More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_22790 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_22790  integrase family protein  100 
 
 		 318 aa  647    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.582156  normal  0.782085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  71.29 
 
 		 481 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  68.94 
 
 		 358 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  68.94 
 
 		 358 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  68.85 
 
 		 358 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  68.85 
 
 		 358 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  68.85 
 
 		 358 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  60.38 
 
 		 328 aa  386  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  57.55 
 
 		 328 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1107  Integrase catalytic region  54.09 
 
 		 332 aa  345  8e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.528266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1813  Integrase catalytic region  54.26 
 
 		 332 aa  344  8.999999999999999e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  54.09 
 
 		 329 aa  328  9e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1255  integrase catalytic subunit  53.29 
 
 		 329 aa  318  5e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2416  integrase catalytic subunit  53.29 
 
 		 329 aa  318  5e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1272  integrase catalytic subunit  53.29 
 
 		 329 aa  318  5e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  62.4 
 
 		 422 aa  308  6.999999999999999e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1510  integrase catalytic subunit  50.46 
 
 		 325 aa  300  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4313  integrase catalytic subunit  50.83 
 
 		 309 aa  285  9e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0419733  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1133  Integrase catalytic region  45.69 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0287  Integrase catalytic region  45.69 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1036  Integrase catalytic region  45.69 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  46.44 
 
 		 330 aa  229  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  46.44 
 
 		 347 aa  229  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  46.44 
 
 		 330 aa  229  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  46.44 
 
 		 330 aa  228  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  46.13 
 
 		 330 aa  228  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  45.23 
 
 		 316 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  45.06 
 
 		 316 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  45.06 
 
 		 316 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  45.06 
 
 		 316 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  44.75 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2137  integrase catalytic subunit  43.49 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0485  integrase catalytic subunit  43.49 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3352  integrase catalytic subunit  43.12 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2654  integrase catalytic subunit  43.49 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  0.067102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3394  integrase catalytic subunit  43.49 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  43.49 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  43.49 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  43.49 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  43.49 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0179  integrase catalytic subunit  43.49 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3207  integrase catalytic subunit  43.49 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0549  integrase catalytic subunit  43.49 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1870  integrase catalytic subunit  43.49 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2979  integrase catalytic subunit  43.49 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161528  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1990  integrase catalytic subunit  43.49 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0673  integrase catalytic subunit  43.49 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3424  integrase catalytic subunit  43.12 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3658  integrase catalytic subunit  43.49 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2560  integrase catalytic subunit  43.49 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278482  decreased coverage  0.00231503 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  44.75 
 
 		 316 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2546  integrase catalytic subunit  41.03 
 
 		 333 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303835  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3937  integrase catalytic subunit  41.03 
 
 		 333 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2591  integrase catalytic subunit  41.03 
 
 		 333 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4011  integrase catalytic subunit  41.03 
 
 		 333 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3720  integrase catalytic subunit  41.03 
 
 		 333 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3793  integrase catalytic subunit  41.03 
 
 		 321 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338369  normal  0.128891 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  41.19 
 
 		 314 aa  209  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  41.19 
 
 		 314 aa  209  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  41.19 
 
 		 314 aa  209  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  41.19 
 
 		 314 aa  209  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  41.19 
 
 		 314 aa  209  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1511  integrase catalytic subunit  40.4 
 
 		 341 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1534  integrase catalytic subunit  40.4 
 
 		 341 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  40.66 
 
 		 335 aa  202  8e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21500  transposase  40.06 
 
 		 335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0513  ISBm3, transposase, programmed frameshift  41.75 
 
 		 313 aa  199  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03170  transposase  40.92 
 
 		 320 aa  199  7e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  39.46 
 
 		 335 aa  196  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18440  hypothetical protein  78.63 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0765744  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3687  Integrase catalytic region  38.59 
 
 		 351 aa  189  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3283  Integrase catalytic region  38.59 
 
 		 351 aa  189  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3273  Integrase catalytic region  38.91 
 
 		 335 aa  186  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1610  Integrase catalytic region  38.91 
 
 		 335 aa  186  6e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1334  Integrase catalytic region  37.89 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.661987  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0797  Integrase catalytic region  38.91 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0754  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11870  transposase  37.79 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23770  integrase family protein  37.3 
 
 		 334 aa  155  8e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1219  Integrase catalytic region  31 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1303  Integrase catalytic region  31 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1705  Integrase catalytic region  31 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0433  Integrase catalytic region  31 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.705419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  31 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1220  Integrase catalytic region  31 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  31 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1347  Integrase catalytic region  31 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.519975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  31 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7250  Integrase catalytic region  33.13 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1525  Integrase catalytic region  33.13 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0129  Integrase catalytic region  33.13 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162314  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0489  transposase  36.81 
 
 		 195 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  29.41 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.41 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.41 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.41 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.41 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.41 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  29.41 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5727  histidine kinase  59.72 
 
 		 151 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.21896  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>