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1036  Integrase catalytic region  44.58 
 
 		 318 aa  236  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1133  Integrase catalytic region  44.58 
 
 		 318 aa  236  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  43.19 
 
 		 335 aa  235  8e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3793  integrase catalytic subunit  44.11 
 
 		 321 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338369  normal  0.128891 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4011  integrase catalytic subunit  43.81 
 
 		 333 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2591  integrase catalytic subunit  43.81 
 
 		 333 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2546  integrase catalytic subunit  43.81 
 
 		 333 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303835  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3937  integrase catalytic subunit  43.81 
 
 		 333 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3283  Integrase catalytic region  40.77 
 
 		 351 aa  224  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3687  Integrase catalytic region  40.77 
 
 		 351 aa  224  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3720  integrase catalytic subunit  43.81 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158828  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1610  Integrase catalytic region  42.17 
 
 		 335 aa  218  8.999999999999998e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03170  transposase  43.63 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3273  Integrase catalytic region  41.87 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0797  Integrase catalytic region  42.04 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1334  Integrase catalytic region  41.27 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.661987  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1534  integrase catalytic subunit  43.17 
 
 		 341 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1511  integrase catalytic subunit  43.17 
 
 		 341 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  40.99 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  40.99 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  40.99 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  40.99 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  40.99 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23770  integrase family protein  42.47 
 
 		 334 aa  212  9e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0179  integrase catalytic subunit  39.45 
 
 		 315 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1990  integrase catalytic subunit  39.45 
 
 		 315 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1870  integrase catalytic subunit  39.45 
 
 		 315 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3207  integrase catalytic subunit  39.45 
 
 		 315 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3424  integrase catalytic subunit  39.45 
 
 		 315 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2654  integrase catalytic subunit  39.45 
 
 		 315 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  0.067102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0673  integrase catalytic subunit  39.45 
 
 		 315 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3352  integrase catalytic subunit  39.45 
 
 		 315 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3658  integrase catalytic subunit  39.45 
 
 		 315 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  39.45 
 
 		 315 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  39.45 
 
 		 315 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  39.45 
 
 		 315 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2979  integrase catalytic subunit  39.45 
 
 		 315 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161528  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  39.45 
 
 		 315 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3394  integrase catalytic subunit  39.45 
 
 		 315 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0549  integrase catalytic subunit  39.45 
 
 		 315 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0485  integrase catalytic subunit  39.45 
 
 		 315 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2137  integrase catalytic subunit  39.45 
 
 		 315 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2560  integrase catalytic subunit  39.45 
 
 		 315 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278482  decreased coverage  0.00231503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  39.01 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  39.01 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  38.7 
 
 		 316 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  38.7 
 
 		 316 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  38.7 
 
 		 316 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  38.7 
 
 		 316 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11870  transposase  40.57 
 
 		 365 aa  196  6e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0513  ISBm3, transposase, programmed frameshift  37.3 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0754  integrase catalytic subunit  36.96 
 
 		 315 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5281  histidine kinase  79.78 
 
 		 151 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.263883  normal  0.386303 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5727  histidine kinase  79.78 
 
 		 151 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.21896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18440  hypothetical protein  48.78 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0765744  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1219  Integrase catalytic region  27.66 
 
 		 378 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  27.66 
 
 		 378 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1705  Integrase catalytic region  27.66 
 
 		 378 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1303  Integrase catalytic region  27.66 
 
 		 378 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1347  Integrase catalytic region  27.66 
 
 		 378 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.519975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  27.66 
 
 		 378 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1220  Integrase catalytic region  27.66 
 
 		 378 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  27.66 
 
 		 378 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0433  Integrase catalytic region  27.66 
 
 		 378 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.705419  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0489  transposase  33.01 
 
 		 195 aa  92.4  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4342  Integrase catalytic region  29.94 
 
 		 389 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0598  Integrase catalytic region  29.94 
 
 		 389 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4748  Integrase catalytic region  29.94 
 
 		 389 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4336  Integrase catalytic region  29.94 
 
 		 389 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0872722  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  30.15 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0934  hypothetical protein  36.96 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0345872 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2180  integrase catalytic region  30.06 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0943007  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0490  transposase  48.31 
 
 		 99 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0956  hypothetical protein  36.96 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>