More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0754 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0754  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 315 aa  645    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  51.12 
 
 		 314 aa  293  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  51.12 
 
 		 314 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  51.12 
 
 		 314 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  51.12 
 
 		 314 aa  293  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  51.12 
 
 		 314 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3352  integrase catalytic subunit  51.43 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2137  integrase catalytic subunit  51.43 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0549  integrase catalytic subunit  51.43 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2560  integrase catalytic subunit  51.43 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278482  decreased coverage  0.00231503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3394  integrase catalytic subunit  51.43 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1990  integrase catalytic subunit  51.43 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1870  integrase catalytic subunit  51.43 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0673  integrase catalytic subunit  51.43 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2654  integrase catalytic subunit  51.43 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  0.067102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2979  integrase catalytic subunit  51.43 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161528  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3207  integrase catalytic subunit  51.43 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3658  integrase catalytic subunit  51.43 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0179  integrase catalytic subunit  51.43 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  51.43 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3424  integrase catalytic subunit  51.43 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  51.43 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  51.43 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0485  integrase catalytic subunit  51.43 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  51.43 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_004310  BR0513  ISBm3, transposase, programmed frameshift  45.45 
 
 		 313 aa  265  8e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  46.37 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  46.65 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  46.37 
 
 		 316 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  46.65 
 
 		 316 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  46.65 
 
 		 316 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  46.37 
 
 		 316 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1036  Integrase catalytic region  43.44 
 
 		 318 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1133  Integrase catalytic region  43.44 
 
 		 318 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0287  Integrase catalytic region  43.44 
 
 		 318 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  40.13 
 
 		 329 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  37.85 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  37.85 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  37.85 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  37.85 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  37.85 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1813  Integrase catalytic region  40.06 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1107  Integrase catalytic region  40.06 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.528266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  38.87 
 
 		 481 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1510  integrase catalytic subunit  39.76 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4313  integrase catalytic subunit  40.66 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0419733  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1255  integrase catalytic subunit  36.96 
 
 		 329 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2416  integrase catalytic subunit  36.96 
 
 		 329 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1272  integrase catalytic subunit  36.96 
 
 		 329 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22790  integrase family protein  39.67 
 
 		 318 aa  177  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.582156  normal  0.782085 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  35.62 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  38.68 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  38.68 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  38.68 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  38.68 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  38.68 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2546  integrase catalytic subunit  37.69 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303835  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3937  integrase catalytic subunit  37.69 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2591  integrase catalytic subunit  37.69 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4011  integrase catalytic subunit  37.69 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3793  integrase catalytic subunit  37.38 
 
 		 321 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338369  normal  0.128891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3720  integrase catalytic subunit  37.38 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158828  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3687  Integrase catalytic region  37.39 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3283  Integrase catalytic region  37.39 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1511  integrase catalytic subunit  37.3 
 
 		 341 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1534  integrase catalytic subunit  37.3 
 
 		 341 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0797  Integrase catalytic region  36.17 
 
 		 335 aa  169  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  34.78 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1334  Integrase catalytic region  35.56 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.661987  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1610  Integrase catalytic region  35.56 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3273  Integrase catalytic region  35.44 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  34.33 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  38.93 
 
 		 422 aa  156  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  33.73 
 
 		 335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21500  transposase  34.03 
 
 		 335 aa  155  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03170  transposase  34.09 
 
 		 320 aa  146  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23770  integrase family protein  33.63 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0489  transposase  40.93 
 
 		 195 aa  143  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11870  transposase  32.59 
 
 		 365 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0490  transposase  53.4 
 
 		 99 aa  113  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  35.79 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  31.62 
 
 		 381 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  31.27 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5614  putative transposase  39.02 
 
 		 208 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  31.27 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  31.27 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  31.27 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  31.27 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  31.27 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  29.93 
 
 		 597 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  36.43 
 
 		 274 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  31.65 
 
 		 380 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2923  transposase  32.28 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5108  transposase  32.28 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0789  transposase  32.28 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3594  transposase  32.28 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0294035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5697  transposase  32.28 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2890  transposase  32.28 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0319653  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7219  transposase  32.28 
 
 		 369 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  30.51 
 
 		 607 aa  86.7  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>