More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4011 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1511  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 341 aa  661    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2546  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 333 aa  687    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303835  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3720  integrase catalytic subunit  99.7 
 
 		 333 aa  684    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158828  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3937  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 333 aa  687    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1534  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 341 aa  661    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2591  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 333 aa  687    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3793  integrase catalytic subunit  99.38 
 
 		 321 aa  658    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338369  normal  0.128891 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4011  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 333 aa  687    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  47.08 
 
 		 347 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  46.91 
 
 		 330 aa  258  9e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3283  Integrase catalytic region  45.87 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3687  Integrase catalytic region  45.87 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  46.3 
 
 		 330 aa  253  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  46.3 
 
 		 330 aa  253  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  46.3 
 
 		 330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3273  Integrase catalytic region  46.2 
 
 		 335 aa  251  9.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1610  Integrase catalytic region  46.2 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1334  Integrase catalytic region  46.2 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.661987  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0797  Integrase catalytic region  45.29 
 
 		 335 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1510  integrase catalytic subunit  47.17 
 
 		 325 aa  242  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  42.77 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  42.77 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  42.77 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  42.77 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  42.77 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  46.34 
 
 		 335 aa  236  4e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21500  transposase  46.65 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0287  Integrase catalytic region  45.74 
 
 		 318 aa  232  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1036  Integrase catalytic region  45.74 
 
 		 318 aa  232  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1133  Integrase catalytic region  45.74 
 
 		 318 aa  232  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4313  integrase catalytic subunit  46.73 
 
 		 309 aa  229  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0419733  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03170  transposase  46.65 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1813  Integrase catalytic region  43.03 
 
 		 332 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  45.12 
 
 		 335 aa  227  3e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  42.42 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1107  Integrase catalytic region  43.03 
 
 		 332 aa  226  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.528266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1255  integrase catalytic subunit  43.81 
 
 		 329 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2416  integrase catalytic subunit  43.81 
 
 		 329 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1272  integrase catalytic subunit  43.81 
 
 		 329 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  45.29 
 
 		 329 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  41.72 
 
 		 481 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  41.52 
 
 		 328 aa  219  6e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23770  integrase family protein  43.94 
 
 		 334 aa  215  7e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22790  integrase family protein  41.03 
 
 		 318 aa  212  7e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.582156  normal  0.782085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0179  integrase catalytic subunit  42.06 
 
 		 315 aa  211  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0485  integrase catalytic subunit  42.06 
 
 		 315 aa  211  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0549  integrase catalytic subunit  42.06 
 
 		 315 aa  211  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0673  integrase catalytic subunit  42.06 
 
 		 315 aa  212  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1870  integrase catalytic subunit  42.06 
 
 		 315 aa  212  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1990  integrase catalytic subunit  42.06 
 
 		 315 aa  212  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2137  integrase catalytic subunit  42.06 
 
 		 315 aa  212  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2560  integrase catalytic subunit  42.06 
 
 		 315 aa  212  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278482  decreased coverage  0.00231503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2654  integrase catalytic subunit  42.06 
 
 		 315 aa  212  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  0.067102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2979  integrase catalytic subunit  42.06 
 
 		 315 aa  212  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161528  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3207  integrase catalytic subunit  42.06 
 
 		 315 aa  211  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3394  integrase catalytic subunit  42.06 
 
 		 315 aa  211  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3658  integrase catalytic subunit  42.06 
 
 		 315 aa  212  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  42.06 
 
 		 315 aa  211  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  42.06 
 
 		 315 aa  211  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  42.06 
 
 		 315 aa  211  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  42.06 
 
 		 315 aa  211  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3352  integrase catalytic subunit  42.06 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3424  integrase catalytic subunit  42.06 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11870  transposase  39.3 
 
 		 365 aa  189  5e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  38.68 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  38.01 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  38.68 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  38.01 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  38.01 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  38.68 
 
 		 316 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  38.68 
 
 		 316 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  38.01 
 
 		 314 aa  187  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  38.01 
 
 		 314 aa  187  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  38.68 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  38.05 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_004310  BR0513  ISBm3, transposase, programmed frameshift  37.97 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  42.32 
 
 		 422 aa  177  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0754  integrase catalytic subunit  37.69 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0489  transposase  38.12 
 
 		 195 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3594  transposase  31.68 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0294035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5108  transposase  31.68 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2890  transposase  31.68 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0319653  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5697  transposase  31.68 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0789  transposase  32.17 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7219  transposase  32.17 
 
 		 369 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2923  transposase  31.37 
 
 		 377 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5614  putative transposase  37.65 
 
 		 208 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  28.7 
 
 		 597 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2180  integrase catalytic region  30.56 
 
 		 400 aa  92.8  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0943007  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  28.12 
 
 		 381 aa  92.8  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  28.12 
 
 		 381 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  28.12 
 
 		 381 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  28.12 
 
 		 381 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  28.12 
 
 		 381 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  28.12 
 
 		 381 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  28.12 
 
 		 381 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  28.95 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  29 
 
 		 607 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  29.21 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0433  Integrase catalytic region  29.21 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.705419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>