More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0513 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0513  ISBm3, transposase, programmed frameshift  100 
 
 
313 aa  645    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0489  transposase  100 
 
 
195 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  50.94 
 
 
314 aa  309  5e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  50.94 
 
 
314 aa  309  5e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  50.94 
 
 
314 aa  309  5e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  50.63 
 
 
314 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  50.63 
 
 
314 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  51.26 
 
 
316 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  51.26 
 
 
316 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  51.1 
 
 
316 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  50.63 
 
 
316 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  50.63 
 
 
316 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  50.63 
 
 
316 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  51.26 
 
 
315 aa  291  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0179  integrase catalytic subunit  51.26 
 
 
315 aa  291  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0549  integrase catalytic subunit  51.26 
 
 
315 aa  291  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  51.26 
 
 
315 aa  291  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3207  integrase catalytic subunit  51.26 
 
 
315 aa  291  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249137  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3394  integrase catalytic subunit  51.26 
 
 
315 aa  291  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  51.26 
 
 
315 aa  291  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0485  integrase catalytic subunit  51.26 
 
 
315 aa  291  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  51.26 
 
 
315 aa  291  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2137  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 
315 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1990  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 
315 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2654  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 
315 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  0.067102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2560  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 
315 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278482  decreased coverage  0.00231503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3658  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 
315 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2979  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 
315 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161528  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1870  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 
315 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0673  integrase catalytic subunit  50.94 
 
 
315 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3352  integrase catalytic subunit  51.1 
 
 
315 aa  290  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3424  integrase catalytic subunit  51.1 
 
 
315 aa  290  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1036  Integrase catalytic region  45.28 
 
 
318 aa  266  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1133  Integrase catalytic region  45.28 
 
 
318 aa  266  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0287  Integrase catalytic region  45.28 
 
 
318 aa  266  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0754  integrase catalytic subunit  45.45 
 
 
315 aa  258  8e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  41.23 
 
 
358 aa  222  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  41.23 
 
 
358 aa  222  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  40.62 
 
 
358 aa  222  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  41.23 
 
 
358 aa  222  8e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  41.23 
 
 
358 aa  222  8e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1510  integrase catalytic subunit  42.19 
 
 
325 aa  219  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  40 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0490  transposase  98.99 
 
 
99 aa  212  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1107  Integrase catalytic region  40.81 
 
 
332 aa  208  9e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.528266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1813  Integrase catalytic region  40.81 
 
 
332 aa  208  9e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  39.38 
 
 
329 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  39.25 
 
 
328 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  39.57 
 
 
481 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4313  integrase catalytic subunit  42.05 
 
 
309 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0419733  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22790  integrase family protein  41.75 
 
 
318 aa  199  6e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.582156  normal  0.782085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  39.82 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  40.06 
 
 
330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  39.75 
 
 
330 aa  193  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  39.75 
 
 
330 aa  193  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  39.75 
 
 
330 aa  193  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1255  integrase catalytic subunit  37.3 
 
 
329 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2416  integrase catalytic subunit  37.3 
 
 
329 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1272  integrase catalytic subunit  37.3 
 
 
329 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2591  integrase catalytic subunit  37.97 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4011  integrase catalytic subunit  37.97 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141418  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2546  integrase catalytic subunit  37.97 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303835  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3937  integrase catalytic subunit  37.97 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3720  integrase catalytic subunit  37.97 
 
 
333 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3793  integrase catalytic subunit  37.97 
 
 
321 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338369  normal  0.128891 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1534  integrase catalytic subunit  37.26 
 
 
341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1511  integrase catalytic subunit  37.26 
 
 
341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  35.74 
 
 
335 aa  171  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21500  transposase  35.44 
 
 
335 aa  169  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  41.56 
 
 
422 aa  168  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  34.83 
 
 
335 aa  167  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3687  Integrase catalytic region  35.91 
 
 
351 aa  162  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3283  Integrase catalytic region  35.91 
 
 
351 aa  162  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03170  transposase  36.04 
 
 
320 aa  162  7e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1334  Integrase catalytic region  35.44 
 
 
335 aa  159  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.661987  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0797  Integrase catalytic region  35.74 
 
 
335 aa  159  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3273  Integrase catalytic region  35.42 
 
 
335 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1610  Integrase catalytic region  35.44 
 
 
335 aa  156  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11870  transposase  33.33 
 
 
365 aa  146  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23770  integrase family protein  34.34 
 
 
334 aa  140  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5614  putative transposase  44.79 
 
 
208 aa  123  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.147736 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0395  hypothetical protein  35.57 
 
 
191 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  31.23 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  26.51 
 
 
323 aa  84  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  30.77 
 
 
343 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  30.77 
 
 
332 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  25.8 
 
 
381 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  25.8 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  25.8 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  25.8 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  25.8 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  25.8 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  25.8 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4857  integrase catalytic subunit  25.9 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3309  integrase catalytic subunit  25.9 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5758  integrase catalytic subunit  25.9 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0647167 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  25.84 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  26.2 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  29.51 
 
 
597 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0341  putative transposase  25.95 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>