More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23770 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_23770  integrase family protein  100 
 
 		 334 aa  682    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3273  Integrase catalytic region  63.33 
 
 		 335 aa  411  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3283  Integrase catalytic region  63.33 
 
 		 351 aa  412  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1610  Integrase catalytic region  62.99 
 
 		 335 aa  412  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3687  Integrase catalytic region  63.33 
 
 		 351 aa  412  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1334  Integrase catalytic region  63.03 
 
 		 335 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.661987  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0797  Integrase catalytic region  62.09 
 
 		 335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  56.51 
 
 		 335 aa  352  2.9999999999999997e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21500  transposase  55.62 
 
 		 335 aa  350  3e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  55.62 
 
 		 335 aa  346  3e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11870  transposase  58.31 
 
 		 365 aa  339  5e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03170  transposase  55.59 
 
 		 320 aa  326  3e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  49.4 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  49.4 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  49.4 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  49.4 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  49.1 
 
 		 347 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2546  integrase catalytic subunit  43.94 
 
 		 333 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303835  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3937  integrase catalytic subunit  43.94 
 
 		 333 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2591  integrase catalytic subunit  43.94 
 
 		 333 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4011  integrase catalytic subunit  43.94 
 
 		 333 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3793  integrase catalytic subunit  43.94 
 
 		 321 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338369  normal  0.128891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  43.35 
 
 		 329 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3720  integrase catalytic subunit  43.64 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158828  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1255  integrase catalytic subunit  42.47 
 
 		 329 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2416  integrase catalytic subunit  42.47 
 
 		 329 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1272  integrase catalytic subunit  42.47 
 
 		 329 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1510  integrase catalytic subunit  43.43 
 
 		 325 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1511  integrase catalytic subunit  43.26 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1534  integrase catalytic subunit  43.26 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4313  integrase catalytic subunit  43.22 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0419733  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1107  Integrase catalytic region  40.35 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.528266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1813  Integrase catalytic region  40.61 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1133  Integrase catalytic region  41.84 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0287  Integrase catalytic region  41.84 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1036  Integrase catalytic region  41.84 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  36.87 
 
 		 358 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  36.87 
 
 		 358 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  36.87 
 
 		 358 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  36.87 
 
 		 358 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  36.87 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  36.2 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  37.87 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  36.2 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  36.2 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  36.2 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  36.2 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  37.57 
 
 		 328 aa  179  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  37.84 
 
 		 481 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22790  integrase family protein  37.3 
 
 		 318 aa  165  9e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.582156  normal  0.782085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3394  integrase catalytic subunit  34.85 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  34.85 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  34.85 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3658  integrase catalytic subunit  34.85 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3424  integrase catalytic subunit  34.85 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  34.85 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  34.85 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3352  integrase catalytic subunit  34.85 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2979  integrase catalytic subunit  34.85 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161528  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3207  integrase catalytic subunit  34.85 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2654  integrase catalytic subunit  34.85 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  0.067102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0179  integrase catalytic subunit  34.85 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0485  integrase catalytic subunit  34.85 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0549  integrase catalytic subunit  34.85 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0673  integrase catalytic subunit  34.85 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1870  integrase catalytic subunit  34.85 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1990  integrase catalytic subunit  34.85 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2137  integrase catalytic subunit  34.85 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2560  integrase catalytic subunit  34.85 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278482  decreased coverage  0.00231503 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  43.56 
 
 		 422 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_004310  BR0513  ISBm3, transposase, programmed frameshift  34.34 
 
 		 313 aa  149  9e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  34.14 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  34.14 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  33.84 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  33.84 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  33.84 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0754  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 315 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  31.64 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  28.79 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  28.85 
 
 		 597 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  29.06 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  29.06 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  26.5 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0489  transposase  30.6 
 
 		 195 aa  75.1  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0538  Integrase catalytic region  25.77 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.189416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1950  Integrase catalytic region  25.77 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0529  Integrase catalytic region  25.5 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.247566  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0490  transposase  39.18 
 
 		 99 aa  73.9  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  27.01 
 
 		 380 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  28.08 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1303  Integrase catalytic region  25.63 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1220  Integrase catalytic region  25.63 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2923  transposase  25.67 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5281  histidine kinase  44.87 
 
 		 151 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.263883  normal  0.386303 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1705  Integrase catalytic region  25.63 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  25.63 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4098  Integrase catalytic region  29.13 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  25.63 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  25.63 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5727  histidine kinase  44.87 
 
 		 151 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.21896  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>